FuNGI

L8X0D5

Protein Details

Accession

L8X0D5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-114	KSPPGDTPSKTDKRKNKKLKKAETKAQNDKPPS	Hydrophilic
232-252	ISSEQKRKRLLERQQQKFSND	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
60-64	KRKPS
81-111	LKSPPGDTPSKTDKRKNKKLKKAETKAQNDK
124-124	K

Subcellular Location(s)

cyto 15, cyto_mito 10.833, cyto_nucl 10.333, mito 5.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001514 DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS IPR011262 DNA-dir_RNA_pol_insert IPR011263 DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3 IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR036603 RBP11-like IPR034922 REX1-like_exo IPR022842 RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1 IPR033901 RNAPI/III_AC40 IPR036643 RNApol_insert_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0055029 C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0001054 F:RNA polymerase I activity GO:0001056 F:RNA polymerase III activity
Pfam	View protein in Pfam PF01000 RNA_pol_A_bac PF01193 RNA_pol_L
PROSITE	View protein in PROSITE PS00446 RNA_POL_D_30KD
CDD	cd06145 REX1_like cd07032 RNAP_I_II_AC40

Amino Acid Sequences

MTEVVQGEMGRRTNRAGRAVDVFFVSTICNLEAREQVQASRMTTESLPNFGVELTASSRKRKPSPPSLSSPPSPSAPSAPLKSPPGDTPSKTDKRKNKKLKKAETKAQNDKPPSLSFAGGELRKRKGPISVEEVRDVFLHLFGDGAPTKFLVIENPRSILRAVLLLVPGISPEAVGAVDPPYGSAYPIAIGATGASKIPSINSCYSHACPTRATGELTKMHSVLTTLLQSPISSEQKRKRLLERQQQKFSNDDPSMYLLDTPDMLDNGYPVPSYLGEGLSANPESVRATSSWPVAAPTPQTRENGWVETPQTTRDGALKAVYPQQCETEDGKVLARVCAVDFYSDKVVYDQLVLPDKPVIDYLTQYVPDANQTCPNVFAHPPVSFRFSGITAEQLASVTHKLPDAQAGLLELIDKDTIIIGHSLENDLRALKLAHPRCIDTSIIYKHPRGAPYKPGLKWLAQKWLNLDIQMKQGGHDPEEDARACLALLAKKLKEDVESIFERLSKSNGRHGKGSTSAVIDHGNPRAWHGAKATSAVSCQTDDQVVTGVIDAARNHDFVFGRLLELSQALGWTTPRTQPNASASPAPTPTPTEPDPSTLESAYADLNSRITTIHKSLPAGTVLCIMSGNGDPRQMSALNMKKSRWDGMMREGKRPEDIPQAEWWTMEQGRLLEDATERAKRGLAFFCLVCTPERTILGISISSKRRVTTAHKYCSNLPHFQRLHVEVRGADDEAVDFDLVGVDASIANAFRRILIAEVPTVAIENVYIWNNTSVIQDEVLAHRLGLVPIRADPALLDFPDSAVGPTDRNTLVFKLSVTCSRNPGVPKDETDPAVLYKNANVLSGHMEWNGVGEQVNDFGNNPPRPHNPKILLAKLRPGQELEMELHCVKGVGQDHAKFSPVATASYRLMPHVIFRQPIPPHLCDKFVSCFPSGVFAVEQGANGQKKVVAKDMRKDTVSREVLRHKEFEGMIELTRIRDFFMFRIESSGSIPAPNLMPMAVDVMRQKISKLKAAAENLYVNRDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.44
3	0.42
4	0.41
5	0.46
6	0.46
7	0.42
8	0.36
9	0.31
10	0.24
11	0.21
12	0.18
13	0.12
14	0.12
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.14
19	0.19
20	0.19
21	0.24
22	0.23
23	0.23
24	0.27
25	0.29
26	0.28
27	0.26
28	0.26
29	0.23
30	0.23
31	0.3
32	0.27
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.22
37	0.19
38	0.18
39	0.11
40	0.12
41	0.14
42	0.22
43	0.24
44	0.31
45	0.37
46	0.44
47	0.52
48	0.59
49	0.64
50	0.66
51	0.74
52	0.75
53	0.78
54	0.79
55	0.78
56	0.73
57	0.68
58	0.6
59	0.53
60	0.48
61	0.42
62	0.37
63	0.35
64	0.37
65	0.36
66	0.36
67	0.39
68	0.41
69	0.41
70	0.4
71	0.38
72	0.38
73	0.41
74	0.39
75	0.42
76	0.48
77	0.55
78	0.6
79	0.66
80	0.7
81	0.75
82	0.84
83	0.88
84	0.88
85	0.9
86	0.93
87	0.95
88	0.95
89	0.94
90	0.93
91	0.92
92	0.91
93	0.91
94	0.89
95	0.86
96	0.8
97	0.74
98	0.69
99	0.6
100	0.54
101	0.46
102	0.38
103	0.3
104	0.28
105	0.31
106	0.3
107	0.34
108	0.35
109	0.37
110	0.4
111	0.41
112	0.39
113	0.39
114	0.41
115	0.41
116	0.44
117	0.48
118	0.47
119	0.49
120	0.48
121	0.42
122	0.36
123	0.31
124	0.24
125	0.16
126	0.13
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.15
139	0.2
140	0.27
141	0.29
142	0.31
143	0.31
144	0.32
145	0.32
146	0.26
147	0.2
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.12
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.08
157	0.07
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.09
186	0.11
187	0.15
188	0.18
189	0.21
190	0.24
191	0.28
192	0.3
193	0.37
194	0.37
195	0.34
196	0.31
197	0.32
198	0.32
199	0.29
200	0.31
201	0.25
202	0.28
203	0.31
204	0.34
205	0.33
206	0.3
207	0.27
208	0.24
209	0.22
210	0.17
211	0.15
212	0.13
213	0.12
214	0.13
215	0.14
216	0.13
217	0.15
218	0.2
219	0.25
220	0.26
221	0.34
222	0.41
223	0.49
224	0.57
225	0.6
226	0.62
227	0.65
228	0.72
229	0.75
230	0.77
231	0.78
232	0.8
233	0.81
234	0.73
235	0.67
236	0.59
237	0.57
238	0.47
239	0.38
240	0.3
241	0.28
242	0.27
243	0.23
244	0.21
245	0.12
246	0.12
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.08
275	0.11
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.15
281	0.15
282	0.16
283	0.17
284	0.19
285	0.23
286	0.25
287	0.27
288	0.27
289	0.31
290	0.31
291	0.3
292	0.26
293	0.24
294	0.23
295	0.25
296	0.24
297	0.21
298	0.2
299	0.17
300	0.17
301	0.17
302	0.17
303	0.14
304	0.15
305	0.14
306	0.15
307	0.22
308	0.23
309	0.22
310	0.22
311	0.24
312	0.23
313	0.26
314	0.26
315	0.21
316	0.21
317	0.2
318	0.19
319	0.19
320	0.19
321	0.15
322	0.14
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.11
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.11
336	0.13
337	0.12
338	0.11
339	0.16
340	0.15
341	0.15
342	0.16
343	0.16
344	0.14
345	0.14
346	0.12
347	0.09
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.1
355	0.14
356	0.15
357	0.14
358	0.16
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.19
363	0.18
364	0.17
365	0.18
366	0.16
367	0.17
368	0.19
369	0.19
370	0.22
371	0.2
372	0.19
373	0.19
374	0.16
375	0.17
376	0.15
377	0.14
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.1
419	0.18
420	0.2
421	0.26
422	0.27
423	0.28
424	0.29
425	0.3
426	0.27
427	0.2
428	0.24
429	0.21
430	0.26
431	0.27
432	0.26
433	0.28
434	0.3
435	0.33
436	0.32
437	0.32
438	0.33
439	0.38
440	0.45
441	0.41
442	0.43
443	0.41
444	0.4
445	0.43
446	0.38
447	0.41
448	0.35
449	0.36
450	0.33
451	0.37
452	0.34
453	0.29
454	0.28
455	0.2
456	0.2
457	0.22
458	0.19
459	0.14
460	0.18
461	0.17
462	0.17
463	0.16
464	0.14
465	0.13
466	0.16
467	0.16
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.1
476	0.13
477	0.13
478	0.13
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.13
484	0.15
485	0.16
486	0.16
487	0.16
488	0.16
489	0.16
490	0.15
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.23
495	0.29
496	0.3
497	0.31
498	0.32
499	0.32
500	0.3
501	0.3
502	0.23
503	0.18
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.13
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.12
512	0.13
513	0.17
514	0.17
515	0.17
516	0.17
517	0.17
518	0.16
519	0.18
520	0.17
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.11
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.05
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.09
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.14
547	0.11
548	0.11
549	0.11
550	0.1
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.05
559	0.06
560	0.07
561	0.12
562	0.14
563	0.17
564	0.18
565	0.21
566	0.26
567	0.28
568	0.28
569	0.26
570	0.25
571	0.24
572	0.25
573	0.22
574	0.17
575	0.17
576	0.17
577	0.19
578	0.19
579	0.21
580	0.2
581	0.23
582	0.24
583	0.23
584	0.23
585	0.18
586	0.18
587	0.13
588	0.14
589	0.11
590	0.09
591	0.08
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.08
598	0.1
599	0.12
600	0.15
601	0.16
602	0.17
603	0.18
604	0.19
605	0.19
606	0.17
607	0.14
608	0.14
609	0.12
610	0.12
611	0.1
612	0.09
613	0.08
614	0.09
615	0.11
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.13
621	0.11
622	0.12
623	0.18
624	0.24
625	0.29
626	0.32
627	0.32
628	0.34
629	0.36
630	0.37
631	0.33
632	0.3
633	0.26
634	0.33
635	0.43
636	0.4
637	0.45
638	0.44
639	0.41
640	0.39
641	0.38
642	0.31
643	0.31
644	0.31
645	0.27
646	0.29
647	0.32
648	0.3
649	0.29
650	0.25
651	0.2
652	0.18
653	0.17
654	0.14
655	0.1
656	0.11
657	0.11
658	0.11
659	0.08
660	0.08
661	0.11
662	0.13
663	0.14
664	0.14
665	0.14
666	0.16
667	0.15
668	0.18
669	0.18
670	0.17
671	0.18
672	0.17
673	0.18
674	0.17
675	0.17
676	0.15
677	0.15
678	0.14
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.14
685	0.13
686	0.13
687	0.17
688	0.2
689	0.23
690	0.23
691	0.23
692	0.23
693	0.26
694	0.32
695	0.37
696	0.44
697	0.49
698	0.52
699	0.55
700	0.58
701	0.62
702	0.59
703	0.56
704	0.49
705	0.51
706	0.47
707	0.47
708	0.48
709	0.43
710	0.43
711	0.36
712	0.35
713	0.25
714	0.28
715	0.26
716	0.22
717	0.17
718	0.12
719	0.11
720	0.1
721	0.1
722	0.07
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.06
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.07
740	0.07
741	0.09
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.09
748	0.08
749	0.06
750	0.05
751	0.05
752	0.07
753	0.08
754	0.08
755	0.09
756	0.09
757	0.1
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.1
762	0.1
763	0.1
764	0.11
765	0.12
766	0.13
767	0.13
768	0.11
769	0.1
770	0.11
771	0.11
772	0.12
773	0.11
774	0.09
775	0.1
776	0.13
777	0.12
778	0.11
779	0.11
780	0.12
781	0.14
782	0.13
783	0.14
784	0.11
785	0.12
786	0.13
787	0.13
788	0.09
789	0.09
790	0.1
791	0.09
792	0.1
793	0.14
794	0.13
795	0.15
796	0.16
797	0.15
798	0.17
799	0.17
800	0.16
801	0.16
802	0.18
803	0.24
804	0.26
805	0.27
806	0.29
807	0.3
808	0.34
809	0.34
810	0.37
811	0.36
812	0.35
813	0.36
814	0.37
815	0.39
816	0.36
817	0.35
818	0.3
819	0.26
820	0.26
821	0.23
822	0.19
823	0.17
824	0.19
825	0.18
826	0.18
827	0.16
828	0.14
829	0.18
830	0.2
831	0.2
832	0.16
833	0.15
834	0.14
835	0.15
836	0.14
837	0.1
838	0.08
839	0.07
840	0.08
841	0.09
842	0.09
843	0.08
844	0.09
845	0.14
846	0.22
847	0.26
848	0.27
849	0.32
850	0.41
851	0.48
852	0.53
853	0.57
854	0.53
855	0.58
856	0.64
857	0.68
858	0.67
859	0.61
860	0.64
861	0.6
862	0.59
863	0.51
864	0.45
865	0.37
866	0.31
867	0.31
868	0.26
869	0.23
870	0.23
871	0.22
872	0.2
873	0.18
874	0.16
875	0.13
876	0.16
877	0.17
878	0.19
879	0.25
880	0.28
881	0.32
882	0.33
883	0.34
884	0.29
885	0.27
886	0.27
887	0.21
888	0.21
889	0.19
890	0.22
891	0.23
892	0.27
893	0.28
894	0.22
895	0.23
896	0.21
897	0.23
898	0.26
899	0.29
900	0.26
901	0.27
902	0.34
903	0.35
904	0.42
905	0.44
906	0.4
907	0.43
908	0.43
909	0.45
910	0.38
911	0.4
912	0.38
913	0.36
914	0.37
915	0.31
916	0.3
917	0.27
918	0.31
919	0.27
920	0.23
921	0.19
922	0.16
923	0.17
924	0.16
925	0.16
926	0.13
927	0.2
928	0.19
929	0.19
930	0.19
931	0.18
932	0.22
933	0.25
934	0.32
935	0.34
936	0.4
937	0.49
938	0.58
939	0.61
940	0.6
941	0.59
942	0.55
943	0.56
944	0.57
945	0.51
946	0.49
947	0.53
948	0.59
949	0.61
950	0.58
951	0.49
952	0.48
953	0.44
954	0.39
955	0.35
956	0.29
957	0.25
958	0.26
959	0.26
960	0.21
961	0.22
962	0.2
963	0.17
964	0.17
965	0.19
966	0.17
967	0.24
968	0.25
969	0.23
970	0.28
971	0.27
972	0.25
973	0.25
974	0.28
975	0.21
976	0.19
977	0.19
978	0.17
979	0.17
980	0.17
981	0.15
982	0.11
983	0.1
984	0.1
985	0.14
986	0.12
987	0.14
988	0.15
989	0.18
990	0.22
991	0.22
992	0.24
993	0.27
994	0.31
995	0.36
996	0.38
997	0.41
998	0.45
999	0.5
1000	0.52
1001	0.49
1002	0.51
1003	0.46

L8X0D5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer