Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PHI7

Protein Details
Accession A0A1D8PHI7    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-33SEEIISKKPSKPQASRKGKRAWRKNIDIQEIEHydrophilic
275-305SINKPNKIKIKTKTKRNKELKHKERVKLEQQHydrophilic
325-353KQAVKDQSQPNEKKRKRREKLFKYSLVETHydrophilic
386-416SSGKIESRVPVNKKRKYTKKITEKWTYKDFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-25KKPSKPQASRKGKRAWRK
278-301KPNKIKIKTKTKRNKELKHKERVK
337-344KKRKRREK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cal:CAALFM_C205750WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSEEIISKKPSKPQASRKGKRAWRKNIDIQEIEQNLQDKRDEEIVLGKEVTDDFVIDDTPSSKSGKLPKKLKTKEILTNKSKIPALTNQRHQKKGENTIQGVKKTDLLRLIQLNGGKFKSEDKYVNRLEQDGIVNGSSQDLWDDTDNNEKKKIPDFMKSTAEVTKASVVPKTLKVNPIKITSNELTDKKIHAGKSYNPSLESWKELINQEYDIEYKRELTRQQIEEHRNKIKELMITLDDNMLSDSDDDEDDEDNDKVEEEEQLNANGEKDYSLSINKPNKIKIKTKTKRNKELKHKERVKLEQQIKDLKKQLKDLSNLDEILEKQAVKDQSQPNEKKRKRREKLFKYSLVETPLEVKLSDELSGNLKNLKPEGNLYYDQMLSLQSSGKIESRVPVNKKRKYTKKITEKWTYKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.83
3 0.87
4 0.88
5 0.89
6 0.88
7 0.89
8 0.89
9 0.89
10 0.87
11 0.88
12 0.88
13 0.88
14 0.87
15 0.79
16 0.71
17 0.69
18 0.61
19 0.52
20 0.45
21 0.38
22 0.31
23 0.3
24 0.29
25 0.2
26 0.21
27 0.24
28 0.22
29 0.19
30 0.25
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.22
35 0.18
36 0.18
37 0.19
38 0.12
39 0.1
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.18
51 0.28
52 0.37
53 0.45
54 0.52
55 0.6
56 0.69
57 0.75
58 0.79
59 0.78
60 0.76
61 0.76
62 0.78
63 0.79
64 0.74
65 0.73
66 0.66
67 0.62
68 0.57
69 0.48
70 0.42
71 0.41
72 0.45
73 0.48
74 0.56
75 0.61
76 0.67
77 0.72
78 0.69
79 0.69
80 0.67
81 0.68
82 0.67
83 0.65
84 0.6
85 0.64
86 0.66
87 0.6
88 0.55
89 0.45
90 0.42
91 0.35
92 0.35
93 0.3
94 0.26
95 0.28
96 0.27
97 0.28
98 0.25
99 0.26
100 0.25
101 0.25
102 0.23
103 0.2
104 0.18
105 0.2
106 0.21
107 0.23
108 0.28
109 0.3
110 0.38
111 0.41
112 0.46
113 0.43
114 0.41
115 0.37
116 0.33
117 0.29
118 0.21
119 0.19
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.19
133 0.22
134 0.23
135 0.26
136 0.26
137 0.28
138 0.31
139 0.38
140 0.32
141 0.37
142 0.4
143 0.42
144 0.44
145 0.43
146 0.4
147 0.35
148 0.32
149 0.24
150 0.21
151 0.19
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.19
158 0.23
159 0.23
160 0.29
161 0.31
162 0.35
163 0.38
164 0.39
165 0.38
166 0.34
167 0.37
168 0.31
169 0.31
170 0.31
171 0.28
172 0.26
173 0.25
174 0.25
175 0.22
176 0.25
177 0.22
178 0.21
179 0.23
180 0.26
181 0.32
182 0.35
183 0.32
184 0.3
185 0.3
186 0.3
187 0.28
188 0.26
189 0.2
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.16
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.15
206 0.2
207 0.26
208 0.27
209 0.32
210 0.37
211 0.44
212 0.47
213 0.52
214 0.53
215 0.47
216 0.45
217 0.42
218 0.37
219 0.31
220 0.25
221 0.22
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.11
262 0.19
263 0.26
264 0.3
265 0.34
266 0.39
267 0.46
268 0.51
269 0.57
270 0.58
271 0.63
272 0.68
273 0.75
274 0.8
275 0.82
276 0.86
277 0.89
278 0.9
279 0.89
280 0.92
281 0.91
282 0.91
283 0.9
284 0.85
285 0.83
286 0.81
287 0.78
288 0.77
289 0.76
290 0.7
291 0.67
292 0.7
293 0.64
294 0.63
295 0.63
296 0.59
297 0.55
298 0.55
299 0.57
300 0.54
301 0.57
302 0.53
303 0.51
304 0.48
305 0.44
306 0.38
307 0.33
308 0.26
309 0.24
310 0.22
311 0.17
312 0.13
313 0.19
314 0.21
315 0.2
316 0.28
317 0.31
318 0.38
319 0.48
320 0.56
321 0.6
322 0.7
323 0.75
324 0.77
325 0.82
326 0.85
327 0.85
328 0.89
329 0.9
330 0.9
331 0.95
332 0.94
333 0.91
334 0.85
335 0.79
336 0.71
337 0.64
338 0.53
339 0.43
340 0.37
341 0.3
342 0.25
343 0.21
344 0.18
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.12
349 0.12
350 0.16
351 0.18
352 0.18
353 0.2
354 0.21
355 0.23
356 0.24
357 0.26
358 0.24
359 0.27
360 0.3
361 0.31
362 0.31
363 0.31
364 0.32
365 0.28
366 0.26
367 0.22
368 0.19
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.13
374 0.15
375 0.17
376 0.19
377 0.19
378 0.23
379 0.29
380 0.37
381 0.44
382 0.52
383 0.6
384 0.66
385 0.76
386 0.82
387 0.85
388 0.85
389 0.88
390 0.88
391 0.89
392 0.91
393 0.9
394 0.91
395 0.88
396 0.85