Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RHF9

Protein Details
Accession E3RHF9    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SDNERPRDRYRERDSRREPREARBasic
28-51GTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-120RYRERDSRREPREAREGAGTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRYRSRSPFRRDDRESGGRGGDRSRGGHDRGRGRDDRRGGRDDRANAGDRSPQPPKGPRAGVRGPFGGAGK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pte:PTT_07346  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNERPRDRYRERDSRREPREAREGAGTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRYRSRSPFRRDDRESGGRGGDRSRGGHDRGRGRDDRRGGRDDRANAGDRSPQPPKGPRAGVRGPFGGAGKPPTGSRASVDAPVKEATPDVEMKDERQKPEDMDDDEWEMLKVMGFGGFKSTKNTKVPGNDKNFGVRKDKQLQARQYMNRQGGFNRPLSPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.84
3 0.85
4 0.84
5 0.85
6 0.78
7 0.75
8 0.76
9 0.67
10 0.59
11 0.54
12 0.49
13 0.41
14 0.44
15 0.38
16 0.31
17 0.39
18 0.44
19 0.43
20 0.46
21 0.51
22 0.55
23 0.64
24 0.72
25 0.73
26 0.74
27 0.8
28 0.85
29 0.87
30 0.84
31 0.84
32 0.82
33 0.77
34 0.78
35 0.75
36 0.73
37 0.73
38 0.73
39 0.69
40 0.7
41 0.73
42 0.72
43 0.72
44 0.74
45 0.74
46 0.76
47 0.76
48 0.72
49 0.71
50 0.68
51 0.63
52 0.54
53 0.48
54 0.4
55 0.35
56 0.3
57 0.25
58 0.21
59 0.19
60 0.22
61 0.23
62 0.25
63 0.29
64 0.33
65 0.37
66 0.39
67 0.44
68 0.46
69 0.45
70 0.49
71 0.52
72 0.53
73 0.5
74 0.51
75 0.47
76 0.47
77 0.49
78 0.44
79 0.41
80 0.37
81 0.35
82 0.3
83 0.29
84 0.29
85 0.25
86 0.28
87 0.26
88 0.26
89 0.27
90 0.32
91 0.34
92 0.34
93 0.36
94 0.35
95 0.39
96 0.42
97 0.42
98 0.39
99 0.36
100 0.31
101 0.28
102 0.24
103 0.18
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.2
116 0.21
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.13
128 0.13
129 0.16
130 0.25
131 0.29
132 0.29
133 0.31
134 0.32
135 0.29
136 0.34
137 0.36
138 0.3
139 0.28
140 0.28
141 0.27
142 0.26
143 0.24
144 0.2
145 0.15
146 0.11
147 0.09
148 0.07
149 0.05
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.21
157 0.25
158 0.29
159 0.33
160 0.36
161 0.37
162 0.44
163 0.52
164 0.55
165 0.6
166 0.58
167 0.55
168 0.61
169 0.61
170 0.55
171 0.55
172 0.5
173 0.51
174 0.56
175 0.6
176 0.61
177 0.65
178 0.69
179 0.7
180 0.74
181 0.72
182 0.72
183 0.75
184 0.71
185 0.66
186 0.6
187 0.54
188 0.54
189 0.52
190 0.46
191 0.42
192 0.4