FuNGI

L7JTN3

Protein Details

Accession

L7JTN3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
341-363	KDRDIAHKQNKNKNKNNLKNVNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MIRVGGSDKGSDKDGVNDKYGVNKGIEGGNEGGSDKDGVNDNTPTINTSTNTSITTPTINTNPTNTTNSYPLNTPIKRTLTAAEVLKKLRFNIDKCAELFLATGTLKIRTNDLLQTTGLSILAERINTYRFLSHFESINRGAFFAVLKTTGVRALRPESFGFLCPVHTPDGAPCGLIVHMAMDAIVGRDEELKIAGCVMGDRPLIVDGRVVGYVDGWFGEYLRRRRRMEGWCVEIVDRWDAVYVFGGAGRLMRRVVDGGVEVYVGVMEQVDAVVLGYEDDCSRGRESNNGEDDCSRGREGKGRESRNREGNNGESRDRESNNGEDDCIGESNNGDSDCGRKDRDIAHKQNKNKNKNNLKNVNAHKNERYKRNENNNSRGKNTEHSYDNDHSNVINKISEGINNTSINNTNTKNNIDNNIKGTSINNTNTKNIKNIKMPVYKERPNARFFSYVASTIPFADYNQSPRNMYQCQMAKQAMAYPTLTYNNRTDSKYYVLNNMQRPLIKTFLDTLLGTNVYIAVLSYTSYDMEDAMVINKCAIERGLFDGYVYVTKVIERTHALVLPDVGEELTHGCVLYVKDGESVPYTGECARVHCVRLTDALAIITLRVRRSPQIGDKFCSRHGQKGVLSYRYRAVDLPFNEHGMVPDLIINPHAFPSRMTVGMMMEMLAGTVAVIKGERYACPPFKTYGVKNEHDVENDLGRNIKNDLSRNVKNYLDKNVENDLGRNIKNDLDRNVENDLHKNVKHRMNNHTHEHFCEQLRALGLNYYGNETLYSGITGHKLHARVFTGMCYYQRLRHMVSDKWQVRSVGPVQAQTRQPIKGRKRGGGVRFGEMERDALIAHGCAYLLYDRLMECSDKTAFEYCERCKTFLFVRDGTCLCGCRCVKVVYLPYVFKYLCTELMGMNIFVEVDVGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.36
3	0.36
4	0.37
5	0.35
6	0.4
7	0.42
8	0.37
9	0.29
10	0.27
11	0.25
12	0.26
13	0.26
14	0.21
15	0.2
16	0.19
17	0.18
18	0.18
19	0.16
20	0.14
21	0.15
22	0.11
23	0.13
24	0.16
25	0.18
26	0.21
27	0.22
28	0.22
29	0.23
30	0.23
31	0.23
32	0.2
33	0.21
34	0.18
35	0.21
36	0.24
37	0.23
38	0.25
39	0.24
40	0.24
41	0.22
42	0.24
43	0.21
44	0.22
45	0.25
46	0.27
47	0.27
48	0.28
49	0.32
50	0.33
51	0.36
52	0.35
53	0.34
54	0.36
55	0.37
56	0.36
57	0.33
58	0.35
59	0.4
60	0.39
61	0.41
62	0.44
63	0.45
64	0.44
65	0.44
66	0.4
67	0.34
68	0.38
69	0.38
70	0.36
71	0.36
72	0.38
73	0.4
74	0.4
75	0.37
76	0.41
77	0.43
78	0.39
79	0.45
80	0.48
81	0.49
82	0.47
83	0.5
84	0.41
85	0.34
86	0.32
87	0.22
88	0.2
89	0.15
90	0.16
91	0.12
92	0.15
93	0.17
94	0.18
95	0.2
96	0.18
97	0.21
98	0.24
99	0.26
100	0.25
101	0.23
102	0.23
103	0.21
104	0.19
105	0.16
106	0.11
107	0.09
108	0.1
109	0.11
110	0.1
111	0.1
112	0.12
113	0.13
114	0.15
115	0.17
116	0.17
117	0.17
118	0.22
119	0.26
120	0.27
121	0.3
122	0.31
123	0.35
124	0.34
125	0.37
126	0.31
127	0.27
128	0.24
129	0.2
130	0.19
131	0.14
132	0.13
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.11
137	0.14
138	0.15
139	0.15
140	0.18
141	0.22
142	0.24
143	0.27
144	0.27
145	0.27
146	0.27
147	0.27
148	0.26
149	0.21
150	0.2
151	0.18
152	0.2
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.15
157	0.19
158	0.17
159	0.16
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.11
164	0.09
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.04
174	0.05
175	0.06
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.08
195	0.09
196	0.1
197	0.09
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.11
207	0.18
208	0.27
209	0.36
210	0.44
211	0.46
212	0.51
213	0.6
214	0.63
215	0.66
216	0.65
217	0.62
218	0.55
219	0.54
220	0.5
221	0.42
222	0.35
223	0.27
224	0.19
225	0.13
226	0.12
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.04
252	0.03
253	0.02
254	0.02
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.02
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.06
267	0.07
268	0.09
269	0.11
270	0.14
271	0.14
272	0.2
273	0.24
274	0.31
275	0.36
276	0.35
277	0.34
278	0.32
279	0.34
280	0.29
281	0.27
282	0.2
283	0.16
284	0.17
285	0.23
286	0.26
287	0.34
288	0.41
289	0.47
290	0.55
291	0.61
292	0.66
293	0.68
294	0.67
295	0.6
296	0.55
297	0.53
298	0.53
299	0.48
300	0.43
301	0.35
302	0.36
303	0.38
304	0.35
305	0.31
306	0.26
307	0.25
308	0.27
309	0.26
310	0.23
311	0.18
312	0.18
313	0.16
314	0.14
315	0.11
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.12
325	0.14
326	0.15
327	0.14
328	0.16
329	0.23
330	0.33
331	0.41
332	0.48
333	0.56
334	0.62
335	0.7
336	0.77
337	0.8
338	0.8
339	0.79
340	0.79
341	0.8
342	0.83
343	0.85
344	0.84
345	0.79
346	0.78
347	0.76
348	0.76
349	0.69
350	0.64
351	0.61
352	0.62
353	0.63
354	0.63
355	0.64
356	0.62
357	0.66
358	0.73
359	0.77
360	0.75
361	0.78
362	0.78
363	0.73
364	0.68
365	0.62
366	0.53
367	0.47
368	0.42
369	0.37
370	0.3
371	0.29
372	0.33
373	0.33
374	0.32
375	0.28
376	0.25
377	0.2
378	0.2
379	0.19
380	0.14
381	0.11
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.12
386	0.12
387	0.13
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.2
399	0.22
400	0.22
401	0.27
402	0.27
403	0.27
404	0.27
405	0.26
406	0.24
407	0.21
408	0.2
409	0.18
410	0.19
411	0.21
412	0.22
413	0.23
414	0.26
415	0.3
416	0.3
417	0.33
418	0.32
419	0.33
420	0.33
421	0.36
422	0.41
423	0.43
424	0.45
425	0.47
426	0.5
427	0.51
428	0.54
429	0.57
430	0.54
431	0.51
432	0.51
433	0.46
434	0.4
435	0.35
436	0.32
437	0.24
438	0.21
439	0.18
440	0.16
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.08
445	0.07
446	0.09
447	0.09
448	0.13
449	0.16
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.22
454	0.21
455	0.21
456	0.22
457	0.23
458	0.24
459	0.27
460	0.27
461	0.22
462	0.21
463	0.24
464	0.19
465	0.16
466	0.14
467	0.11
468	0.12
469	0.15
470	0.16
471	0.15
472	0.15
473	0.19
474	0.22
475	0.23
476	0.22
477	0.21
478	0.23
479	0.25
480	0.25
481	0.25
482	0.28
483	0.32
484	0.34
485	0.34
486	0.33
487	0.29
488	0.31
489	0.27
490	0.25
491	0.19
492	0.17
493	0.17
494	0.16
495	0.17
496	0.14
497	0.12
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.08
502	0.07
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.04
510	0.04
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.04
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.05
527	0.06
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.07
541	0.09
542	0.1
543	0.12
544	0.13
545	0.15
546	0.15
547	0.14
548	0.14
549	0.13
550	0.11
551	0.09
552	0.07
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.07
561	0.07
562	0.09
563	0.09
564	0.08
565	0.1
566	0.1
567	0.11
568	0.1
569	0.1
570	0.09
571	0.09
572	0.1
573	0.09
574	0.12
575	0.11
576	0.12
577	0.16
578	0.17
579	0.18
580	0.19
581	0.2
582	0.17
583	0.19
584	0.19
585	0.15
586	0.14
587	0.12
588	0.11
589	0.09
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.11
595	0.13
596	0.14
597	0.18
598	0.24
599	0.31
600	0.39
601	0.42
602	0.44
603	0.48
604	0.48
605	0.47
606	0.5
607	0.43
608	0.4
609	0.4
610	0.42
611	0.38
612	0.44
613	0.47
614	0.46
615	0.46
616	0.4
617	0.41
618	0.37
619	0.36
620	0.28
621	0.25
622	0.25
623	0.25
624	0.3
625	0.26
626	0.26
627	0.26
628	0.24
629	0.22
630	0.19
631	0.17
632	0.11
633	0.12
634	0.12
635	0.11
636	0.12
637	0.12
638	0.09
639	0.11
640	0.12
641	0.1
642	0.1
643	0.14
644	0.16
645	0.16
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.09
652	0.06
653	0.05
654	0.05
655	0.04
656	0.03
657	0.02
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.04
663	0.07
664	0.09
665	0.1
666	0.13
667	0.2
668	0.25
669	0.27
670	0.3
671	0.29
672	0.33
673	0.38
674	0.37
675	0.4
676	0.43
677	0.43
678	0.44
679	0.46
680	0.43
681	0.38
682	0.38
683	0.3
684	0.27
685	0.25
686	0.22
687	0.21
688	0.19
689	0.19
690	0.18
691	0.19
692	0.2
693	0.23
694	0.29
695	0.35
696	0.39
697	0.41
698	0.44
699	0.44
700	0.46
701	0.45
702	0.47
703	0.45
704	0.41
705	0.42
706	0.42
707	0.41
708	0.36
709	0.34
710	0.31
711	0.3
712	0.29
713	0.27
714	0.24
715	0.25
716	0.29
717	0.32
718	0.3
719	0.32
720	0.32
721	0.33
722	0.36
723	0.36
724	0.33
725	0.33
726	0.34
727	0.32
728	0.33
729	0.36
730	0.4
731	0.45
732	0.49
733	0.51
734	0.57
735	0.62
736	0.68
737	0.7
738	0.7
739	0.64
740	0.62
741	0.6
742	0.55
743	0.46
744	0.43
745	0.35
746	0.3
747	0.29
748	0.25
749	0.21
750	0.19
751	0.18
752	0.16
753	0.16
754	0.16
755	0.15
756	0.14
757	0.14
758	0.12
759	0.13
760	0.11
761	0.11
762	0.08
763	0.09
764	0.12
765	0.12
766	0.14
767	0.17
768	0.19
769	0.21
770	0.25
771	0.27
772	0.27
773	0.27
774	0.27
775	0.27
776	0.27
777	0.27
778	0.28
779	0.27
780	0.3
781	0.35
782	0.37
783	0.35
784	0.4
785	0.44
786	0.43
787	0.49
788	0.54
789	0.53
790	0.53
791	0.54
792	0.48
793	0.44
794	0.45
795	0.41
796	0.38
797	0.35
798	0.37
799	0.35
800	0.41
801	0.43
802	0.43
803	0.44
804	0.41
805	0.46
806	0.51
807	0.58
808	0.6
809	0.64
810	0.64
811	0.69
812	0.72
813	0.72
814	0.71
815	0.65
816	0.61
817	0.57
818	0.52
819	0.45
820	0.37
821	0.32
822	0.22
823	0.19
824	0.14
825	0.11
826	0.11
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.07
831	0.07
832	0.08
833	0.09
834	0.09
835	0.1
836	0.1
837	0.1
838	0.12
839	0.15
840	0.14
841	0.14
842	0.17
843	0.18
844	0.18
845	0.2
846	0.23
847	0.23
848	0.29
849	0.35
850	0.35
851	0.44
852	0.46
853	0.46
854	0.42
855	0.45
856	0.45
857	0.47
858	0.5
859	0.43
860	0.43
861	0.48
862	0.47
863	0.47
864	0.42
865	0.37
866	0.3
867	0.35
868	0.33
869	0.3
870	0.34
871	0.32
872	0.33
873	0.38
874	0.44
875	0.43
876	0.48
877	0.47
878	0.44
879	0.48
880	0.45
881	0.37
882	0.36
883	0.31
884	0.27
885	0.27
886	0.26
887	0.2
888	0.25
889	0.25
890	0.2
891	0.17
892	0.14
893	0.12
894	0.11

L7JTN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer