Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X5T0

Protein Details
Accession L8X5T0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-53SNPHPNSQPTHPPPPRRTRHSIAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR040178  RNF220_RING  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16563  RING-HC_RNF220  
Amino Acid Sequences MMASYEHTNRRPAAVRARASLTALAPTRRYSNPHPNSQPTHPPPPRRTRHSIAMGPESMVERRQRRVGGVCPVCEDDVPEGLEEHVDRCLQDAVLPHRDREREHVATPPTQNEPGPEEQELVRATDFTDFRGTGYDIRDRNIPDVDEELDVDGDEDTVLYGESQFFESDIIAGNEAESDSRQMSPADADEPSARLLRELVAARKMVLTQRDVDIEGEEEDERVSIGSSADASMTWPPAPTADGKDVQIEESALEQARSQPTALLKGRTSEGTNDTAPTVCRICLDPFMEPVVSTGCWHLFCRECWLRSLGSTKYCPICKRITSTSNLRKVFMWNHWNQPRWAAPKSTPIGIGELTSLHMISKWLGFTLAMNSGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.54
3 0.53
4 0.57
5 0.52
6 0.49
7 0.44
8 0.35
9 0.32
10 0.32
11 0.3
12 0.28
13 0.29
14 0.32
15 0.32
16 0.38
17 0.4
18 0.48
19 0.52
20 0.61
21 0.66
22 0.69
23 0.72
24 0.73
25 0.75
26 0.7
27 0.74
28 0.72
29 0.74
30 0.75
31 0.8
32 0.83
33 0.8
34 0.82
35 0.78
36 0.79
37 0.78
38 0.73
39 0.68
40 0.65
41 0.57
42 0.49
43 0.43
44 0.36
45 0.28
46 0.27
47 0.29
48 0.27
49 0.31
50 0.36
51 0.36
52 0.39
53 0.43
54 0.45
55 0.48
56 0.48
57 0.44
58 0.42
59 0.42
60 0.38
61 0.32
62 0.28
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.16
80 0.2
81 0.3
82 0.31
83 0.31
84 0.35
85 0.37
86 0.37
87 0.39
88 0.41
89 0.35
90 0.36
91 0.41
92 0.39
93 0.42
94 0.42
95 0.38
96 0.33
97 0.31
98 0.3
99 0.26
100 0.27
101 0.25
102 0.25
103 0.23
104 0.21
105 0.19
106 0.22
107 0.2
108 0.17
109 0.13
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.15
121 0.17
122 0.22
123 0.2
124 0.21
125 0.25
126 0.23
127 0.25
128 0.24
129 0.21
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.12
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.16
235 0.13
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.11
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.22
249 0.25
250 0.24
251 0.23
252 0.25
253 0.26
254 0.25
255 0.26
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.21
261 0.2
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.15
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.15
270 0.19
271 0.21
272 0.19
273 0.19
274 0.21
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.14
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.29
289 0.34
290 0.33
291 0.35
292 0.36
293 0.33
294 0.33
295 0.37
296 0.32
297 0.31
298 0.33
299 0.35
300 0.39
301 0.44
302 0.44
303 0.44
304 0.47
305 0.45
306 0.5
307 0.53
308 0.52
309 0.53
310 0.61
311 0.66
312 0.68
313 0.65
314 0.6
315 0.52
316 0.53
317 0.52
318 0.5
319 0.5
320 0.46
321 0.55
322 0.61
323 0.63
324 0.58
325 0.59
326 0.58
327 0.55
328 0.54
329 0.49
330 0.44
331 0.5
332 0.53
333 0.49
334 0.43
335 0.37
336 0.36
337 0.3
338 0.28
339 0.18
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.18