Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDV1

Protein Details
Accession A0A1D8PDV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
531-561YIDQKHSNDEKYRKERRKKERLVKLNEQLDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-551RKERRKKER
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
KEGG cal:CAALFM_C106660WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MSHKALFKGRRFERDGTLSNSSSRAQSVSRTPLRSDDSDYESDTEEQDFIKIEELLKERLFGLQSQEIELAKEDRIGAGDRRQYQAANINKSRIQESSSINDIINSLEFSRNDVSSQSRELLLVQLYKLLVSRPLVVCNEENAGTPEFVDEDKVAKLINIFTSANYRSEDEFLYLFRSLIALICSDIEEFGSLVSTELLNHIQHVITEPSNSIVTNSIKANVITGYVVLTLILHNGASSFGIDERIAMLIELAEGYTASATTLKKEVEAGDREHSTFITDKNLDKKLVNEANAKVVAEASVAVAAIHGVGCLLTLIPHGSFLNEIMEDLMFKLVPLLDNDEDRDIAKAAGRVIGVIYEMYDYGQNADADNGGDFDNEYNENSPYYEQESLLAILTRLLNLSSKKVAKKDKKDISSVFRNISNTIKIYTDANSREQVYKRTQEGLELLDSTSDSTYIKLSKFRSLKINSWFLYFRLKHLRWCFSFGLHNQLVGNDSVRDALKEPENEFNYGTQPDFDDSLVDDDNSESFHDYIDQKHSNDEKYRKERRKKERLVKLNEQLDELNLHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.61
4 0.6
5 0.52
6 0.48
7 0.46
8 0.39
9 0.32
10 0.28
11 0.24
12 0.2
13 0.23
14 0.29
15 0.36
16 0.42
17 0.44
18 0.45
19 0.48
20 0.53
21 0.5
22 0.5
23 0.45
24 0.43
25 0.42
26 0.43
27 0.38
28 0.34
29 0.32
30 0.27
31 0.23
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.18
41 0.21
42 0.24
43 0.24
44 0.24
45 0.22
46 0.25
47 0.25
48 0.2
49 0.23
50 0.24
51 0.24
52 0.25
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.24
57 0.19
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.17
65 0.23
66 0.29
67 0.31
68 0.34
69 0.35
70 0.34
71 0.35
72 0.4
73 0.4
74 0.43
75 0.43
76 0.44
77 0.45
78 0.47
79 0.45
80 0.38
81 0.33
82 0.29
83 0.3
84 0.31
85 0.32
86 0.32
87 0.29
88 0.28
89 0.26
90 0.21
91 0.17
92 0.13
93 0.11
94 0.14
95 0.14
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.19
101 0.22
102 0.21
103 0.23
104 0.21
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.17
120 0.17
121 0.2
122 0.21
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.23
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.17
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.06
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.03
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.03
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.17
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.18
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.2
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.23
273 0.26
274 0.28
275 0.28
276 0.27
277 0.25
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.17
282 0.14
283 0.11
284 0.07
285 0.07
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.02
294 0.02
295 0.02
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.12
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.1
386 0.11
387 0.14
388 0.19
389 0.24
390 0.28
391 0.35
392 0.45
393 0.52
394 0.61
395 0.69
396 0.72
397 0.72
398 0.75
399 0.73
400 0.71
401 0.7
402 0.64
403 0.56
404 0.49
405 0.46
406 0.41
407 0.39
408 0.34
409 0.26
410 0.23
411 0.21
412 0.19
413 0.19
414 0.19
415 0.23
416 0.22
417 0.24
418 0.26
419 0.27
420 0.32
421 0.33
422 0.36
423 0.37
424 0.4
425 0.4
426 0.42
427 0.4
428 0.37
429 0.36
430 0.33
431 0.27
432 0.22
433 0.19
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.1
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.12
443 0.14
444 0.19
445 0.22
446 0.3
447 0.34
448 0.37
449 0.44
450 0.47
451 0.52
452 0.54
453 0.6
454 0.52
455 0.52
456 0.49
457 0.41
458 0.46
459 0.39
460 0.38
461 0.41
462 0.42
463 0.46
464 0.53
465 0.61
466 0.53
467 0.59
468 0.53
469 0.46
470 0.52
471 0.44
472 0.46
473 0.37
474 0.36
475 0.3
476 0.29
477 0.28
478 0.21
479 0.21
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.14
486 0.17
487 0.22
488 0.25
489 0.28
490 0.34
491 0.37
492 0.37
493 0.37
494 0.33
495 0.31
496 0.29
497 0.27
498 0.19
499 0.18
500 0.18
501 0.18
502 0.17
503 0.14
504 0.14
505 0.16
506 0.16
507 0.14
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.1
515 0.1
516 0.14
517 0.15
518 0.19
519 0.27
520 0.31
521 0.29
522 0.38
523 0.43
524 0.46
525 0.54
526 0.58
527 0.6
528 0.66
529 0.77
530 0.79
531 0.85
532 0.88
533 0.9
534 0.93
535 0.93
536 0.94
537 0.94
538 0.94
539 0.92
540 0.92
541 0.91
542 0.87
543 0.77
544 0.69
545 0.58
546 0.49