FuNGI

A0A7J6JB21

Protein Details

Accession

A0A7J6JB21

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-55	SPVTNGHKSDKKSKKDKKEKKRSREEDAVEGEERKHKRSKSVVPKDDDNN	Basic
72-101	STTNGEPSSEKKRKHKKDKHRKSTDEAEAD	Basic
103-152	DASDAERKEKKDKKKKRKSQGLEEVSADTPASEKKEKKSKKSKAAAVAEP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-45	KSDKKSKKDKKEKKRSREEDAVEGEERKHKRSK
81-93	EKKRKHKKDKHRK
109-122	RKEKKDKKKKRKSQ
134-146	SEKKEKKSKKSKA
422-438	RRRRVGKSGGILSKERR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MAAIDSPVTNGHKSDKKSKKDKKEKKRSREEDAVEGEERKHKRSKSVVPKDDDNNSDDDTPAASQDLSVAASTTNGEPSSEKKRKHKKDKHRKSTDEAEADEDASDAERKEKKDKKKKRKSQGLEEVSADTPASEKKEKKSKKSKAAAVAEPEEADADDKNAMDVDAPAETKSTARAHQPPDAPSKPQFPFYTQTVSLYLPIYPTGWDTPCTAAATQHLEPLVNRYVPDFKGVLLAFRNIAVSEQPGRRGAATSDSQRCDLVSVDEYAVGFGYVTVDVDLFVPRRGAWMEGVINLENEGHIGVVCWSKFNASIESARLPAEWRWVHADSAEAAQYVADPFAAEEDAAEAQAAEDEHGAVRQIHTTGFWVDGAGEKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEMAAVKRDAEQERRRRVGKSGGILSKERRRMPEFSVTKFGVVEDEEEKALKQDVWNTTTPVTDDEGAGKDKEAFAGIAEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.53
3	0.61
4	0.71
5	0.8
6	0.83
7	0.88
8	0.93
9	0.93
10	0.95
11	0.96
12	0.96
13	0.96
14	0.93
15	0.91
16	0.9
17	0.84
18	0.81
19	0.75
20	0.69
21	0.6
22	0.53
23	0.46
24	0.44
25	0.42
26	0.39
27	0.41
28	0.4
29	0.46
30	0.54
31	0.62
32	0.65
33	0.74
34	0.78
35	0.76
36	0.8
37	0.77
38	0.75
39	0.67
40	0.57
41	0.49
42	0.43
43	0.37
44	0.3
45	0.24
46	0.18
47	0.16
48	0.14
49	0.12
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.08
55	0.08
56	0.07
57	0.06
58	0.07
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.17
66	0.27
67	0.33
68	0.4
69	0.48
70	0.59
71	0.7
72	0.8
73	0.86
74	0.87
75	0.91
76	0.96
77	0.96
78	0.96
79	0.92
80	0.88
81	0.87
82	0.84
83	0.78
84	0.67
85	0.6
86	0.49
87	0.43
88	0.35
89	0.25
90	0.15
91	0.11
92	0.11
93	0.08
94	0.14
95	0.18
96	0.21
97	0.31
98	0.4
99	0.5
100	0.6
101	0.72
102	0.77
103	0.84
104	0.91
105	0.92
106	0.95
107	0.93
108	0.93
109	0.93
110	0.89
111	0.8
112	0.71
113	0.63
114	0.51
115	0.42
116	0.31
117	0.19
118	0.13
119	0.12
120	0.15
121	0.19
122	0.22
123	0.3
124	0.41
125	0.49
126	0.59
127	0.68
128	0.73
129	0.78
130	0.83
131	0.82
132	0.82
133	0.81
134	0.74
135	0.69
136	0.61
137	0.5
138	0.41
139	0.34
140	0.24
141	0.17
142	0.13
143	0.08
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.11
160	0.12
161	0.13
162	0.19
163	0.25
164	0.29
165	0.34
166	0.38
167	0.38
168	0.45
169	0.45
170	0.42
171	0.39
172	0.42
173	0.37
174	0.39
175	0.36
176	0.31
177	0.33
178	0.32
179	0.34
180	0.27
181	0.28
182	0.24
183	0.23
184	0.21
185	0.17
186	0.15
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.07
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.14
198	0.14
199	0.13
200	0.11
201	0.12
202	0.16
203	0.15
204	0.15
205	0.14
206	0.13
207	0.13
208	0.16
209	0.17
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.15
214	0.15
215	0.18
216	0.14
217	0.12
218	0.15
219	0.15
220	0.15
221	0.13
222	0.13
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.11
231	0.12
232	0.13
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.15
240	0.2
241	0.24
242	0.25
243	0.25
244	0.25
245	0.24
246	0.2
247	0.18
248	0.13
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.06
257	0.04
258	0.03
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.08
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.07
284	0.06
285	0.05
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.1
296	0.12
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.17
302	0.17
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.2
308	0.18
309	0.18
310	0.23
311	0.24
312	0.24
313	0.22
314	0.22
315	0.15
316	0.16
317	0.15
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.06
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.1
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.1
358	0.12
359	0.11
360	0.12
361	0.11
362	0.16
363	0.2
364	0.27
365	0.28
366	0.35
367	0.43
368	0.49
369	0.54
370	0.6
371	0.58
372	0.58
373	0.56
374	0.49
375	0.41
376	0.34
377	0.3
378	0.21
379	0.19
380	0.12
381	0.1
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.07
403	0.14
404	0.19
405	0.29
406	0.39
407	0.48
408	0.58
409	0.65
410	0.67
411	0.63
412	0.64
413	0.64
414	0.61
415	0.59
416	0.58
417	0.56
418	0.57
419	0.59
420	0.61
421	0.61
422	0.61
423	0.58
424	0.57
425	0.56
426	0.57
427	0.58
428	0.61
429	0.58
430	0.55
431	0.57
432	0.51
433	0.47
434	0.42
435	0.36
436	0.28
437	0.23
438	0.2
439	0.14
440	0.16
441	0.15
442	0.16
443	0.16
444	0.15
445	0.16
446	0.14
447	0.15
448	0.21
449	0.27
450	0.31
451	0.33
452	0.35
453	0.34
454	0.34
455	0.32
456	0.27
457	0.24
458	0.21
459	0.19
460	0.19
461	0.21
462	0.22
463	0.22
464	0.2
465	0.19
466	0.18
467	0.18
468	0.16
469	0.13

A0A7J6JB21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer