FuNGI

L2GM54

Protein Details

Accession

L2GM54

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	DSDIIFRKRPASRKIHRPSDEFT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036860 SH2_dom_sf IPR035420 Spt6_SH2 IPR017072 TF_Spt6
Gene Ontology	GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14633 SH2_2

Amino Acid Sequences

MSESSDSDIIFRKRPASRKIHRPSDEFTSSEIVDHSEIVEGDFEPLFFEIFGNGDEYSYIYKKKNGNEEQENTRDRCEISVSECYAYVQGFLRGFNSLFKELDSKIVEELIEGYSPEYLSFHLGKMTVKELYFVKDLIDEFKEETSKVQIKHVVASESRIQGLITCSEFVVNMESFESVFHPQGNIDVPFDVGISTKDGFDNGWDYDEIQGLEIEKPAPTLDDTDKDIVSKHFKKTISQIASNPIFLKRVVYSTIISVLEPSFCENSVHSLGFLQKLYCSGQNDMNDQLRKTIVQKAYEAVAVDKSIIERRLVDQGMIEGPNGLQELVDLIISLRGRPGSYAGVYLDKTLFSVVRIDGSGNFVASSIFKEHELSELHAFLSDVDNVCLTSTSPSVKFALQNAGINFFYVPRKLSFFDDYKELSIPYNIALVVQNPLLYFARLLYNLSNGYPVCNYRFVDPGLLERGISIACAVCKLDWISTLSHKFGFILFKLLKIDISDPYFNFERLDALESLKHVFDNVKCSNACTYFNLLSSENPLDKTLIHPVNYSMAIILFKSAYHSLLSAQHDSIMNRMHLDLEKDESKIIELFVNQPELLASYSTIGMDGDKDMQTLADLKQIMLREDEVYFAGASDAQVFDDVVPHLEQNQTYSGTVTKVGNSFYLCQVSNATVYIRKSSELALNQIVKVEITGSNPPALSYSGNVVEEEGFKVDKFRSHSLFRNMPYDALEKHMRESNKSLAIRPSSTPSCCCVVCKIEDDLFFTYKLKETIKSEDGFKISYEFKNRYYSSIDAFIDDYIKKTYNMIGSIVSFKYYFADPAQAQRHIEEPGEFVKYSIVLSRKVPGCLEFLLSGKHVFSKIDGDRLILKEHSFETLDDLIRFIKTHIKSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.59
3	0.62
4	0.68
5	0.74
6	0.82
7	0.85
8	0.84
9	0.81
10	0.76
11	0.74
12	0.68
13	0.58
14	0.51
15	0.44
16	0.37
17	0.33
18	0.28
19	0.21
20	0.17
21	0.16
22	0.14
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.1
28	0.11
29	0.11
30	0.1
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.09
35	0.08
36	0.07
37	0.08
38	0.08
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.1
44	0.14
45	0.16
46	0.2
47	0.21
48	0.28
49	0.34
50	0.41
51	0.51
52	0.55
53	0.62
54	0.67
55	0.7
56	0.72
57	0.75
58	0.74
59	0.65
60	0.58
61	0.51
62	0.42
63	0.37
64	0.32
65	0.26
66	0.25
67	0.3
68	0.3
69	0.29
70	0.28
71	0.27
72	0.25
73	0.23
74	0.19
75	0.14
76	0.16
77	0.16
78	0.16
79	0.16
80	0.17
81	0.18
82	0.2
83	0.23
84	0.22
85	0.21
86	0.22
87	0.25
88	0.23
89	0.29
90	0.27
91	0.23
92	0.21
93	0.22
94	0.2
95	0.17
96	0.18
97	0.12
98	0.11
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.12
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.15
111	0.16
112	0.18
113	0.2
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.21
118	0.24
119	0.24
120	0.21
121	0.19
122	0.18
123	0.19
124	0.2
125	0.2
126	0.17
127	0.17
128	0.19
129	0.19
130	0.17
131	0.18
132	0.22
133	0.26
134	0.26
135	0.3
136	0.34
137	0.34
138	0.38
139	0.39
140	0.35
141	0.3
142	0.33
143	0.33
144	0.29
145	0.28
146	0.24
147	0.21
148	0.19
149	0.2
150	0.19
151	0.15
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.13
158	0.1
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.12
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.13
171	0.16
172	0.15
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.1
179	0.07
180	0.07
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.11
188	0.13
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.13
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.12
208	0.14
209	0.16
210	0.19
211	0.21
212	0.21
213	0.2
214	0.21
215	0.2
216	0.27
217	0.3
218	0.31
219	0.35
220	0.36
221	0.39
222	0.45
223	0.51
224	0.48
225	0.46
226	0.45
227	0.47
228	0.47
229	0.45
230	0.39
231	0.31
232	0.25
233	0.22
234	0.22
235	0.14
236	0.15
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.15
241	0.19
242	0.16
243	0.15
244	0.14
245	0.13
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.1
253	0.14
254	0.16
255	0.16
256	0.14
257	0.14
258	0.15
259	0.17
260	0.17
261	0.13
262	0.11
263	0.12
264	0.14
265	0.16
266	0.17
267	0.17
268	0.22
269	0.23
270	0.25
271	0.27
272	0.31
273	0.3
274	0.28
275	0.27
276	0.23
277	0.22
278	0.22
279	0.27
280	0.25
281	0.25
282	0.25
283	0.25
284	0.26
285	0.25
286	0.23
287	0.16
288	0.12
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.11
294	0.12
295	0.11
296	0.12
297	0.13
298	0.19
299	0.19
300	0.18
301	0.14
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.13
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.1
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.06
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.08
345	0.11
346	0.11
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.09
379	0.09
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.17
386	0.16
387	0.19
388	0.18
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.15
393	0.12
394	0.12
395	0.1
396	0.11
397	0.1
398	0.12
399	0.13
400	0.16
401	0.19
402	0.2
403	0.2
404	0.22
405	0.22
406	0.21
407	0.2
408	0.17
409	0.13
410	0.12
411	0.1
412	0.08
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.07
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.08
436	0.09
437	0.09
438	0.1
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.13
443	0.15
444	0.15
445	0.16
446	0.15
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.12
451	0.1
452	0.1
453	0.08
454	0.08
455	0.06
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.04
461	0.05
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.09
466	0.1
467	0.14
468	0.16
469	0.16
470	0.16
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.15
475	0.11
476	0.15
477	0.14
478	0.15
479	0.16
480	0.16
481	0.15
482	0.14
483	0.15
484	0.11
485	0.14
486	0.15
487	0.14
488	0.17
489	0.18
490	0.17
491	0.16
492	0.14
493	0.11
494	0.11
495	0.13
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.11
502	0.1
503	0.08
504	0.1
505	0.11
506	0.18
507	0.18
508	0.21
509	0.21
510	0.22
511	0.25
512	0.24
513	0.24
514	0.19
515	0.23
516	0.2
517	0.21
518	0.22
519	0.19
520	0.17
521	0.19
522	0.19
523	0.15
524	0.15
525	0.14
526	0.13
527	0.12
528	0.14
529	0.18
530	0.19
531	0.19
532	0.18
533	0.19
534	0.21
535	0.2
536	0.19
537	0.11
538	0.09
539	0.08
540	0.08
541	0.07
542	0.05
543	0.05
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.15
551	0.18
552	0.17
553	0.17
554	0.18
555	0.19
556	0.19
557	0.2
558	0.17
559	0.14
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.13
564	0.15
565	0.13
566	0.15
567	0.16
568	0.16
569	0.16
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.09
575	0.09
576	0.12
577	0.13
578	0.14
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.11
583	0.11
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.06
591	0.05
592	0.06
593	0.06
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.1
601	0.09
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.14
606	0.15
607	0.15
608	0.14
609	0.15
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.11
614	0.11
615	0.09
616	0.08
617	0.07
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.08
631	0.09
632	0.11
633	0.11
634	0.11
635	0.13
636	0.13
637	0.13
638	0.14
639	0.13
640	0.13
641	0.15
642	0.14
643	0.14
644	0.14
645	0.15
646	0.16
647	0.16
648	0.17
649	0.17
650	0.2
651	0.17
652	0.17
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.14
657	0.14
658	0.14
659	0.15
660	0.18
661	0.18
662	0.17
663	0.17
664	0.19
665	0.23
666	0.22
667	0.24
668	0.26
669	0.27
670	0.27
671	0.26
672	0.24
673	0.18
674	0.16
675	0.14
676	0.1
677	0.11
678	0.14
679	0.15
680	0.16
681	0.16
682	0.16
683	0.16
684	0.16
685	0.13
686	0.11
687	0.13
688	0.14
689	0.15
690	0.14
691	0.14
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.12
696	0.1
697	0.09
698	0.12
699	0.13
700	0.16
701	0.21
702	0.26
703	0.3
704	0.35
705	0.43
706	0.49
707	0.55
708	0.53
709	0.52
710	0.46
711	0.42
712	0.39
713	0.35
714	0.27
715	0.26
716	0.29
717	0.25
718	0.28
719	0.32
720	0.31
721	0.32
722	0.36
723	0.37
724	0.4
725	0.41
726	0.42
727	0.43
728	0.46
729	0.44
730	0.42
731	0.42
732	0.39
733	0.4
734	0.39
735	0.35
736	0.35
737	0.32
738	0.32
739	0.29
740	0.28
741	0.28
742	0.3
743	0.31
744	0.32
745	0.32
746	0.34
747	0.33
748	0.3
749	0.28
750	0.26
751	0.23
752	0.21
753	0.24
754	0.22
755	0.23
756	0.26
757	0.33
758	0.38
759	0.38
760	0.39
761	0.4
762	0.4
763	0.36
764	0.32
765	0.28
766	0.27
767	0.3
768	0.34
769	0.33
770	0.34
771	0.42
772	0.43
773	0.42
774	0.43
775	0.4
776	0.36
777	0.39
778	0.36
779	0.28
780	0.28
781	0.26
782	0.24
783	0.22
784	0.2
785	0.17
786	0.18
787	0.17
788	0.18
789	0.21
790	0.22
791	0.23
792	0.23
793	0.21
794	0.21
795	0.25
796	0.24
797	0.21
798	0.17
799	0.16
800	0.17
801	0.16
802	0.16
803	0.14
804	0.2
805	0.2
806	0.29
807	0.34
808	0.35
809	0.36
810	0.35
811	0.36
812	0.31
813	0.32
814	0.24
815	0.21
816	0.21
817	0.23
818	0.22
819	0.2
820	0.19
821	0.17
822	0.17
823	0.2
824	0.2
825	0.19
826	0.21
827	0.29
828	0.31
829	0.33
830	0.34
831	0.3
832	0.31
833	0.29
834	0.31
835	0.24
836	0.22
837	0.22
838	0.22
839	0.21
840	0.18
841	0.2
842	0.18
843	0.17
844	0.17
845	0.24
846	0.25
847	0.31
848	0.3
849	0.3
850	0.35
851	0.36
852	0.38
853	0.32
854	0.29
855	0.26
856	0.26
857	0.27
858	0.23
859	0.21
860	0.23
861	0.25
862	0.27
863	0.24
864	0.24
865	0.22
866	0.21
867	0.22
868	0.18
869	0.22

L2GM54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer