Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L2GPC3

Protein Details
Accession L2GPC3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-239ERFLPNIKKTHSKKKKTRRETGSMPEEIHydrophilic
257-287PENTERLRIKEEKRKKREEIRQAKKTRFEVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-230KKTHSKKKKTRR
264-282RIKEEKRKKREEIRQAKKT
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
Amino Acid Sequences MSKDSKSDTETKDRKFKASTFDESKVRHSFLEVSVFEVLFPKHRAQYLKGVESYAIKACEVKKVHFEVDYDKFTMRVSTTDRTRDPYIIIKAYEMIQLLGRGVTLENAVKVLEDGIASEVLQARMLCSTEKIFERRRQRLSNPKILQSIELITKTHVLISNKTVCIVGEYKGVHEAKNIIIKCFENIHPAFELKRLIIKKKLMKDNAEGDWERFLPNIKKTHSKKKKTRRETGSMPEEIHERKEDLQMQTGEYFSNPENTERLRIKEEKRKKREEIRQAKKTRFEVPNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.63
3 0.6
4 0.59
5 0.58
6 0.59
7 0.56
8 0.59
9 0.61
10 0.57
11 0.6
12 0.55
13 0.5
14 0.41
15 0.36
16 0.33
17 0.29
18 0.35
19 0.28
20 0.27
21 0.27
22 0.26
23 0.24
24 0.23
25 0.2
26 0.17
27 0.2
28 0.2
29 0.22
30 0.27
31 0.3
32 0.32
33 0.41
34 0.44
35 0.47
36 0.44
37 0.41
38 0.38
39 0.37
40 0.35
41 0.28
42 0.22
43 0.16
44 0.19
45 0.19
46 0.26
47 0.26
48 0.26
49 0.29
50 0.32
51 0.34
52 0.32
53 0.33
54 0.32
55 0.35
56 0.35
57 0.3
58 0.27
59 0.25
60 0.23
61 0.24
62 0.18
63 0.15
64 0.17
65 0.22
66 0.27
67 0.32
68 0.34
69 0.37
70 0.39
71 0.37
72 0.34
73 0.34
74 0.34
75 0.3
76 0.29
77 0.24
78 0.22
79 0.22
80 0.21
81 0.15
82 0.11
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.13
118 0.17
119 0.23
120 0.29
121 0.39
122 0.46
123 0.52
124 0.54
125 0.59
126 0.65
127 0.67
128 0.7
129 0.63
130 0.59
131 0.54
132 0.49
133 0.42
134 0.32
135 0.27
136 0.18
137 0.16
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.18
147 0.22
148 0.21
149 0.22
150 0.2
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.18
159 0.19
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.15
164 0.21
165 0.21
166 0.16
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.21
171 0.19
172 0.21
173 0.21
174 0.22
175 0.21
176 0.22
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.13
181 0.19
182 0.21
183 0.24
184 0.3
185 0.37
186 0.42
187 0.5
188 0.58
189 0.58
190 0.58
191 0.59
192 0.59
193 0.53
194 0.52
195 0.44
196 0.36
197 0.32
198 0.29
199 0.24
200 0.18
201 0.21
202 0.2
203 0.25
204 0.31
205 0.32
206 0.42
207 0.48
208 0.6
209 0.65
210 0.71
211 0.76
212 0.81
213 0.89
214 0.89
215 0.93
216 0.9
217 0.88
218 0.86
219 0.85
220 0.81
221 0.73
222 0.63
223 0.54
224 0.49
225 0.42
226 0.36
227 0.29
228 0.23
229 0.22
230 0.28
231 0.32
232 0.3
233 0.35
234 0.33
235 0.34
236 0.33
237 0.31
238 0.25
239 0.19
240 0.2
241 0.13
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.22
246 0.24
247 0.32
248 0.33
249 0.37
250 0.38
251 0.45
252 0.52
253 0.6
254 0.68
255 0.72
256 0.78
257 0.83
258 0.85
259 0.88
260 0.9
261 0.9
262 0.9
263 0.9
264 0.91
265 0.9
266 0.89
267 0.87
268 0.81
269 0.79