Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A3J3

Protein Details
Accession Q5A3J3    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-262VSSTSKSSKERKKLKAKKSSKEKATTVSREKSKEKDKSKEKTKDKGKEKPEKSKNGEBasic
291-322STDEGTKEIKKRPRRSKKPKDTSEKTKKQTESBasic
335-388AKPSKATKSKANKPTSKSSKPESKDEQSSSTPPKKQSRKPKSQPKDSQQTTKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-261STKKKESSKAVSSTSKSSKERKKLKAKKSSKEKATTVSREKSKEKDKSKEKTKDKGKEKPEKSKNG
284-319KKSNGSKSTDEGTKEIKKRPRRSKKPKDTSEKTKKQ
335-376AKPSKATKSKANKPTSKSSKPESKDEQSSSTPPKKQSRKPKS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
KEGG cal:CAALFM_C111900CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MASITPRRSGPAPGILSKSPSLSSTTTGTPTTTTTTSSSTSVPIISPNNKFVIRLLPPSLTESEFLNQLATYYPYHASKICQFYYIQGHYPKTNFEVPIYSRAYVNFSNQHDSLEFLNFLKEKPFENEFDSIIPVIEKALFHKMVDTSANTSQKTLKESKKNLKRDDLVNNEIYKKFLMFINNEIDQFDLIKINKSTKKKESSKAVSSTSKSSKERKKLKAKKSSKEKATTVSREKSKEKDKSKEKTKDKGKEKPEKSKNGEDVSKDKSVNKDTKGQEDVKLSKKSNGSKSTDEGTKEIKKRPRRSKKPKDTSEKTKKQTESKSGTTSDEKTEVAKPSKATKSKANKPTSKSSKPESKDEQSSSTPPKKQSRKPKSQPKDSQQTTKVESQQLGLKPIKLLKRPESKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.44
4 0.42
5 0.38
6 0.3
7 0.26
8 0.26
9 0.22
10 0.23
11 0.23
12 0.24
13 0.25
14 0.25
15 0.24
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.21
23 0.23
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.18
29 0.17
30 0.19
31 0.23
32 0.28
33 0.31
34 0.32
35 0.36
36 0.35
37 0.35
38 0.32
39 0.34
40 0.31
41 0.33
42 0.33
43 0.3
44 0.31
45 0.34
46 0.35
47 0.28
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.19
52 0.18
53 0.15
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.15
61 0.16
62 0.18
63 0.19
64 0.21
65 0.26
66 0.32
67 0.3
68 0.29
69 0.28
70 0.31
71 0.38
72 0.37
73 0.36
74 0.34
75 0.36
76 0.38
77 0.39
78 0.37
79 0.33
80 0.34
81 0.3
82 0.26
83 0.29
84 0.27
85 0.34
86 0.34
87 0.3
88 0.26
89 0.26
90 0.29
91 0.25
92 0.27
93 0.26
94 0.26
95 0.31
96 0.3
97 0.31
98 0.26
99 0.27
100 0.24
101 0.19
102 0.17
103 0.12
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.2
111 0.23
112 0.22
113 0.25
114 0.27
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.18
119 0.14
120 0.12
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.21
136 0.24
137 0.23
138 0.23
139 0.26
140 0.26
141 0.3
142 0.34
143 0.36
144 0.42
145 0.5
146 0.6
147 0.66
148 0.73
149 0.73
150 0.73
151 0.69
152 0.65
153 0.66
154 0.62
155 0.56
156 0.51
157 0.47
158 0.43
159 0.39
160 0.33
161 0.24
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.15
166 0.13
167 0.16
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.19
172 0.17
173 0.14
174 0.13
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.11
179 0.11
180 0.17
181 0.24
182 0.28
183 0.34
184 0.39
185 0.49
186 0.53
187 0.59
188 0.63
189 0.64
190 0.65
191 0.62
192 0.59
193 0.54
194 0.49
195 0.47
196 0.42
197 0.41
198 0.39
199 0.44
200 0.47
201 0.53
202 0.61
203 0.66
204 0.73
205 0.77
206 0.83
207 0.86
208 0.87
209 0.87
210 0.88
211 0.87
212 0.83
213 0.8
214 0.72
215 0.68
216 0.67
217 0.64
218 0.6
219 0.58
220 0.55
221 0.53
222 0.55
223 0.54
224 0.56
225 0.58
226 0.59
227 0.62
228 0.66
229 0.71
230 0.79
231 0.82
232 0.8
233 0.8
234 0.82
235 0.82
236 0.82
237 0.81
238 0.8
239 0.81
240 0.81
241 0.82
242 0.81
243 0.81
244 0.79
245 0.79
246 0.74
247 0.69
248 0.65
249 0.58
250 0.53
251 0.48
252 0.46
253 0.39
254 0.35
255 0.35
256 0.38
257 0.41
258 0.39
259 0.43
260 0.41
261 0.46
262 0.49
263 0.46
264 0.43
265 0.43
266 0.46
267 0.45
268 0.49
269 0.44
270 0.44
271 0.48
272 0.52
273 0.54
274 0.56
275 0.54
276 0.51
277 0.53
278 0.52
279 0.5
280 0.44
281 0.38
282 0.37
283 0.4
284 0.42
285 0.47
286 0.5
287 0.57
288 0.66
289 0.75
290 0.8
291 0.83
292 0.89
293 0.93
294 0.95
295 0.96
296 0.96
297 0.95
298 0.93
299 0.93
300 0.93
301 0.91
302 0.86
303 0.84
304 0.8
305 0.78
306 0.77
307 0.76
308 0.72
309 0.68
310 0.67
311 0.6
312 0.58
313 0.54
314 0.47
315 0.41
316 0.36
317 0.3
318 0.28
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.33
323 0.32
324 0.39
325 0.48
326 0.51
327 0.5
328 0.53
329 0.6
330 0.67
331 0.74
332 0.76
333 0.74
334 0.75
335 0.82
336 0.82
337 0.8
338 0.76
339 0.75
340 0.75
341 0.72
342 0.75
343 0.72
344 0.7
345 0.7
346 0.67
347 0.64
348 0.58
349 0.61
350 0.61
351 0.61
352 0.59
353 0.59
354 0.66
355 0.71
356 0.76
357 0.81
358 0.82
359 0.85
360 0.9
361 0.92
362 0.93
363 0.94
364 0.95
365 0.94
366 0.94
367 0.9
368 0.89
369 0.84
370 0.8
371 0.74
372 0.71
373 0.67
374 0.61
375 0.55
376 0.48
377 0.49
378 0.45
379 0.47
380 0.42
381 0.37
382 0.36
383 0.42
384 0.47
385 0.47
386 0.52
387 0.55