Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PG11

Protein Details
Accession A0A1D8PG11    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30LSNEINKKRKKVAANGRKRSKVSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-27KKRKKVAANGRKRSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
KEGG cal:CAALFM_C200200WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFSNLLSNEINKKRKKVAANGRKRSKVSTTAKEPAVVVEHAPETINPQPTTTNDEPSEEQLDTKLSQFGELDTSLSKSEKARKLQLLLQQQIKNTKYKAWLDQEAPLYQDPEKQLITLDLITDITNKQDEVYLKLRVYIKQLIKQWQECDNDDQELLMETKKSIVKLLYKLRSHKLSLDMLISLSTIVYYIQQNEFNKANESYMKLSIGNVCWPIGVVNVGIHARSAASKITGASNVSNIMLSESTRRWIISIKRLISFKERVYNNARD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.65
3 0.7
4 0.71
5 0.73
6 0.75
7 0.81
8 0.85
9 0.87
10 0.87
11 0.81
12 0.76
13 0.71
14 0.71
15 0.69
16 0.67
17 0.65
18 0.65
19 0.63
20 0.59
21 0.53
22 0.44
23 0.38
24 0.29
25 0.21
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.14
32 0.19
33 0.24
34 0.22
35 0.22
36 0.24
37 0.25
38 0.35
39 0.32
40 0.33
41 0.28
42 0.31
43 0.31
44 0.32
45 0.34
46 0.25
47 0.23
48 0.18
49 0.19
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.23
67 0.29
68 0.34
69 0.4
70 0.43
71 0.46
72 0.49
73 0.53
74 0.53
75 0.51
76 0.53
77 0.48
78 0.47
79 0.5
80 0.47
81 0.44
82 0.36
83 0.35
84 0.33
85 0.34
86 0.39
87 0.37
88 0.4
89 0.37
90 0.41
91 0.4
92 0.34
93 0.32
94 0.25
95 0.21
96 0.17
97 0.19
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.09
118 0.13
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.21
123 0.22
124 0.21
125 0.24
126 0.27
127 0.27
128 0.29
129 0.33
130 0.37
131 0.4
132 0.41
133 0.4
134 0.4
135 0.4
136 0.36
137 0.36
138 0.3
139 0.27
140 0.24
141 0.21
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.06
147 0.06
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.14
153 0.18
154 0.25
155 0.33
156 0.38
157 0.41
158 0.45
159 0.49
160 0.51
161 0.48
162 0.44
163 0.39
164 0.34
165 0.31
166 0.27
167 0.22
168 0.18
169 0.17
170 0.13
171 0.09
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.09
179 0.11
180 0.17
181 0.18
182 0.22
183 0.24
184 0.23
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.23
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.18
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.24
238 0.31
239 0.36
240 0.44
241 0.45
242 0.5
243 0.52
244 0.54
245 0.54
246 0.53
247 0.49
248 0.49
249 0.47
250 0.48