Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RHP6

Protein Details
Accession E3RHP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
523-552VEGETRPKPSKDKKKKKDAKSVKRQFAETGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
528-546RPKPSKDKKKKKDAKSVKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR011068  NuclTrfase_I-like_C  
IPR007012  PolA_pol_cen_dom  
IPR007010  PolA_pol_RNA-bd_dom  
IPR014492  PolyA_polymerase  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0033620  C:Mei2 nuclear dot complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:1990251  C:nuclear exosome focus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
GO:0071050  P:sno(s)RNA polyadenylation  
KEGG pte:PTT_07465  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF04928  PAP_central  
PF04926  PAP_RNA-bind  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MDDQKKPTRQFGVTSAISEAPPTEQDIRKNDSLITTLKDENVFETPEGNQQRESVLKDIQNVVEEFVRRVGRKKGVQQPIIDAAGGKIFTFGSFALGVHGPSSDIDTLVVAPKFVSIDDFFALFPPTFRELCDEKDIQEFVPVEDAFVPIIKMQYQGVSIDLLFCSLPKRPSIPSKMTTIDKKDLEGLSESATRSVNGTRVTNELLDSVPQKVSFRHALRAIKLWSNRRGIYGAVFGYPGGVAWAIMVARICQLYPMANGATIVSKFFSLMYKWTWPRPVMLKHIEEGDMGLRVWNPQVYGGDRAHLMPIITPAFPSMCATHTVMPSTLRIMKEEFGRADKILQDIFANKKDWKALFERHTFFTKDHKYYLSVVAASRTKEANSTFSGLVQSKIRHIIKGIDDGNTGIATARPYIEYFERAHRITDDQFKEVAQGSLDYHIPKSEMDAEGALEANGDTTVVYTTTFYIGLTLPTGEATKSLDISYPVSQFKSYITDSDLFNEDLMSVKVVHTRSSALPDDVFVEGETRPKPSKDKKKKKDAKSVKRQFAETGLEVRDTRLTKSSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.4
3 0.34
4 0.3
5 0.26
6 0.22
7 0.15
8 0.15
9 0.18
10 0.22
11 0.25
12 0.32
13 0.37
14 0.44
15 0.44
16 0.44
17 0.41
18 0.36
19 0.36
20 0.32
21 0.3
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.28
26 0.26
27 0.26
28 0.25
29 0.24
30 0.19
31 0.2
32 0.18
33 0.25
34 0.29
35 0.28
36 0.26
37 0.24
38 0.27
39 0.3
40 0.31
41 0.27
42 0.29
43 0.29
44 0.32
45 0.35
46 0.33
47 0.33
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.24
52 0.21
53 0.23
54 0.27
55 0.25
56 0.3
57 0.36
58 0.41
59 0.48
60 0.56
61 0.61
62 0.66
63 0.7
64 0.67
65 0.64
66 0.6
67 0.54
68 0.44
69 0.34
70 0.24
71 0.21
72 0.19
73 0.13
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.11
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.13
96 0.13
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.1
102 0.13
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.2
117 0.21
118 0.25
119 0.31
120 0.28
121 0.26
122 0.3
123 0.3
124 0.24
125 0.27
126 0.23
127 0.17
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.11
154 0.13
155 0.14
156 0.17
157 0.21
158 0.3
159 0.37
160 0.42
161 0.41
162 0.44
163 0.46
164 0.49
165 0.5
166 0.47
167 0.46
168 0.4
169 0.39
170 0.38
171 0.34
172 0.3
173 0.26
174 0.21
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.15
201 0.22
202 0.22
203 0.26
204 0.31
205 0.34
206 0.35
207 0.39
208 0.38
209 0.35
210 0.39
211 0.41
212 0.41
213 0.42
214 0.41
215 0.38
216 0.36
217 0.31
218 0.27
219 0.23
220 0.17
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.06
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.08
258 0.1
259 0.16
260 0.18
261 0.2
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.29
266 0.3
267 0.31
268 0.34
269 0.32
270 0.3
271 0.3
272 0.28
273 0.22
274 0.19
275 0.13
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.09
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.06
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.1
307 0.11
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.16
320 0.18
321 0.2
322 0.19
323 0.18
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.17
328 0.16
329 0.13
330 0.12
331 0.11
332 0.13
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.24
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.3
343 0.35
344 0.41
345 0.43
346 0.41
347 0.44
348 0.42
349 0.38
350 0.4
351 0.4
352 0.36
353 0.35
354 0.34
355 0.33
356 0.34
357 0.36
358 0.28
359 0.22
360 0.2
361 0.22
362 0.22
363 0.21
364 0.2
365 0.17
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.18
370 0.17
371 0.2
372 0.18
373 0.18
374 0.21
375 0.19
376 0.2
377 0.2
378 0.19
379 0.18
380 0.26
381 0.26
382 0.23
383 0.24
384 0.28
385 0.27
386 0.33
387 0.32
388 0.25
389 0.24
390 0.24
391 0.23
392 0.17
393 0.15
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.15
404 0.17
405 0.23
406 0.27
407 0.27
408 0.28
409 0.27
410 0.28
411 0.3
412 0.37
413 0.34
414 0.31
415 0.31
416 0.3
417 0.3
418 0.28
419 0.24
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.13
424 0.15
425 0.14
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.14
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.12
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.17
471 0.2
472 0.22
473 0.23
474 0.23
475 0.23
476 0.22
477 0.22
478 0.24
479 0.22
480 0.19
481 0.22
482 0.23
483 0.23
484 0.26
485 0.27
486 0.22
487 0.21
488 0.19
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.11
493 0.09
494 0.09
495 0.14
496 0.15
497 0.17
498 0.16
499 0.19
500 0.2
501 0.26
502 0.28
503 0.26
504 0.25
505 0.24
506 0.25
507 0.22
508 0.21
509 0.15
510 0.13
511 0.11
512 0.16
513 0.17
514 0.2
515 0.23
516 0.26
517 0.36
518 0.46
519 0.57
520 0.63
521 0.74
522 0.79
523 0.87
524 0.94
525 0.94
526 0.95
527 0.95
528 0.95
529 0.94
530 0.95
531 0.93
532 0.88
533 0.8
534 0.72
535 0.67
536 0.62
537 0.53
538 0.48
539 0.39
540 0.37
541 0.35
542 0.33
543 0.34
544 0.29
545 0.29
546 0.31