FuNGI

L2FII0

Protein Details

Accession

L2FII0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-29	MDDQVHKPHRKAKDKKKGHTGDRNPKAFT	Basic
171-197	DLFKKVQTLKDAKKRIKRRLWSELYQG	Hydrophilic
787-809	GYVQVRIKKHRWHKKILKTNDPL	Hydrophilic
1003-1023	TPSQKNSQYRKIERETRHFNP	Hydrophilic
1075-1132	TIRNDKVARRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAADEGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-23	KPHRKAKDKKKGHTGDR
183-188	KKRIKR
1081-1141	VARRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAADEGAGGGGQKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:2000232 P:regulation of rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MDDQVHKPHRKAKDKKKGHTGDRNPKAFTFSNPGKLLKSNARSADIKERRFHVPLVDRLPDEPPPKLVTIIGPPGVGKTTLLKSLIRRYAKETISDPQGPITVVTSKKQRLTFVECPNQLEAMVDLAKIADIVLLMIDGNYGFEMETMEALNIFSSVGMPGNVFTILTHLDLFKKVQTLKDAKKRIKRRLWSELYQGAHLFYLSGVMNGRYPDREIHNLSRFLSVMKNPRPLVWRNSHPYTIVDSYRDITHPTKIEEDPKCDRSVVVSGYLRGTNFASQGQRVHIPGLGDFTVANLEVLPDPCPTPAMEQAMAKITGKTTRRRLDEKEKKLYAPLSDRSGLKIDGDAIWITREKGFTFDKDAEDGERGEGEELIVGLQGERKLLGQTEEGVQLFKGGEQLKDVVEDNDTGRKTQRFAHLPDRDGESDEEMVDEEGFVSGEEDGESDVEEEFDEGKLGKIFLKDSERDGDDEDVAFADSDSDLGSISGLEDEDGDMDAEGLDSDEEAAALKWKENMAERAKRLHGKRRSYHTPDLARFMYDDSITPQEALKRWRGEDREGEEDIEASDDDDFFKKSKHETDDKVEDRSIPLYDYQDLAAKWSLQANVEALRRRFTTSASRGGDDDDGDDDEFDGIDDDQDDDEGDGVFEDLETGEQHGPEEPDEEENFEDERERNAKRKEELKLRFEEEDREGFLNDKANARREGGEQQFGEDEWYESQKALIQKQLDINKAEFENLDERQRAVVEGFKAGKYAKIVLEGIPAEFVEMFNARMPLILGGLSPTEDRFGYVQVRIKKHRWHKKILKTNDPLIFSLGWRRFQTMPIYSISDSRTRNRMLKYTPEHMHCFATIYGPLIAPNSGFVCFNSFSSSNPGFRIAATGTVLSVDESTEIVKKLKLTGTADKIHKNTAFIKGMFNSSLEIAKFEGASIKTVSGVRGQIKRALSKPEGHFRATFEDKILYSDIVFLRAWYPIKPHRFYSPVTNLIGWQAMRLTGEVRRAEGIETPSQKNSQYRKIERETRHFNPLRVPRALAAELPFKSQIVQARKQNKETYMQKRAVVLNKEEKTARNLLQQLTTIRNDKVARRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAADEGAGGGGQKRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.9
3	0.93
4	0.92
5	0.92
6	0.92
7	0.92
8	0.92
9	0.91
10	0.87
11	0.79
12	0.7
13	0.66
14	0.57
15	0.51
16	0.49
17	0.45
18	0.48
19	0.49
20	0.5
21	0.46
22	0.48
23	0.49
24	0.49
25	0.49
26	0.48
27	0.48
28	0.51
29	0.5
30	0.53
31	0.57
32	0.57
33	0.57
34	0.55
35	0.55
36	0.55
37	0.56
38	0.52
39	0.5
40	0.5
41	0.52
42	0.53
43	0.54
44	0.48
45	0.47
46	0.49
47	0.47
48	0.41
49	0.35
50	0.32
51	0.31
52	0.31
53	0.3
54	0.28
55	0.24
56	0.27
57	0.3
58	0.27
59	0.24
60	0.23
61	0.24
62	0.24
63	0.21
64	0.16
65	0.16
66	0.17
67	0.21
68	0.23
69	0.25
70	0.3
71	0.39
72	0.47
73	0.47
74	0.47
75	0.5
76	0.56
77	0.55
78	0.54
79	0.48
80	0.45
81	0.47
82	0.48
83	0.42
84	0.35
85	0.34
86	0.29
87	0.26
88	0.23
89	0.21
90	0.21
91	0.25
92	0.32
93	0.36
94	0.42
95	0.45
96	0.47
97	0.48
98	0.55
99	0.59
100	0.61
101	0.65
102	0.61
103	0.61
104	0.57
105	0.51
106	0.41
107	0.33
108	0.23
109	0.16
110	0.15
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.08
116	0.07
117	0.04
118	0.03
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.03
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.2
162	0.21
163	0.24
164	0.32
165	0.39
166	0.47
167	0.56
168	0.64
169	0.68
170	0.76
171	0.83
172	0.85
173	0.86
174	0.86
175	0.85
176	0.86
177	0.85
178	0.8
179	0.78
180	0.73
181	0.65
182	0.57
183	0.48
184	0.38
185	0.3
186	0.24
187	0.16
188	0.09
189	0.1
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.11
195	0.12
196	0.14
197	0.13
198	0.15
199	0.18
200	0.22
201	0.28
202	0.32
203	0.4
204	0.45
205	0.46
206	0.46
207	0.44
208	0.39
209	0.34
210	0.32
211	0.29
212	0.32
213	0.36
214	0.42
215	0.4
216	0.44
217	0.48
218	0.49
219	0.52
220	0.5
221	0.53
222	0.53
223	0.58
224	0.55
225	0.51
226	0.48
227	0.45
228	0.41
229	0.34
230	0.28
231	0.25
232	0.25
233	0.26
234	0.24
235	0.23
236	0.2
237	0.24
238	0.24
239	0.25
240	0.28
241	0.29
242	0.37
243	0.37
244	0.42
245	0.44
246	0.44
247	0.44
248	0.39
249	0.37
250	0.31
251	0.31
252	0.26
253	0.25
254	0.23
255	0.23
256	0.24
257	0.26
258	0.22
259	0.2
260	0.19
261	0.15
262	0.14
263	0.17
264	0.17
265	0.18
266	0.19
267	0.21
268	0.22
269	0.21
270	0.21
271	0.19
272	0.17
273	0.16
274	0.17
275	0.14
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.05
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.1
292	0.12
293	0.15
294	0.17
295	0.18
296	0.18
297	0.19
298	0.21
299	0.21
300	0.19
301	0.16
302	0.13
303	0.19
304	0.23
305	0.29
306	0.36
307	0.43
308	0.48
309	0.54
310	0.61
311	0.66
312	0.72
313	0.73
314	0.74
315	0.7
316	0.64
317	0.62
318	0.57
319	0.5
320	0.46
321	0.4
322	0.35
323	0.36
324	0.35
325	0.33
326	0.33
327	0.28
328	0.22
329	0.18
330	0.15
331	0.12
332	0.13
333	0.11
334	0.09
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.12
340	0.11
341	0.15
342	0.17
343	0.17
344	0.22
345	0.23
346	0.23
347	0.23
348	0.23
349	0.21
350	0.2
351	0.18
352	0.13
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.1
372	0.09
373	0.1
374	0.11
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.14
389	0.14
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.11
394	0.15
395	0.15
396	0.15
397	0.18
398	0.19
399	0.19
400	0.24
401	0.31
402	0.3
403	0.35
404	0.45
405	0.47
406	0.47
407	0.48
408	0.47
409	0.39
410	0.36
411	0.32
412	0.23
413	0.18
414	0.16
415	0.14
416	0.09
417	0.09
418	0.07
419	0.06
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.03
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.12
448	0.17
449	0.17
450	0.19
451	0.22
452	0.21
453	0.21
454	0.22
455	0.19
456	0.15
457	0.14
458	0.12
459	0.09
460	0.08
461	0.07
462	0.05
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.02
489	0.03
490	0.02
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.1
500	0.12
501	0.19
502	0.24
503	0.29
504	0.31
505	0.34
506	0.37
507	0.43
508	0.45
509	0.49
510	0.5
511	0.53
512	0.58
513	0.62
514	0.68
515	0.69
516	0.7
517	0.68
518	0.66
519	0.59
520	0.57
521	0.49
522	0.4
523	0.32
524	0.26
525	0.2
526	0.13
527	0.11
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.14
535	0.16
536	0.19
537	0.2
538	0.21
539	0.27
540	0.29
541	0.3
542	0.34
543	0.35
544	0.34
545	0.32
546	0.31
547	0.26
548	0.23
549	0.19
550	0.13
551	0.09
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.08
561	0.1
562	0.15
563	0.2
564	0.25
565	0.28
566	0.35
567	0.43
568	0.43
569	0.43
570	0.39
571	0.33
572	0.29
573	0.26
574	0.2
575	0.11
576	0.11
577	0.1
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.11
583	0.12
584	0.11
585	0.1
586	0.09
587	0.11
588	0.11
589	0.09
590	0.1
591	0.09
592	0.12
593	0.15
594	0.19
595	0.17
596	0.19
597	0.2
598	0.21
599	0.21
600	0.19
601	0.25
602	0.26
603	0.34
604	0.33
605	0.32
606	0.31
607	0.31
608	0.29
609	0.2
610	0.17
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.07
615	0.06
616	0.05
617	0.05
618	0.04
619	0.04
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.07
644	0.08
645	0.08
646	0.09
647	0.08
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.1
652	0.11
653	0.11
654	0.09
655	0.1
656	0.09
657	0.12
658	0.15
659	0.17
660	0.23
661	0.28
662	0.33
663	0.36
664	0.43
665	0.47
666	0.53
667	0.58
668	0.56
669	0.56
670	0.54
671	0.52
672	0.46
673	0.42
674	0.35
675	0.29
676	0.25
677	0.21
678	0.18
679	0.17
680	0.17
681	0.17
682	0.16
683	0.19
684	0.2
685	0.23
686	0.24
687	0.25
688	0.25
689	0.24
690	0.3
691	0.28
692	0.3
693	0.27
694	0.26
695	0.25
696	0.23
697	0.22
698	0.14
699	0.12
700	0.08
701	0.1
702	0.1
703	0.09
704	0.09
705	0.12
706	0.14
707	0.15
708	0.18
709	0.17
710	0.2
711	0.26
712	0.3
713	0.3
714	0.29
715	0.28
716	0.26
717	0.26
718	0.24
719	0.18
720	0.15
721	0.16
722	0.16
723	0.19
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.17
728	0.16
729	0.13
730	0.14
731	0.12
732	0.15
733	0.16
734	0.15
735	0.16
736	0.16
737	0.17
738	0.15
739	0.16
740	0.13
741	0.14
742	0.15
743	0.14
744	0.17
745	0.16
746	0.14
747	0.12
748	0.11
749	0.09
750	0.08
751	0.08
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.08
756	0.08
757	0.08
758	0.08
759	0.08
760	0.07
761	0.07
762	0.06
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.08
773	0.1
774	0.12
775	0.16
776	0.21
777	0.27
778	0.34
779	0.38
780	0.44
781	0.51
782	0.59
783	0.66
784	0.68
785	0.72
786	0.76
787	0.81
788	0.85
789	0.85
790	0.85
791	0.79
792	0.8
793	0.74
794	0.66
795	0.56
796	0.47
797	0.39
798	0.29
799	0.32
800	0.27
801	0.27
802	0.25
803	0.28
804	0.27
805	0.3
806	0.35
807	0.3
808	0.29
809	0.26
810	0.29
811	0.26
812	0.28
813	0.27
814	0.27
815	0.27
816	0.29
817	0.32
818	0.33
819	0.39
820	0.4
821	0.44
822	0.42
823	0.48
824	0.51
825	0.53
826	0.55
827	0.54
828	0.55
829	0.5
830	0.48
831	0.38
832	0.34
833	0.26
834	0.22
835	0.17
836	0.14
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.1
841	0.1
842	0.08
843	0.09
844	0.09
845	0.08
846	0.09
847	0.09
848	0.12
849	0.13
850	0.13
851	0.16
852	0.16
853	0.16
854	0.24
855	0.26
856	0.24
857	0.24
858	0.26
859	0.21
860	0.21
861	0.23
862	0.16
863	0.15
864	0.14
865	0.13
866	0.11
867	0.11
868	0.11
869	0.08
870	0.08
871	0.06
872	0.05
873	0.06
874	0.07
875	0.08
876	0.1
877	0.1
878	0.12
879	0.12
880	0.16
881	0.18
882	0.22
883	0.26
884	0.33
885	0.38
886	0.44
887	0.48
888	0.5
889	0.49
890	0.5
891	0.46
892	0.41
893	0.39
894	0.39
895	0.4
896	0.34
897	0.37
898	0.32
899	0.34
900	0.31
901	0.27
902	0.21
903	0.17
904	0.19
905	0.15
906	0.14
907	0.12
908	0.12
909	0.12
910	0.11
911	0.14
912	0.12
913	0.14
914	0.14
915	0.14
916	0.15
917	0.16
918	0.17
919	0.16
920	0.2
921	0.24
922	0.28
923	0.3
924	0.34
925	0.37
926	0.42
927	0.42
928	0.45
929	0.42
930	0.46
931	0.51
932	0.55
933	0.55
934	0.52
935	0.5
936	0.44
937	0.49
938	0.45
939	0.39
940	0.31
941	0.3
942	0.27
943	0.28
944	0.27
945	0.19
946	0.15
947	0.19
948	0.17
949	0.17
950	0.16
951	0.15
952	0.14
953	0.18
954	0.19
955	0.15
956	0.22
957	0.28
958	0.37
959	0.4
960	0.42
961	0.46
962	0.48
963	0.49
964	0.53
965	0.52
966	0.49
967	0.47
968	0.45
969	0.38
970	0.36
971	0.36
972	0.26
973	0.18
974	0.14
975	0.12
976	0.12
977	0.12
978	0.13
979	0.13
980	0.2
981	0.2
982	0.21
983	0.22
984	0.22
985	0.23
986	0.25
987	0.26
988	0.27
989	0.32
990	0.33
991	0.35
992	0.36
993	0.39
994	0.43
995	0.46
996	0.49
997	0.54
998	0.59
999	0.65
1000	0.72
1001	0.78
1002	0.78
1003	0.81
1004	0.8
1005	0.74
1006	0.77
1007	0.72
1008	0.65
1009	0.65
1010	0.66
1011	0.63
1012	0.56
1013	0.53
1014	0.44
1015	0.45
1016	0.44
1017	0.37
1018	0.32
1019	0.32
1020	0.3
1021	0.31
1022	0.29
1023	0.24
1024	0.24
1025	0.24
1026	0.29
1027	0.3
1028	0.38
1029	0.44
1030	0.54
1031	0.6
1032	0.66
1033	0.69
1034	0.65
1035	0.66
1036	0.68
1037	0.7
1038	0.69
1039	0.66
1040	0.62
1041	0.61
1042	0.64
1043	0.62
1044	0.58
1045	0.56
1046	0.56
1047	0.54
1048	0.56
1049	0.54
1050	0.49
1051	0.47
1052	0.48
1053	0.44
1054	0.42
1055	0.45
1056	0.43
1057	0.43
1058	0.45
1059	0.43
1060	0.41
1061	0.43
1062	0.38
1063	0.34
1064	0.38
1065	0.39
1066	0.4
1067	0.45
1068	0.49
1069	0.53
1070	0.57
1071	0.64
1072	0.68
1073	0.75
1074	0.8
1075	0.82
1076	0.83
1077	0.82
1078	0.85
1079	0.88
1080	0.88
1081	0.87
1082	0.87
1083	0.85
1084	0.8
1085	0.76
1086	0.75
1087	0.75
1088	0.71
1089	0.68
1090	0.69
1091	0.63
1092	0.59
1093	0.63
1094	0.63
1095	0.6
1096	0.63
1097	0.62
1098	0.62
1099	0.71
1100	0.76
1101	0.78
1102	0.81
1103	0.81
1104	0.8
1105	0.85
1106	0.84
1107	0.84
1108	0.88
1109	0.88
1110	0.86
1111	0.84
1112	0.83
1113	0.82
1114	0.78
1115	0.7
1116	0.61
1117	0.51
1118	0.42
1119	0.37
1120	0.27
1121	0.21

L2FII0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer