Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X9T2

Protein Details
Accession L8X9T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-92LDSGPKKKKKGPSGSDRLDCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-83PKKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044641  Lsm7/SmG-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR034098  Sm_G  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01719  Sm_G  
Amino Acid Sequences MSKASQPELKKFMDKRLFIHLQGGRKISGVLRGFDIFLNLVVDDAVEETVPAEKHPIGQVETASPRWKHSNLLDSGPKKKKKGPSGSDRLDCINFTSMFEADDTNKSCLAITYPRTPRVHTRPSGRSQASGLGPLQAGVTLTQTMSHSIFPPNTGPKLPPDFSSLVIQGPYPPSAPIHLCLSHLQSGPKSNKAVLISSSSKHLSSQLEEYSDLWLHEHAMSGAIAEHLHQTDILYVDALTLPSSSGPIDPMYQLSTNAQTPPSTLGATPSILHPILQSRYKGMRIPSPDAFSPARTVGVLFSRRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.58
4 0.58
5 0.5
6 0.55
7 0.49
8 0.47
9 0.5
10 0.49
11 0.4
12 0.35
13 0.36
14 0.28
15 0.32
16 0.28
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.24
22 0.24
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.09
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.04
34 0.04
35 0.05
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.11
40 0.11
41 0.13
42 0.16
43 0.19
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.25
49 0.25
50 0.29
51 0.27
52 0.28
53 0.33
54 0.33
55 0.33
56 0.35
57 0.41
58 0.38
59 0.43
60 0.48
61 0.47
62 0.56
63 0.61
64 0.62
65 0.57
66 0.62
67 0.65
68 0.67
69 0.72
70 0.72
71 0.73
72 0.77
73 0.81
74 0.76
75 0.69
76 0.61
77 0.51
78 0.42
79 0.33
80 0.27
81 0.19
82 0.17
83 0.17
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.25
100 0.3
101 0.37
102 0.38
103 0.4
104 0.46
105 0.49
106 0.53
107 0.5
108 0.54
109 0.54
110 0.58
111 0.64
112 0.56
113 0.49
114 0.42
115 0.41
116 0.33
117 0.28
118 0.23
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.24
151 0.2
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.18
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.25
174 0.26
175 0.29
176 0.27
177 0.24
178 0.26
179 0.26
180 0.26
181 0.2
182 0.23
183 0.21
184 0.2
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.21
190 0.17
191 0.17
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.18
243 0.18
244 0.19
245 0.19
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.19
250 0.17
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.15
257 0.18
258 0.16
259 0.17
260 0.15
261 0.19
262 0.24
263 0.28
264 0.28
265 0.3
266 0.35
267 0.38
268 0.41
269 0.4
270 0.42
271 0.44
272 0.5
273 0.49
274 0.49
275 0.47
276 0.48
277 0.45
278 0.39
279 0.36
280 0.3
281 0.26
282 0.21
283 0.2
284 0.19
285 0.25
286 0.31