FuNGI

L2GUW6

Protein Details

Accession

L2GUW6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
442-461	DYDKNVVEKVKNKFRRKKKG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-461	VKNKFRRKKKG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MIIDLCSALLHKLNKNLELLNSAPSIPTHLYGPLYQQVCRLNTFDEDLIMARIDKIYKSLNNSVVVPPTLVKLYHGSGEHTDNDTVTGALVGLIGQNIIKPLIEDVEMHMRYECGCEVPEMPASLCVFGENLAWVDESNVNSFLESVRNSKHVLMHAYLHTYRTYLPFTCVFLVQTDRGAYVVDALEHKRLVAMLSYDCTYRKYMNGKTLLALREEFRVVPCCCSLVKVRECYFVDFRIRPMQGELLRLDIAPEKDDEAVLESVKQTEERISAQNNITGGKRKALDDILKLRDFIAKNNNESVNYVLTERQLSLILEKMPKTKIQFKSVLPRCSPILRAHIEDILFILNEVVENDGTQPCSGVEDCSSRCTENGSSTIGGGNAVERKSDSADPSGHHGMAKEPDKGEQKLNDRLERIELRSHSANHLEIDSNIAKVKYHTFDYDKNVVEKVKNKFRRKKKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.33
7	0.29
8	0.25
9	0.23
10	0.2
11	0.18
12	0.21
13	0.18
14	0.18
15	0.15
16	0.16
17	0.18
18	0.19
19	0.23
20	0.26
21	0.26
22	0.26
23	0.29
24	0.33
25	0.33
26	0.35
27	0.32
28	0.28
29	0.28
30	0.31
31	0.26
32	0.21
33	0.19
34	0.18
35	0.17
36	0.15
37	0.13
38	0.1
39	0.11
40	0.12
41	0.11
42	0.14
43	0.19
44	0.22
45	0.29
46	0.35
47	0.38
48	0.39
49	0.41
50	0.4
51	0.38
52	0.34
53	0.28
54	0.22
55	0.19
56	0.18
57	0.16
58	0.15
59	0.15
60	0.16
61	0.19
62	0.19
63	0.2
64	0.22
65	0.25
66	0.26
67	0.26
68	0.25
69	0.2
70	0.21
71	0.18
72	0.15
73	0.12
74	0.09
75	0.06
76	0.05
77	0.05
78	0.04
79	0.04
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.04
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.06
89	0.07
90	0.08
91	0.08
92	0.11
93	0.2
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.19
98	0.18
99	0.2
100	0.17
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.11
105	0.13
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.12
113	0.11
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.08
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.12
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.14
135	0.16
136	0.18
137	0.19
138	0.22
139	0.21
140	0.23
141	0.22
142	0.23
143	0.22
144	0.25
145	0.24
146	0.22
147	0.2
148	0.17
149	0.17
150	0.16
151	0.18
152	0.14
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.19
157	0.18
158	0.16
159	0.14
160	0.16
161	0.13
162	0.13
163	0.12
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.09
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.1
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.15
190	0.21
191	0.24
192	0.3
193	0.34
194	0.32
195	0.32
196	0.36
197	0.32
198	0.27
199	0.24
200	0.18
201	0.16
202	0.16
203	0.15
204	0.11
205	0.16
206	0.15
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.16
212	0.19
213	0.21
214	0.24
215	0.28
216	0.3
217	0.35
218	0.36
219	0.37
220	0.35
221	0.31
222	0.32
223	0.26
224	0.27
225	0.27
226	0.27
227	0.23
228	0.23
229	0.24
230	0.21
231	0.23
232	0.21
233	0.16
234	0.16
235	0.15
236	0.15
237	0.13
238	0.12
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.06
254	0.08
255	0.09
256	0.11
257	0.13
258	0.15
259	0.18
260	0.19
261	0.2
262	0.19
263	0.19
264	0.18
265	0.21
266	0.2
267	0.2
268	0.21
269	0.2
270	0.22
271	0.25
272	0.26
273	0.26
274	0.32
275	0.34
276	0.33
277	0.33
278	0.31
279	0.32
280	0.29
281	0.28
282	0.31
283	0.29
284	0.31
285	0.35
286	0.36
287	0.3
288	0.31
289	0.29
290	0.2
291	0.18
292	0.16
293	0.13
294	0.12
295	0.13
296	0.12
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.12
302	0.14
303	0.16
304	0.17
305	0.2
306	0.2
307	0.24
308	0.28
309	0.35
310	0.37
311	0.41
312	0.46
313	0.46
314	0.56
315	0.61
316	0.63
317	0.55
318	0.52
319	0.47
320	0.45
321	0.44
322	0.37
323	0.36
324	0.32
325	0.33
326	0.32
327	0.32
328	0.29
329	0.26
330	0.23
331	0.16
332	0.13
333	0.1
334	0.08
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.08
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.17
352	0.18
353	0.21
354	0.23
355	0.21
356	0.21
357	0.24
358	0.23
359	0.22
360	0.23
361	0.22
362	0.21
363	0.21
364	0.21
365	0.17
366	0.15
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.14
374	0.18
375	0.21
376	0.21
377	0.21
378	0.24
379	0.24
380	0.31
381	0.33
382	0.29
383	0.27
384	0.25
385	0.24
386	0.3
387	0.33
388	0.3
389	0.28
390	0.34
391	0.39
392	0.42
393	0.44
394	0.44
395	0.46
396	0.51
397	0.58
398	0.57
399	0.53
400	0.52
401	0.53
402	0.51
403	0.47
404	0.45
405	0.4
406	0.4
407	0.43
408	0.44
409	0.41
410	0.39
411	0.38
412	0.32
413	0.33
414	0.28
415	0.23
416	0.27
417	0.23
418	0.21
419	0.22
420	0.2
421	0.18
422	0.2
423	0.26
424	0.24
425	0.27
426	0.32
427	0.35
428	0.41
429	0.48
430	0.53
431	0.5
432	0.48
433	0.48
434	0.46
435	0.47
436	0.48
437	0.5
438	0.54
439	0.61
440	0.7
441	0.77

L2GUW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer