Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L7JZC7

Protein Details
Accession L7JZC7    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-250ATKMKKEEKSVKKVKKNILKIYHydrophilic
339-359QEYAKGINFSDKKKRRKRSARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-244KKEEKSVKKVKK
350-359KKKRRKRSAR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MTELKKQLEFYFSNQNYHKDTYLRTTCEENDGIAIEKILKFKKLQPCNYSEEDVRKALAESKIVKINGDKLTKAEDKSYGEYVTRKHCDYTVVIEGLDKELSLEEIETELCKYFEPKLIRMMRNGKKKFLGVVKVELESVEEVERVVKLEIPVFGKKVVDGEEEQKGVVNGLQDDMRATKDTNEVAGDKEKDEEKKDDEGKNDEKRKKDEEDVNKMNGKNEMVQAEAGATKMKKEEKSVKKVKKNILKIYTEEDYRKIKGPKDNASEKRDEYLTKNKDKLYKFVSCKEWTIKDMKEIVKDVIFVDLEKKVLRFKEPPEQEKMKINDELEIMRMEQKECQEYAKGINFSDKKKRRKRSAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.46
4 0.47
5 0.46
6 0.38
7 0.4
8 0.42
9 0.46
10 0.45
11 0.42
12 0.44
13 0.42
14 0.44
15 0.41
16 0.32
17 0.26
18 0.23
19 0.23
20 0.18
21 0.17
22 0.14
23 0.15
24 0.2
25 0.21
26 0.23
27 0.24
28 0.32
29 0.42
30 0.49
31 0.57
32 0.58
33 0.61
34 0.65
35 0.66
36 0.63
37 0.57
38 0.53
39 0.48
40 0.42
41 0.37
42 0.31
43 0.28
44 0.29
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.28
49 0.33
50 0.33
51 0.33
52 0.29
53 0.34
54 0.37
55 0.36
56 0.33
57 0.28
58 0.35
59 0.38
60 0.37
61 0.33
62 0.3
63 0.31
64 0.34
65 0.35
66 0.29
67 0.27
68 0.28
69 0.29
70 0.34
71 0.34
72 0.31
73 0.3
74 0.3
75 0.31
76 0.3
77 0.32
78 0.27
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.17
85 0.11
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.17
102 0.2
103 0.21
104 0.3
105 0.38
106 0.39
107 0.44
108 0.52
109 0.54
110 0.61
111 0.62
112 0.57
113 0.52
114 0.51
115 0.49
116 0.45
117 0.44
118 0.36
119 0.38
120 0.35
121 0.33
122 0.32
123 0.27
124 0.21
125 0.15
126 0.13
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.19
180 0.2
181 0.2
182 0.26
183 0.31
184 0.32
185 0.32
186 0.36
187 0.4
188 0.47
189 0.53
190 0.51
191 0.51
192 0.52
193 0.55
194 0.53
195 0.53
196 0.53
197 0.53
198 0.58
199 0.57
200 0.57
201 0.56
202 0.52
203 0.47
204 0.39
205 0.31
206 0.23
207 0.22
208 0.18
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.12
219 0.17
220 0.17
221 0.24
222 0.35
223 0.42
224 0.53
225 0.62
226 0.69
227 0.73
228 0.79
229 0.82
230 0.81
231 0.8
232 0.79
233 0.76
234 0.7
235 0.63
236 0.61
237 0.55
238 0.49
239 0.41
240 0.36
241 0.32
242 0.31
243 0.36
244 0.34
245 0.37
246 0.41
247 0.47
248 0.51
249 0.56
250 0.64
251 0.65
252 0.67
253 0.67
254 0.6
255 0.56
256 0.49
257 0.43
258 0.39
259 0.41
260 0.43
261 0.46
262 0.49
263 0.5
264 0.56
265 0.56
266 0.57
267 0.53
268 0.55
269 0.52
270 0.55
271 0.58
272 0.53
273 0.56
274 0.56
275 0.52
276 0.47
277 0.48
278 0.42
279 0.4
280 0.44
281 0.42
282 0.4
283 0.39
284 0.38
285 0.32
286 0.32
287 0.26
288 0.22
289 0.19
290 0.15
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.21
298 0.27
299 0.3
300 0.34
301 0.43
302 0.51
303 0.56
304 0.59
305 0.62
306 0.6
307 0.63
308 0.62
309 0.56
310 0.52
311 0.47
312 0.41
313 0.37
314 0.35
315 0.28
316 0.25
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.2
321 0.22
322 0.26
323 0.28
324 0.28
325 0.3
326 0.28
327 0.29
328 0.35
329 0.38
330 0.35
331 0.32
332 0.41
333 0.43
334 0.48
335 0.57
336 0.59
337 0.62
338 0.71
339 0.82