Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PPX2

Protein Details
Accession A0A1D8PPX2    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-576TTKNKPIKPIVKKVSKITKKKQNPKFGPNKVLKPIEHydrophilic
584-635RWLPMKLRSYYKPTKKEKKKASGGGGQQGATESSTRTTSSSNNKKKKKKGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
545-568KPIKPIVKKVSKITKKKQNPKFGP
596-605PTKKEKKKAS
626-635NKKKKKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG cal:CAALFM_C602470WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSTSIADAFKKLNVSPESSTSEHEKIFNVSYEYLSKVKKFNDLKASKNCLVALINLDKYYKAEQIIRKLPSSLVNSLILEVAYVYYKIGKVQELVKLYEATNENILPNAVDIGLKHVLAQSYYKIGSYEKALELYKELIKNNQYDDELDLVINEKAIVSQLNFQKGGKIESSTTTNANNYDLLFNEALIKLSTLNTTQTLALLDKASQVVHAELSGEDLVSELLPIKLTTAYVYQLTGESNKSLEILESIDVEKINDLLIKLIVKNNLYSHSTITNINLVDRDLNYQQNLHKLSQKLTVLQYERVLKNSLVLKFASGTLSKSQLNNQFINNFQQTFPGDLLPLSYKVLSTLNIDHKDLQDLTKSKQIGRKLVKYIPTQTDNDLKIVATLILVSVNAQIGSFDQSLPILEQLTHESLATPKALPGLIGTLIAVYENTHNTKKLTDLLLKVLEKLLYTPKELLSGDINYYNFAKIVAFKALNQGHDKTATQLFEYLYEVNSNDQLIHSILSNTNNDLLPLDELTSKKPIDEILSVDIDTLIPTTKNKPIKPIVKKVSKITKKKQNPKFGPNKVLKPIEDLQLDEERWLPMKLRSYYKPTKKEKKKASGGGGQQGATESSTRTTSSSNNKKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.38
6 0.41
7 0.39
8 0.4
9 0.37
10 0.35
11 0.31
12 0.29
13 0.3
14 0.3
15 0.27
16 0.24
17 0.25
18 0.25
19 0.27
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.33
24 0.35
25 0.42
26 0.45
27 0.5
28 0.56
29 0.58
30 0.63
31 0.67
32 0.74
33 0.67
34 0.64
35 0.56
36 0.47
37 0.43
38 0.36
39 0.32
40 0.29
41 0.28
42 0.26
43 0.26
44 0.24
45 0.25
46 0.27
47 0.24
48 0.22
49 0.27
50 0.32
51 0.41
52 0.48
53 0.49
54 0.47
55 0.46
56 0.44
57 0.44
58 0.43
59 0.36
60 0.32
61 0.3
62 0.29
63 0.28
64 0.26
65 0.19
66 0.13
67 0.11
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.19
79 0.25
80 0.26
81 0.28
82 0.27
83 0.27
84 0.26
85 0.3
86 0.28
87 0.23
88 0.23
89 0.22
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.12
94 0.1
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.2
116 0.17
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.23
124 0.23
125 0.26
126 0.29
127 0.31
128 0.32
129 0.32
130 0.28
131 0.26
132 0.26
133 0.23
134 0.2
135 0.17
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.13
147 0.17
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.22
155 0.21
156 0.18
157 0.2
158 0.24
159 0.22
160 0.22
161 0.21
162 0.21
163 0.2
164 0.2
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.2
276 0.22
277 0.21
278 0.24
279 0.24
280 0.25
281 0.28
282 0.28
283 0.25
284 0.24
285 0.28
286 0.25
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.26
291 0.25
292 0.25
293 0.2
294 0.22
295 0.25
296 0.23
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.18
310 0.24
311 0.27
312 0.27
313 0.27
314 0.26
315 0.25
316 0.29
317 0.26
318 0.2
319 0.16
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.08
336 0.09
337 0.13
338 0.19
339 0.21
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.22
345 0.18
346 0.17
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.23
351 0.24
352 0.28
353 0.31
354 0.35
355 0.39
356 0.44
357 0.44
358 0.48
359 0.51
360 0.49
361 0.51
362 0.48
363 0.45
364 0.4
365 0.37
366 0.39
367 0.34
368 0.31
369 0.25
370 0.2
371 0.16
372 0.15
373 0.12
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.06
421 0.08
422 0.12
423 0.13
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.17
428 0.2
429 0.22
430 0.23
431 0.24
432 0.27
433 0.31
434 0.31
435 0.3
436 0.27
437 0.23
438 0.18
439 0.18
440 0.21
441 0.18
442 0.19
443 0.2
444 0.19
445 0.22
446 0.22
447 0.22
448 0.18
449 0.18
450 0.17
451 0.19
452 0.19
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.09
460 0.11
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.24
465 0.26
466 0.28
467 0.31
468 0.3
469 0.27
470 0.29
471 0.29
472 0.24
473 0.26
474 0.23
475 0.2
476 0.2
477 0.19
478 0.17
479 0.19
480 0.16
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.12
495 0.15
496 0.16
497 0.16
498 0.18
499 0.17
500 0.17
501 0.15
502 0.14
503 0.12
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.16
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.2
516 0.21
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.2
521 0.19
522 0.14
523 0.13
524 0.1
525 0.07
526 0.07
527 0.1
528 0.14
529 0.22
530 0.3
531 0.32
532 0.4
533 0.48
534 0.58
535 0.65
536 0.71
537 0.74
538 0.76
539 0.79
540 0.8
541 0.81
542 0.81
543 0.82
544 0.82
545 0.82
546 0.84
547 0.9
548 0.9
549 0.91
550 0.9
551 0.9
552 0.91
553 0.89
554 0.88
555 0.86
556 0.84
557 0.81
558 0.77
559 0.67
560 0.63
561 0.58
562 0.54
563 0.47
564 0.4
565 0.36
566 0.36
567 0.35
568 0.29
569 0.27
570 0.22
571 0.22
572 0.22
573 0.2
574 0.19
575 0.28
576 0.33
577 0.39
578 0.44
579 0.52
580 0.62
581 0.7
582 0.75
583 0.77
584 0.83
585 0.86
586 0.91
587 0.92
588 0.92
589 0.92
590 0.91
591 0.89
592 0.87
593 0.82
594 0.8
595 0.72
596 0.62
597 0.51
598 0.43
599 0.35
600 0.27
601 0.21
602 0.14
603 0.13
604 0.14
605 0.15
606 0.15
607 0.17
608 0.24
609 0.34
610 0.44
611 0.53
612 0.62
613 0.71
614 0.8
615 0.89