Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5APC1

Protein Details
Accession Q5APC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29EDSTGEKFKRQKYKEQSFVESHydrophilic
134-155HIVSQCKSKIRKRQYCRTCDSFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071039  P:nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071036  P:nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process  
GO:0071037  P:nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
KEGG cal:CAALFM_C109790CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSGTLPFIEDSTGEKFKRQKYKEQSFVESKERGSRDTKEHTPTTALSYDEVNDDLDELVALRGEGRYFGVTDPDDESGISRQSLGPLCANCYKRGHTRAKCTVVICHKCGAIDDHYESQCPTTIICSRCGEKGHIVSQCKSKIRKRQYCRTCDSFKHGDENCPSIWRSYITKSPSQGENEESSVLPRIYCYNCASNEHFGDECDKPRSSRIPNFGSAFSGNNLPKKYRNLYFKRLRAASNSRIGDEEYRPTTSTRDYTSNFTPSSRYEGFGSQGFSRNGGDHPSRSGFFPKRQSSGFGSSNGFSRTPKGPSQDNRSKGKFNSNAYGSKSSYNQPTRTGMINQNGSQDQRGIYRNSTRGGPQPTRSGLIANRKSKNFKKMKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.37
3 0.45
4 0.56
5 0.58
6 0.62
7 0.66
8 0.77
9 0.81
10 0.8
11 0.8
12 0.77
13 0.78
14 0.74
15 0.66
16 0.58
17 0.56
18 0.51
19 0.47
20 0.44
21 0.44
22 0.45
23 0.5
24 0.54
25 0.53
26 0.54
27 0.52
28 0.5
29 0.45
30 0.43
31 0.37
32 0.31
33 0.24
34 0.23
35 0.21
36 0.19
37 0.18
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.14
57 0.13
58 0.15
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.23
75 0.3
76 0.31
77 0.31
78 0.33
79 0.36
80 0.4
81 0.49
82 0.55
83 0.55
84 0.63
85 0.68
86 0.7
87 0.7
88 0.62
89 0.61
90 0.61
91 0.59
92 0.51
93 0.44
94 0.38
95 0.34
96 0.34
97 0.3
98 0.22
99 0.21
100 0.22
101 0.25
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.22
106 0.2
107 0.16
108 0.13
109 0.12
110 0.17
111 0.18
112 0.23
113 0.24
114 0.25
115 0.27
116 0.29
117 0.28
118 0.26
119 0.29
120 0.3
121 0.33
122 0.35
123 0.35
124 0.39
125 0.42
126 0.44
127 0.47
128 0.5
129 0.54
130 0.62
131 0.7
132 0.72
133 0.77
134 0.81
135 0.82
136 0.82
137 0.78
138 0.74
139 0.66
140 0.65
141 0.6
142 0.52
143 0.51
144 0.45
145 0.43
146 0.39
147 0.38
148 0.31
149 0.27
150 0.27
151 0.19
152 0.19
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.21
157 0.23
158 0.26
159 0.27
160 0.3
161 0.31
162 0.31
163 0.29
164 0.26
165 0.24
166 0.22
167 0.21
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.18
180 0.22
181 0.24
182 0.24
183 0.23
184 0.22
185 0.2
186 0.16
187 0.2
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.26
195 0.29
196 0.34
197 0.38
198 0.39
199 0.42
200 0.44
201 0.41
202 0.36
203 0.31
204 0.25
205 0.19
206 0.2
207 0.18
208 0.2
209 0.21
210 0.21
211 0.24
212 0.29
213 0.33
214 0.35
215 0.43
216 0.46
217 0.55
218 0.62
219 0.63
220 0.65
221 0.63
222 0.58
223 0.55
224 0.55
225 0.51
226 0.5
227 0.46
228 0.39
229 0.37
230 0.37
231 0.33
232 0.27
233 0.26
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.21
240 0.22
241 0.21
242 0.24
243 0.24
244 0.28
245 0.31
246 0.34
247 0.31
248 0.29
249 0.28
250 0.24
251 0.29
252 0.26
253 0.24
254 0.21
255 0.22
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.19
260 0.24
261 0.23
262 0.22
263 0.21
264 0.21
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.18
269 0.22
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.33
274 0.33
275 0.37
276 0.46
277 0.47
278 0.48
279 0.48
280 0.51
281 0.48
282 0.49
283 0.45
284 0.38
285 0.36
286 0.32
287 0.34
288 0.33
289 0.28
290 0.21
291 0.23
292 0.23
293 0.26
294 0.3
295 0.31
296 0.38
297 0.45
298 0.54
299 0.59
300 0.63
301 0.66
302 0.67
303 0.68
304 0.63
305 0.65
306 0.62
307 0.58
308 0.59
309 0.55
310 0.56
311 0.55
312 0.57
313 0.48
314 0.44
315 0.42
316 0.39
317 0.44
318 0.46
319 0.43
320 0.43
321 0.45
322 0.44
323 0.46
324 0.46
325 0.43
326 0.44
327 0.47
328 0.44
329 0.45
330 0.45
331 0.43
332 0.38
333 0.33
334 0.27
335 0.26
336 0.3
337 0.28
338 0.31
339 0.38
340 0.4
341 0.41
342 0.42
343 0.41
344 0.45
345 0.5
346 0.51
347 0.48
348 0.52
349 0.53
350 0.53
351 0.49
352 0.46
353 0.44
354 0.48
355 0.53
356 0.54
357 0.58
358 0.62
359 0.72
360 0.75
361 0.79