Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WYB9

Protein Details
Accession L8WYB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-272VWALAMKRPKIKKKEIESGLHydrophilic
298-317LGKLQTRKMRGLKRARGDDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-277KRPKIKKKEIESGLGKKRK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 10, mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTIKPKNAASKRALEARAPKEIEDEKTVIFVKGTHVGERVTGAMKDLMALKRPHAIAFNKKNQIRPFEDTASLDFWANKNDAAMFAIGQSTKKRPDGLTLVRMYDGSVLDMCELGVVGYQPMSSFPGPKSTPGHRPLVHFASDLFDTHPRYIQLRSLLLDLFGGSQIDAIHLAGIEHIICVSTAPAPPSLVSSTSQAQTGGTPAELPVVHIRTYTTRLLASGVRVPRVELTPMGPSLDVVLRRHQEADPAVWALAMKRPKIKKKEIESGLGKKRKNIEVDDMGDMRGRIHVARQDLGKLQTRKMRGLKRARGDDASEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.64
3 0.6
4 0.6
5 0.57
6 0.6
7 0.53
8 0.48
9 0.46
10 0.48
11 0.45
12 0.41
13 0.38
14 0.29
15 0.31
16 0.32
17 0.26
18 0.22
19 0.18
20 0.16
21 0.22
22 0.24
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.16
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.17
36 0.18
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.27
41 0.28
42 0.28
43 0.29
44 0.34
45 0.39
46 0.48
47 0.56
48 0.59
49 0.61
50 0.67
51 0.66
52 0.67
53 0.63
54 0.6
55 0.56
56 0.51
57 0.5
58 0.44
59 0.41
60 0.35
61 0.29
62 0.24
63 0.19
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.22
82 0.25
83 0.24
84 0.29
85 0.36
86 0.39
87 0.42
88 0.39
89 0.38
90 0.35
91 0.35
92 0.29
93 0.22
94 0.17
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.05
102 0.05
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.07
112 0.07
113 0.1
114 0.1
115 0.17
116 0.17
117 0.21
118 0.25
119 0.26
120 0.34
121 0.36
122 0.42
123 0.37
124 0.4
125 0.42
126 0.4
127 0.37
128 0.29
129 0.25
130 0.2
131 0.19
132 0.16
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.19
203 0.19
204 0.16
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.2
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.16
228 0.15
229 0.21
230 0.22
231 0.23
232 0.26
233 0.24
234 0.26
235 0.25
236 0.25
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.17
241 0.17
242 0.13
243 0.16
244 0.18
245 0.19
246 0.27
247 0.36
248 0.45
249 0.55
250 0.64
251 0.68
252 0.73
253 0.8
254 0.77
255 0.77
256 0.76
257 0.76
258 0.76
259 0.74
260 0.66
261 0.61
262 0.64
263 0.61
264 0.59
265 0.54
266 0.52
267 0.52
268 0.55
269 0.54
270 0.47
271 0.41
272 0.37
273 0.32
274 0.24
275 0.18
276 0.15
277 0.11
278 0.15
279 0.2
280 0.22
281 0.26
282 0.28
283 0.3
284 0.33
285 0.38
286 0.42
287 0.41
288 0.43
289 0.47
290 0.49
291 0.54
292 0.59
293 0.63
294 0.64
295 0.72
296 0.75
297 0.78
298 0.83
299 0.79
300 0.75
301 0.69
302 0.64