Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A7J6JCM2

Protein Details
Accession A0A7J6JCM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-78QAKAKTTSYKTKKKGIAKDKRPGPASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-77YKTKKKGIAKDKRPGPA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
IPR047288  Tudor_SGF29_rpt1  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
CDD cd20393  Tudor_SGF29_rpt1  
Amino Acid Sequences MSSFLIKGKAPQKPLSGARQSSLSTRKTEPPTANAEPSQVEAKITQAEAKPTQAKAKTTSYKTKKKGIAKDKRPGPASSLQAKMSQRNRSGRGSNRNNGSGHGEEIQLWNDAKDKFQEIVTGVNQENDNLAELIKLDKKAASASKDGGNPSGNDLNKMEQFCRSGVKLSENNSNNIKTLVEQLKILKAVQQAKELAEAPATTASSSRTGSSTRNRDAAAAALYDFDGAGDSPVPSPIGGSSRKFGDRGSNRDSMPPKADSVEPQGSTGSNTAGSSSGALGSNAAAARSKISFSKGDKVAFKRKKDEPQQGEAPYDWILGEVVGIIGEGKSRRYKCLDVEPEDNVKPKEYKTFASGMIPIPPENQTHNLAKLEAGKMVLGLYPQTTAFYAADVVGTEADGKTVNLKFHGENDSSTTHQVERRYVLEYRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.63
4 0.58
5 0.54
6 0.52
7 0.48
8 0.48
9 0.5
10 0.43
11 0.39
12 0.42
13 0.49
14 0.52
15 0.59
16 0.55
17 0.53
18 0.57
19 0.58
20 0.58
21 0.5
22 0.46
23 0.38
24 0.36
25 0.34
26 0.25
27 0.22
28 0.16
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.21
33 0.2
34 0.26
35 0.26
36 0.32
37 0.35
38 0.35
39 0.42
40 0.41
41 0.43
42 0.42
43 0.5
44 0.53
45 0.55
46 0.64
47 0.66
48 0.72
49 0.74
50 0.79
51 0.77
52 0.78
53 0.81
54 0.81
55 0.82
56 0.82
57 0.86
58 0.84
59 0.84
60 0.78
61 0.68
62 0.63
63 0.59
64 0.56
65 0.53
66 0.48
67 0.42
68 0.45
69 0.46
70 0.49
71 0.49
72 0.51
73 0.52
74 0.57
75 0.6
76 0.6
77 0.65
78 0.66
79 0.7
80 0.7
81 0.7
82 0.68
83 0.68
84 0.61
85 0.55
86 0.51
87 0.41
88 0.34
89 0.28
90 0.23
91 0.19
92 0.2
93 0.19
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.15
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.13
115 0.13
116 0.09
117 0.09
118 0.06
119 0.07
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.17
127 0.2
128 0.21
129 0.2
130 0.22
131 0.26
132 0.28
133 0.28
134 0.26
135 0.24
136 0.21
137 0.22
138 0.26
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.23
144 0.25
145 0.21
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.2
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.23
154 0.24
155 0.26
156 0.34
157 0.33
158 0.35
159 0.35
160 0.34
161 0.29
162 0.26
163 0.23
164 0.14
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.16
174 0.18
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.24
179 0.24
180 0.26
181 0.23
182 0.18
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.15
197 0.23
198 0.28
199 0.29
200 0.31
201 0.3
202 0.29
203 0.28
204 0.25
205 0.18
206 0.11
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.24
233 0.28
234 0.33
235 0.37
236 0.39
237 0.38
238 0.44
239 0.46
240 0.39
241 0.36
242 0.31
243 0.26
244 0.24
245 0.24
246 0.2
247 0.25
248 0.26
249 0.22
250 0.22
251 0.21
252 0.2
253 0.2
254 0.18
255 0.12
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.13
278 0.18
279 0.21
280 0.29
281 0.31
282 0.35
283 0.4
284 0.46
285 0.54
286 0.56
287 0.58
288 0.58
289 0.62
290 0.67
291 0.71
292 0.75
293 0.71
294 0.7
295 0.72
296 0.66
297 0.61
298 0.51
299 0.43
300 0.32
301 0.26
302 0.18
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.05
314 0.06
315 0.1
316 0.18
317 0.2
318 0.25
319 0.3
320 0.34
321 0.37
322 0.47
323 0.52
324 0.5
325 0.53
326 0.52
327 0.53
328 0.51
329 0.5
330 0.41
331 0.36
332 0.32
333 0.3
334 0.35
335 0.32
336 0.33
337 0.32
338 0.35
339 0.33
340 0.33
341 0.34
342 0.27
343 0.28
344 0.27
345 0.23
346 0.22
347 0.22
348 0.21
349 0.23
350 0.25
351 0.26
352 0.28
353 0.31
354 0.3
355 0.29
356 0.29
357 0.3
358 0.27
359 0.23
360 0.21
361 0.17
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.13
388 0.16
389 0.18
390 0.19
391 0.22
392 0.23
393 0.28
394 0.34
395 0.3
396 0.29
397 0.31
398 0.33
399 0.32
400 0.33
401 0.3
402 0.28
403 0.3
404 0.33
405 0.34
406 0.34
407 0.34
408 0.36