Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RM16

Protein Details
Accession E3RM16    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37DAYFSRYQVKYKRRRQGKTDYYARKRLIHydrophilic
271-295KAESLKYRTKKLTKAEKEERVKAKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-293KKEEGAAPKKSKDEWKAESLKYRTKKLTKAEKEERVKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pte:PTT_09448  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MPFSKLQKNDAYFSRYQVKYKRRRQGKTDYYARKRLITQAKNKYNAPKYRLVVRFTNKDIICQIVHSELSGDKVFMAAYAHELKAYGITHGLTNWSSAYATGLLLARRVLKKLELDEDFVGVEEADGEFTLTEAAEIDGEERRPFKVFLDVGLTRTSTGARVFGAMKGCSDGGVFVPHSENRFPGYDIEGKELDAETLRKYIFGGHVAEYMETLADDDEERYKSQFSGYIEDDIEADGLEELYQDAHKQIRENPWKKEEGAAPKKSKDEWKAESLKYRTKKLTKAEKEERVKAKIAEITA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.5
4 0.54
5 0.6
6 0.63
7 0.72
8 0.77
9 0.78
10 0.84
11 0.85
12 0.87
13 0.87
14 0.86
15 0.86
16 0.87
17 0.85
18 0.85
19 0.79
20 0.72
21 0.64
22 0.63
23 0.63
24 0.62
25 0.64
26 0.66
27 0.72
28 0.72
29 0.74
30 0.75
31 0.74
32 0.73
33 0.68
34 0.66
35 0.6
36 0.65
37 0.66
38 0.61
39 0.6
40 0.59
41 0.6
42 0.55
43 0.61
44 0.5
45 0.47
46 0.44
47 0.39
48 0.32
49 0.26
50 0.23
51 0.17
52 0.17
53 0.14
54 0.14
55 0.11
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.05
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.16
98 0.18
99 0.2
100 0.25
101 0.22
102 0.24
103 0.23
104 0.22
105 0.2
106 0.17
107 0.15
108 0.08
109 0.07
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.19
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.16
214 0.2
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.15
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.08
233 0.11
234 0.13
235 0.15
236 0.22
237 0.32
238 0.43
239 0.49
240 0.55
241 0.59
242 0.61
243 0.59
244 0.59
245 0.55
246 0.55
247 0.59
248 0.6
249 0.6
250 0.61
251 0.63
252 0.62
253 0.64
254 0.61
255 0.6
256 0.56
257 0.6
258 0.64
259 0.65
260 0.69
261 0.66
262 0.68
263 0.65
264 0.68
265 0.68
266 0.68
267 0.71
268 0.72
269 0.77
270 0.77
271 0.82
272 0.84
273 0.84
274 0.85
275 0.87
276 0.84
277 0.77
278 0.72
279 0.63
280 0.58