Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L2GK13

Protein Details
Accession L2GK13    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-390LDEKDKKKIVEKTRGKAPLSBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036891  Signal_recog_part_SRP54_M_sf  
IPR004125  Signal_recog_particle_SRP54_M  
IPR022941  SRP54  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0048500  C:signal recognition particle  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF00448  SRP54  
PF02978  SRP_SPB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
CDD cd17875  SRP54_G  
Amino Acid Sequences MLTRQKVVHRIFFETLVRFLDPGSKPYEIQKEKSNVVVFVGLQGCGKTTSICKYANFYKKKGFRVGIVCADTFRAGAFDQIKQNASKIGIPYFGSPDPDPVKVAKEGVSKFRKNDFELILVDTSGRHTQEEALFAEMRDLVDAICPDNIVFVMDAGIGQSAEEQAAGFKNAVKVGGIILTKIDGASKAGGALSSVATTQCPIEFVGTGEGMDDIEKFNARRFVGKMLGMGDIDGLIERLSSIEIDKEDVIEKLTTGKFRLIDFKNIYTQIVSLGPISKMLEMIPGLGNMAIPDESKFKRIMHMFDSMTRKELESNGDVFLKEPSRIDRVARGSGTHRDLVSEMLGNFRQMSSMMKKLMANPMFAQMLQGTLDEKDKKKIVEKTRGKAPLSIFDYMNSLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.34
4 0.31
5 0.24
6 0.22
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.27
11 0.26
12 0.27
13 0.34
14 0.45
15 0.41
16 0.43
17 0.49
18 0.5
19 0.51
20 0.57
21 0.51
22 0.41
23 0.37
24 0.35
25 0.26
26 0.25
27 0.24
28 0.18
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.11
35 0.14
36 0.19
37 0.24
38 0.27
39 0.27
40 0.33
41 0.42
42 0.5
43 0.53
44 0.52
45 0.57
46 0.61
47 0.67
48 0.69
49 0.62
50 0.59
51 0.58
52 0.6
53 0.56
54 0.52
55 0.45
56 0.37
57 0.36
58 0.29
59 0.23
60 0.17
61 0.11
62 0.08
63 0.13
64 0.15
65 0.18
66 0.22
67 0.25
68 0.27
69 0.26
70 0.27
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.21
83 0.25
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.21
88 0.23
89 0.21
90 0.22
91 0.2
92 0.24
93 0.26
94 0.34
95 0.41
96 0.42
97 0.44
98 0.51
99 0.51
100 0.48
101 0.51
102 0.43
103 0.38
104 0.36
105 0.34
106 0.27
107 0.22
108 0.19
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.1
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.13
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.13
206 0.13
207 0.16
208 0.17
209 0.2
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.18
214 0.18
215 0.15
216 0.13
217 0.1
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.27
247 0.25
248 0.31
249 0.33
250 0.35
251 0.36
252 0.35
253 0.35
254 0.26
255 0.24
256 0.17
257 0.15
258 0.13
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.12
281 0.13
282 0.15
283 0.18
284 0.17
285 0.24
286 0.28
287 0.3
288 0.28
289 0.34
290 0.33
291 0.38
292 0.43
293 0.37
294 0.36
295 0.32
296 0.3
297 0.25
298 0.26
299 0.24
300 0.21
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.22
305 0.2
306 0.22
307 0.19
308 0.16
309 0.17
310 0.19
311 0.22
312 0.24
313 0.25
314 0.29
315 0.32
316 0.36
317 0.35
318 0.34
319 0.34
320 0.4
321 0.42
322 0.38
323 0.33
324 0.28
325 0.28
326 0.27
327 0.24
328 0.2
329 0.16
330 0.17
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.18
338 0.19
339 0.24
340 0.25
341 0.28
342 0.29
343 0.33
344 0.43
345 0.39
346 0.36
347 0.32
348 0.35
349 0.33
350 0.31
351 0.28
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.1
357 0.11
358 0.18
359 0.23
360 0.26
361 0.32
362 0.35
363 0.39
364 0.47
365 0.55
366 0.59
367 0.63
368 0.7
369 0.7
370 0.76
371 0.8
372 0.74
373 0.7
374 0.63
375 0.62
376 0.57
377 0.53
378 0.43
379 0.36