Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RRM2

Protein Details
Accession E3RRM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-363LCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-278GKKRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 7, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pte:PTT_11476  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MSNSVVGGVYQMIMEKVIQASQNDFEESGVDQSTLEEMKQGWQERLSALKIAHFPWDPAPEQSRQPPTVPSNVKVDNEMPPVSGSQEPSFPNVGVKMEGGYQQPLTNYPQAPPANNGYTGYEQNNELARQRAAALVQQRVQQHGHGHQQNFPNLAQQGHLPQMPMQSQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRPPQQQQMPQQRPQQGHLYTSQNDGSGDAMADWEALKAARAAAAVDRMAADDFMRARVDAMAMRQDSGLMVPLDSMPKGKKRKAAVRVLQEQDAEALSSVPGPARFDGDDEAKPEEDPDDAINSDLDDSEDELGDGDNSDDDMVDYMLCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGILTTNKKEYLFHKANAELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.09
4 0.11
5 0.14
6 0.14
7 0.18
8 0.2
9 0.22
10 0.22
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.13
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.15
26 0.21
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.27
32 0.31
33 0.28
34 0.25
35 0.23
36 0.25
37 0.27
38 0.26
39 0.3
40 0.26
41 0.26
42 0.27
43 0.31
44 0.28
45 0.3
46 0.33
47 0.3
48 0.35
49 0.41
50 0.43
51 0.41
52 0.41
53 0.43
54 0.43
55 0.5
56 0.49
57 0.44
58 0.44
59 0.45
60 0.44
61 0.4
62 0.39
63 0.34
64 0.34
65 0.32
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.18
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.22
76 0.23
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.18
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.11
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.2
96 0.27
97 0.28
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.27
102 0.27
103 0.27
104 0.22
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.19
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.21
124 0.24
125 0.24
126 0.26
127 0.26
128 0.25
129 0.25
130 0.26
131 0.32
132 0.34
133 0.35
134 0.37
135 0.41
136 0.41
137 0.39
138 0.34
139 0.29
140 0.24
141 0.23
142 0.18
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.15
147 0.11
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.16
153 0.19
154 0.22
155 0.28
156 0.33
157 0.37
158 0.4
159 0.47
160 0.5
161 0.51
162 0.55
163 0.56
164 0.56
165 0.57
166 0.6
167 0.58
168 0.59
169 0.59
170 0.59
171 0.59
172 0.59
173 0.59
174 0.59
175 0.59
176 0.59
177 0.59
178 0.6
179 0.59
180 0.59
181 0.6
182 0.61
183 0.62
184 0.59
185 0.6
186 0.58
187 0.58
188 0.62
189 0.65
190 0.63
191 0.62
192 0.64
193 0.62
194 0.58
195 0.54
196 0.52
197 0.42
198 0.38
199 0.36
200 0.33
201 0.29
202 0.29
203 0.27
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.13
208 0.09
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.12
258 0.12
259 0.21
260 0.29
261 0.33
262 0.39
263 0.46
264 0.56
265 0.63
266 0.7
267 0.7
268 0.71
269 0.76
270 0.72
271 0.66
272 0.56
273 0.47
274 0.37
275 0.29
276 0.2
277 0.11
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.14
289 0.17
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.22
294 0.2
295 0.2
296 0.19
297 0.16
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.17
334 0.24
335 0.29
336 0.37
337 0.46
338 0.56
339 0.66
340 0.74
341 0.76
342 0.79
343 0.84
344 0.82
345 0.79
346 0.8
347 0.74
348 0.73
349 0.66
350 0.65
351 0.64
352 0.63
353 0.6
354 0.58
355 0.55
356 0.47
357 0.47
358 0.42
359 0.43
360 0.45
361 0.45
362 0.43
363 0.45