Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L2GRP4

Protein Details
Accession L2GRP4    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-263SNRGHVSREMKKRMKKCTKMSRKKADAWCAHCHydrophilic
291-310GVVRPTFMKRENIRRRRKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-248MKKRMKKC
250-250K
299-310KRENIRRRRKKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.666, cyto 6, cyto_mito 5.499, cyto_pero 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000048  IQ_motif_EF-hand-BS  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50096  IQ  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MERMYGHNDITSGYEKHFGSGRDEDKICGQVFGVHVVEGNGTERGDGVMMSGIDDVMICTYNNEIGNRNSRGTVNINNIAYDNFTNNNLINPNLITNTNLNINYDQVNSHSTATLHDTHQVPYTYGMMSGTASNGMVNGAIGDCIVNTHGYDEYGGMIDDRIGSNFNFDNNFSRAGNNLSFDRNDNNFNFDRNSTALTPLQMLTMSWHPSVQTPFPSMTNTLYKRPSPVQSSNRGHVSREMKKRMKKCTKMSRKKADAWCAHCNTRETSLWRRLNGRFVCNACGLYYKMHGVVRPTFMKRENIRRRRKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.25
6 0.27
7 0.34
8 0.35
9 0.37
10 0.38
11 0.37
12 0.37
13 0.4
14 0.34
15 0.27
16 0.24
17 0.2
18 0.2
19 0.22
20 0.19
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.11
26 0.12
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.1
49 0.12
50 0.13
51 0.16
52 0.19
53 0.27
54 0.29
55 0.3
56 0.28
57 0.27
58 0.29
59 0.3
60 0.32
61 0.31
62 0.34
63 0.33
64 0.31
65 0.31
66 0.28
67 0.25
68 0.2
69 0.15
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.21
107 0.2
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.14
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.18
171 0.21
172 0.2
173 0.23
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.2
178 0.2
179 0.17
180 0.19
181 0.15
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.16
186 0.14
187 0.13
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.12
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.16
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.19
205 0.2
206 0.26
207 0.26
208 0.29
209 0.32
210 0.32
211 0.35
212 0.38
213 0.4
214 0.4
215 0.46
216 0.48
217 0.55
218 0.59
219 0.6
220 0.63
221 0.58
222 0.52
223 0.51
224 0.52
225 0.51
226 0.56
227 0.61
228 0.62
229 0.7
230 0.76
231 0.79
232 0.81
233 0.82
234 0.83
235 0.84
236 0.87
237 0.9
238 0.93
239 0.93
240 0.89
241 0.89
242 0.87
243 0.86
244 0.83
245 0.79
246 0.78
247 0.72
248 0.68
249 0.63
250 0.57
251 0.5
252 0.47
253 0.45
254 0.41
255 0.44
256 0.51
257 0.52
258 0.53
259 0.56
260 0.54
261 0.59
262 0.58
263 0.55
264 0.52
265 0.49
266 0.49
267 0.44
268 0.42
269 0.33
270 0.31
271 0.27
272 0.22
273 0.23
274 0.21
275 0.23
276 0.24
277 0.25
278 0.27
279 0.3
280 0.34
281 0.39
282 0.4
283 0.42
284 0.45
285 0.53
286 0.56
287 0.63
288 0.67
289 0.71
290 0.79