FuNGI

L2GQM9

Protein Details

Accession

L2GQM9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-455	SSPHGAGRKISRHKARKLIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
446-449	SRHK

Subcellular Location(s)

cyto 18, cyto_nucl 15, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001233 RtcB IPR036025 RtcB-like_sf
Gene Ontology	GO:0005525 F:GTP binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008452 F:RNA ligase activity GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01139 RtcB

Amino Acid Sequences

MKENNAEKEIAQCNEEQEFTSKMAELYKKEEDKKYLDLTDQVRLLIPLKYSSIFPGKNVVEQMFAVTRLPHVHSVVGLPDIHLGYAFPIGSVVGASIVVPEGVGNDINCGVRMVRTRSNYRDVDMAEVARQLFDAIPSGIGGDTVNTIIDEIVNALNKGVADTQNRRAAFTDMKLINEVCNEGVDFLVKHGIVSDERDRIERGGRFPSDSRMLSQKAKAKGLKQLGSLGAGNHFLEIQRVAEVYDNDADFAVDELVFMIHTGSRGLGFEVCESATQVAASTRCITESEIGNESHDIQAVRKSIGLCSASISASGSSENLSYFEAHESEDYLLEMGCAANYAFCNRAIISKKVEEVLGQWNVKCELVYDVGHNSLIRENIDGRECFVHRKGAARALPPNHPELRCNREKGQPIPIGGSMGTSSYLLYAQDTAKSLFSSPHGAGRKISRHKARKLITMEQLRQVMGDIILMSKSEKGAIEEAPMVYKDIDDVVDAAVELGLVKKAVKLEPLAVIKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.3
3	0.24
4	0.21
5	0.22
6	0.21
7	0.22
8	0.19
9	0.18
10	0.24
11	0.27
12	0.27
13	0.31
14	0.39
15	0.45
16	0.52
17	0.57
18	0.56
19	0.56
20	0.59
21	0.58
22	0.52
23	0.47
24	0.47
25	0.43
26	0.43
27	0.39
28	0.33
29	0.28
30	0.27
31	0.26
32	0.22
33	0.2
34	0.16
35	0.17
36	0.18
37	0.18
38	0.22
39	0.29
40	0.27
41	0.26
42	0.33
43	0.32
44	0.34
45	0.36
46	0.32
47	0.25
48	0.25
49	0.27
50	0.2
51	0.19
52	0.16
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.19
57	0.19
58	0.19
59	0.19
60	0.18
61	0.19
62	0.19
63	0.18
64	0.15
65	0.12
66	0.13
67	0.13
68	0.12
69	0.11
70	0.09
71	0.08
72	0.1
73	0.09
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.05
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.04
84	0.04
85	0.04
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.05
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.11
99	0.17
100	0.21
101	0.27
102	0.33
103	0.4
104	0.44
105	0.52
106	0.5
107	0.47
108	0.45
109	0.39
110	0.37
111	0.32
112	0.27
113	0.2
114	0.2
115	0.18
116	0.14
117	0.13
118	0.1
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.04
138	0.05
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.11
148	0.17
149	0.21
150	0.28
151	0.34
152	0.34
153	0.34
154	0.34
155	0.33
156	0.31
157	0.27
158	0.29
159	0.24
160	0.25
161	0.25
162	0.24
163	0.21
164	0.19
165	0.18
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.08
180	0.13
181	0.16
182	0.17
183	0.18
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.24
188	0.23
189	0.22
190	0.25
191	0.25
192	0.27
193	0.27
194	0.3
195	0.29
196	0.27
197	0.26
198	0.25
199	0.28
200	0.28
201	0.32
202	0.34
203	0.33
204	0.39
205	0.4
206	0.37
207	0.42
208	0.46
209	0.43
210	0.37
211	0.36
212	0.3
213	0.29
214	0.27
215	0.19
216	0.14
217	0.12
218	0.11
219	0.08
220	0.08
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.14
275	0.15
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.12
281	0.12
282	0.1
283	0.08
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.16
291	0.16
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.08
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.15
333	0.19
334	0.21
335	0.25
336	0.26
337	0.27
338	0.26
339	0.26
340	0.2
341	0.19
342	0.22
343	0.24
344	0.23
345	0.22
346	0.23
347	0.24
348	0.23
349	0.21
350	0.15
351	0.11
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.14
356	0.14
357	0.15
358	0.14
359	0.13
360	0.12
361	0.13
362	0.11
363	0.12
364	0.13
365	0.15
366	0.19
367	0.18
368	0.18
369	0.21
370	0.22
371	0.25
372	0.25
373	0.28
374	0.25
375	0.31
376	0.32
377	0.36
378	0.39
379	0.39
380	0.44
381	0.42
382	0.48
383	0.45
384	0.47
385	0.46
386	0.43
387	0.42
388	0.42
389	0.47
390	0.48
391	0.51
392	0.5
393	0.51
394	0.57
395	0.57
396	0.59
397	0.55
398	0.49
399	0.46
400	0.42
401	0.35
402	0.28
403	0.25
404	0.15
405	0.12
406	0.11
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.15
421	0.15
422	0.16
423	0.19
424	0.18
425	0.25
426	0.29
427	0.29
428	0.32
429	0.38
430	0.46
431	0.5
432	0.59
433	0.61
434	0.67
435	0.74
436	0.8
437	0.78
438	0.77
439	0.75
440	0.74
441	0.73
442	0.73
443	0.68
444	0.65
445	0.61
446	0.52
447	0.44
448	0.37
449	0.29
450	0.19
451	0.16
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.11
460	0.11
461	0.13
462	0.16
463	0.16
464	0.19
465	0.2
466	0.2
467	0.2
468	0.2
469	0.18
470	0.16
471	0.15
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.09
489	0.13
490	0.15
491	0.19
492	0.2
493	0.23
494	0.3

L2GQM9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer