Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L2GWH0

Protein Details
Accession L2GWH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-66IVLLNKYLLRHRQRKVKKIREKIQKHFDELKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-56HRQRKVKKIREK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MHCSFFSYLILIRKLEFQIQSIDEIRRCKDNSPKIVLLNKYLLRHRQRKVKKIREKIQKHFDELKERDEDPETVLDHFNEDFKSVEDGVVRSTLRRRLLPRIEALFSAQENYGTCLDLRFLEAYYAVSYEEVLQKVTNFALEIENEFEHLFALLHLRHYLKDFVYKSKPVIRHKKISRLLSCAESEHKVWNTFENKVYCMFCMVDIAKSVFEYHAAGKKHNKAKIAFLKNMEATDNDRDYKVTKCINVYLKLRCEYVRVTSTYVNRLEAQVKLLLTFLETELKLAVSVQGTESVMNIEKEKKIYNTRIYRDETGNPIPRWLYKQRGLNVEYICEICKNCVYKGRKEFERHFNGDKHKHFLVELGIASDFEKYHGISQIKNALKLRDRWK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.3
4 0.25
5 0.28
6 0.29
7 0.32
8 0.31
9 0.34
10 0.32
11 0.36
12 0.36
13 0.38
14 0.39
15 0.41
16 0.48
17 0.52
18 0.57
19 0.61
20 0.63
21 0.62
22 0.68
23 0.64
24 0.58
25 0.56
26 0.52
27 0.48
28 0.5
29 0.54
30 0.56
31 0.63
32 0.66
33 0.69
34 0.75
35 0.8
36 0.85
37 0.87
38 0.87
39 0.89
40 0.92
41 0.92
42 0.92
43 0.91
44 0.91
45 0.85
46 0.82
47 0.8
48 0.76
49 0.75
50 0.67
51 0.63
52 0.56
53 0.51
54 0.47
55 0.4
56 0.36
57 0.27
58 0.28
59 0.23
60 0.21
61 0.21
62 0.18
63 0.17
64 0.17
65 0.16
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.15
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.19
80 0.24
81 0.27
82 0.32
83 0.35
84 0.43
85 0.5
86 0.52
87 0.53
88 0.52
89 0.49
90 0.44
91 0.41
92 0.33
93 0.26
94 0.23
95 0.17
96 0.13
97 0.12
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.04
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.13
148 0.2
149 0.21
150 0.25
151 0.29
152 0.3
153 0.31
154 0.36
155 0.42
156 0.45
157 0.54
158 0.55
159 0.6
160 0.63
161 0.7
162 0.71
163 0.72
164 0.65
165 0.59
166 0.54
167 0.47
168 0.43
169 0.34
170 0.29
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.25
181 0.23
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.18
186 0.16
187 0.14
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.23
205 0.31
206 0.37
207 0.39
208 0.42
209 0.38
210 0.46
211 0.54
212 0.54
213 0.5
214 0.45
215 0.46
216 0.42
217 0.41
218 0.32
219 0.23
220 0.2
221 0.2
222 0.21
223 0.18
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.22
229 0.2
230 0.2
231 0.21
232 0.27
233 0.31
234 0.36
235 0.38
236 0.38
237 0.4
238 0.4
239 0.4
240 0.34
241 0.31
242 0.27
243 0.28
244 0.26
245 0.23
246 0.24
247 0.27
248 0.29
249 0.33
250 0.32
251 0.28
252 0.25
253 0.26
254 0.25
255 0.21
256 0.21
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.17
286 0.19
287 0.22
288 0.26
289 0.32
290 0.39
291 0.47
292 0.53
293 0.56
294 0.61
295 0.63
296 0.62
297 0.58
298 0.54
299 0.51
300 0.5
301 0.53
302 0.46
303 0.44
304 0.41
305 0.4
306 0.42
307 0.43
308 0.43
309 0.41
310 0.49
311 0.52
312 0.58
313 0.58
314 0.57
315 0.51
316 0.45
317 0.4
318 0.33
319 0.28
320 0.23
321 0.21
322 0.17
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.32
327 0.36
328 0.44
329 0.53
330 0.59
331 0.62
332 0.68
333 0.74
334 0.76
335 0.8
336 0.76
337 0.73
338 0.72
339 0.73
340 0.75
341 0.7
342 0.66
343 0.58
344 0.53
345 0.47
346 0.42
347 0.35
348 0.29
349 0.25
350 0.2
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.13
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.14
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.3
364 0.38
365 0.4
366 0.45
367 0.46
368 0.47
369 0.52