Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L2GSH8

Protein Details
Accession L2GSH8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-334MVRFKWACVKRNDEKRRSAKVYGKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 4.833, mito 4.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001352  RNase_HII/HIII  
IPR024567  RNase_HII/HIII_dom  
IPR023160  RNase_HII_hlx-loop-hlx_cap_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01351  RNase_HII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51975  RNASE_H_2  
Amino Acid Sequences MRKLQGLNNGVANRKKDTAAKPNTALKRNDGLSAIKSKKRQMVPNVHILENKIFTPHSEDNLAVNKNIIHSSIRSTGKRLTIGIDEAGRGPVLGYLVYAALIIEEENDITNPTVSSALKDVHSDIKMCDSKLLLPKQRETIYDQIRNTHSYVWYALHPEYISTEMDRRNLNDISISAVVYILRIIFEALSTENGNKRRFWDCQERTNTGIGRSDEIGKNVSLRRDGVENVFIDALGNTDKYLQILQRHFPSVPFTIKPKADSIYRCVGGASIIAKVVRDDLLKQFSAECGSGYPSDWRTVKWLDTNRECEMVRFKWACVKRNDEKRRSAKVYGKYDSLHFCDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.43
4 0.48
5 0.52
6 0.56
7 0.59
8 0.61
9 0.68
10 0.73
11 0.72
12 0.66
13 0.61
14 0.59
15 0.54
16 0.5
17 0.44
18 0.38
19 0.36
20 0.43
21 0.44
22 0.43
23 0.46
24 0.5
25 0.56
26 0.61
27 0.65
28 0.65
29 0.69
30 0.69
31 0.74
32 0.71
33 0.65
34 0.59
35 0.52
36 0.46
37 0.36
38 0.31
39 0.23
40 0.19
41 0.18
42 0.25
43 0.25
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.25
48 0.32
49 0.32
50 0.24
51 0.22
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.17
56 0.13
57 0.13
58 0.18
59 0.25
60 0.3
61 0.3
62 0.32
63 0.36
64 0.38
65 0.39
66 0.34
67 0.29
68 0.26
69 0.26
70 0.25
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.1
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.22
113 0.23
114 0.22
115 0.22
116 0.17
117 0.21
118 0.28
119 0.34
120 0.33
121 0.34
122 0.37
123 0.41
124 0.42
125 0.4
126 0.37
127 0.39
128 0.4
129 0.43
130 0.41
131 0.4
132 0.4
133 0.4
134 0.36
135 0.29
136 0.22
137 0.17
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.12
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.23
184 0.26
185 0.28
186 0.33
187 0.4
188 0.39
189 0.47
190 0.52
191 0.51
192 0.49
193 0.51
194 0.45
195 0.35
196 0.35
197 0.27
198 0.23
199 0.21
200 0.23
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.16
205 0.18
206 0.19
207 0.2
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.11
230 0.17
231 0.21
232 0.25
233 0.27
234 0.3
235 0.3
236 0.29
237 0.3
238 0.27
239 0.28
240 0.26
241 0.27
242 0.31
243 0.32
244 0.34
245 0.32
246 0.31
247 0.33
248 0.33
249 0.35
250 0.36
251 0.35
252 0.33
253 0.3
254 0.27
255 0.21
256 0.2
257 0.15
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.13
267 0.18
268 0.22
269 0.22
270 0.23
271 0.22
272 0.21
273 0.23
274 0.2
275 0.15
276 0.11
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.18
281 0.17
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.27
286 0.29
287 0.32
288 0.36
289 0.42
290 0.46
291 0.53
292 0.57
293 0.55
294 0.56
295 0.52
296 0.48
297 0.47
298 0.39
299 0.41
300 0.37
301 0.35
302 0.4
303 0.46
304 0.5
305 0.51
306 0.58
307 0.59
308 0.68
309 0.78
310 0.77
311 0.81
312 0.83
313 0.86
314 0.84
315 0.82
316 0.8
317 0.79
318 0.8
319 0.74
320 0.69
321 0.6
322 0.59
323 0.57