Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S446

Protein Details
Accession E3S446    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-359PGSKGSVGPAPKKKKDRRKSQGGLTSPTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-350GSKGSVGPAPKKKKDRRKS
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pte:PTT_17300  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MPPPIAPPDEQEFDQPQIIAGLLHPDLHAGNNVFWYFTSSPWFEAECLNINVWLNVRQNDPATAEQIMNDRKLWQQRLDDQPIGTQYVLAGEGQGEGHPWLLQRQNKVSVVKDDKEQIETFVEGNYYTHGTKMLMAPSLLDIIQSRLLTVSTRMQQMAELSKNMTHWTPATGYSYFPPSYEAAKAATTASRVGSPTLAPTDLDGAVPQSQSAGAAAATATTTTTTQTTEPTASGTEFSDMLFLQSLNLTNAYGDEYMDENPLKGEPGAFVFEGTKTAVSARNKAQEQAAQATQQLPPAAALKIDTQTASALPSAAPTPKGGATPGAAPGTPGSKGSVGPAPKKKKDRRKSQGGLTSPTTPSVPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.29
3 0.23
4 0.2
5 0.19
6 0.14
7 0.1
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.16
16 0.13
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.16
22 0.22
23 0.19
24 0.18
25 0.23
26 0.21
27 0.22
28 0.24
29 0.25
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.21
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.23
41 0.22
42 0.22
43 0.24
44 0.25
45 0.26
46 0.27
47 0.29
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.19
53 0.24
54 0.25
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.26
59 0.34
60 0.37
61 0.36
62 0.39
63 0.46
64 0.55
65 0.6
66 0.56
67 0.49
68 0.47
69 0.43
70 0.38
71 0.3
72 0.2
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.08
77 0.07
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.11
88 0.17
89 0.21
90 0.25
91 0.3
92 0.35
93 0.39
94 0.41
95 0.4
96 0.42
97 0.45
98 0.42
99 0.4
100 0.39
101 0.36
102 0.37
103 0.34
104 0.27
105 0.22
106 0.21
107 0.18
108 0.14
109 0.13
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.19
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.1
264 0.16
265 0.18
266 0.23
267 0.27
268 0.35
269 0.36
270 0.37
271 0.38
272 0.35
273 0.36
274 0.36
275 0.32
276 0.25
277 0.25
278 0.26
279 0.23
280 0.22
281 0.19
282 0.14
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.2
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.18
323 0.22
324 0.26
325 0.35
326 0.45
327 0.52
328 0.6
329 0.71
330 0.79
331 0.84
332 0.88
333 0.9
334 0.91
335 0.92
336 0.91
337 0.91
338 0.9
339 0.85
340 0.8
341 0.73
342 0.68
343 0.58
344 0.51