Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RH39

Protein Details
Accession E3RH39    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-276KAGVQKQNVGKRKRSRRMKESDNLWQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-267GKRKRSRRM
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006565  BTP  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
KEGG pte:PTT_07194  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07524  Bromo_TP  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MPGIILSPSASSEGATAGMKRARVAEDAPAYGEPHSKRRQVVRTLQHTQPIEHIVDPISAELDTYGESKDFFDQQLRRAIAIQCKAIGFESARPDALEDFRALVESYMKNFLAQVRTSMISSRRTETVAHDWVYALTCSGLRGSAPLEQHFDTGDIPPSLLQPYFAPPAPPEAPPPDTESLLGPELSGKADKETRPYIPKHFPGFPSKHTYTATPVFTSRENDPRKIREKATEEGILAEQSLRKLMAAQKAGVQKQNVGKRKRSRRMKESDNLWQSAMTDLLDEETQRERDEERRQARLDEDEDGDWAMSRDMPARQLTTDRSVNLEEGVHVNYEQKYWRKSASGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.15
5 0.17
6 0.18
7 0.19
8 0.21
9 0.22
10 0.23
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.28
15 0.29
16 0.27
17 0.25
18 0.24
19 0.29
20 0.24
21 0.29
22 0.36
23 0.39
24 0.44
25 0.52
26 0.6
27 0.63
28 0.7
29 0.71
30 0.73
31 0.74
32 0.72
33 0.7
34 0.63
35 0.55
36 0.49
37 0.42
38 0.35
39 0.29
40 0.26
41 0.19
42 0.19
43 0.18
44 0.14
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.2
60 0.22
61 0.26
62 0.34
63 0.33
64 0.32
65 0.34
66 0.37
67 0.36
68 0.37
69 0.35
70 0.28
71 0.27
72 0.27
73 0.24
74 0.22
75 0.16
76 0.16
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.16
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.12
92 0.11
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.2
107 0.23
108 0.25
109 0.26
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.27
114 0.3
115 0.28
116 0.27
117 0.24
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.17
122 0.1
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.23
163 0.19
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.08
177 0.12
178 0.13
179 0.17
180 0.19
181 0.23
182 0.28
183 0.3
184 0.35
185 0.38
186 0.43
187 0.43
188 0.44
189 0.43
190 0.46
191 0.47
192 0.44
193 0.46
194 0.41
195 0.4
196 0.38
197 0.36
198 0.32
199 0.34
200 0.31
201 0.24
202 0.23
203 0.22
204 0.23
205 0.25
206 0.23
207 0.28
208 0.3
209 0.35
210 0.39
211 0.45
212 0.5
213 0.52
214 0.51
215 0.5
216 0.51
217 0.48
218 0.48
219 0.43
220 0.36
221 0.33
222 0.3
223 0.22
224 0.17
225 0.14
226 0.1
227 0.08
228 0.09
229 0.07
230 0.07
231 0.1
232 0.14
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.27
237 0.33
238 0.36
239 0.37
240 0.33
241 0.32
242 0.37
243 0.46
244 0.49
245 0.49
246 0.56
247 0.62
248 0.73
249 0.78
250 0.81
251 0.82
252 0.84
253 0.88
254 0.88
255 0.86
256 0.82
257 0.82
258 0.76
259 0.68
260 0.58
261 0.48
262 0.39
263 0.32
264 0.25
265 0.14
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.24
278 0.33
279 0.41
280 0.44
281 0.5
282 0.51
283 0.53
284 0.53
285 0.51
286 0.45
287 0.38
288 0.35
289 0.27
290 0.26
291 0.24
292 0.21
293 0.15
294 0.13
295 0.1
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.13
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.23
304 0.27
305 0.3
306 0.34
307 0.36
308 0.33
309 0.33
310 0.33
311 0.31
312 0.28
313 0.24
314 0.19
315 0.17
316 0.18
317 0.15
318 0.14
319 0.17
320 0.17
321 0.19
322 0.24
323 0.29
324 0.33
325 0.36
326 0.4