FuNGI

L8FXL1

Protein Details

Accession

L8FXL1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
427-450	EMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYE	Basic
535-560	ETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-445	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
487-487	K
517-521	HKKHN
543-549	RKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSGGQPPKIIRRAKADPFATYKKPVVRPQAAPRSRQQNQNGLTALNKPPPLPRPLPRYPGNNRAADPAGPISNAPPQPQLDFTRKSNIGEYEDFALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKKVDPTNSDDFIKPVSLHRRDPRQPPAGKVAKDEDTVVGEPIDDKEREKQEIARAAKEAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQTEEEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKQTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGTNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTLTIEEAEAEMNKKSKANRWVMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATVEPENDEDTKLAAEKIKREQLGANLFGDADEEEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYESDSSNPYSSSSGDETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGVPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGTSTRRSGSPHPSSSAPAGGVSPRKSSIVKLHVSSSRLSDIQANAPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGTSASPSRAGSPTNGSRAGSPAQAQGAASPIRPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.32
4	0.32
5	0.33
6	0.38
7	0.4
8	0.48
9	0.49
10	0.51
11	0.56
12	0.6
13	0.58
14	0.59
15	0.66
16	0.65
17	0.7
18	0.63
19	0.61
20	0.63
21	0.65
22	0.61
23	0.57
24	0.55
25	0.55
26	0.6
27	0.62
28	0.64
29	0.65
30	0.68
31	0.73
32	0.78
33	0.75
34	0.72
35	0.72
36	0.72
37	0.7
38	0.72
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.66
43	0.59
44	0.49
45	0.45
46	0.42
47	0.4
48	0.36
49	0.34
50	0.29
51	0.35
52	0.39
53	0.45
54	0.47
55	0.5
56	0.53
57	0.59
58	0.66
59	0.66
60	0.7
61	0.69
62	0.72
63	0.71
64	0.67
65	0.6
66	0.58
67	0.53
68	0.44
69	0.39
70	0.32
71	0.26
72	0.22
73	0.21
74	0.18
75	0.23
76	0.25
77	0.24
78	0.25
79	0.26
80	0.27
81	0.32
82	0.35
83	0.35
84	0.38
85	0.39
86	0.44
87	0.44
88	0.44
89	0.44
90	0.42
91	0.4
92	0.37
93	0.36
94	0.31
95	0.29
96	0.27
97	0.23
98	0.21
99	0.16
100	0.16
101	0.19
102	0.19
103	0.2
104	0.21
105	0.26
106	0.29
107	0.39
108	0.42
109	0.43
110	0.47
111	0.47
112	0.47
113	0.47
114	0.42
115	0.38
116	0.39
117	0.4
118	0.43
119	0.46
120	0.51
121	0.53
122	0.61
123	0.61
124	0.62
125	0.62
126	0.6
127	0.6
128	0.56
129	0.49
130	0.41
131	0.37
132	0.31
133	0.25
134	0.23
135	0.3
136	0.32
137	0.4
138	0.47
139	0.56
140	0.61
141	0.69
142	0.71
143	0.71
144	0.7
145	0.66
146	0.68
147	0.66
148	0.6
149	0.55
150	0.51
151	0.44
152	0.41
153	0.38
154	0.29
155	0.24
156	0.24
157	0.2
158	0.15
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.15
163	0.12
164	0.13
165	0.2
166	0.24
167	0.27
168	0.29
169	0.31
170	0.34
171	0.42
172	0.43
173	0.38
174	0.36
175	0.37
176	0.39
177	0.38
178	0.32
179	0.24
180	0.22
181	0.2
182	0.19
183	0.19
184	0.16
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.1
197	0.11
198	0.12
199	0.13
200	0.15
201	0.19
202	0.24
203	0.26
204	0.31
205	0.37
206	0.41
207	0.49
208	0.51
209	0.5
210	0.51
211	0.56
212	0.55
213	0.55
214	0.55
215	0.47
216	0.47
217	0.45
218	0.41
219	0.37
220	0.33
221	0.26
222	0.23
223	0.21
224	0.19
225	0.19
226	0.18
227	0.17
228	0.15
229	0.15
230	0.14
231	0.14
232	0.15
233	0.14
234	0.16
235	0.15
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.15
242	0.2
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.19
248	0.2
249	0.16
250	0.1
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.08
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.17
275	0.25
276	0.24
277	0.28
278	0.31
279	0.37
280	0.4
281	0.47
282	0.51
283	0.53
284	0.58
285	0.59
286	0.61
287	0.54
288	0.57
289	0.51
290	0.43
291	0.34
292	0.28
293	0.23
294	0.2
295	0.19
296	0.12
297	0.11
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.12
302	0.13
303	0.19
304	0.28
305	0.36
306	0.37
307	0.42
308	0.47
309	0.47
310	0.52
311	0.5
312	0.45
313	0.38
314	0.37
315	0.31
316	0.25
317	0.23
318	0.2
319	0.17
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.16
324	0.17
325	0.17
326	0.14
327	0.13
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.08
337	0.1
338	0.16
339	0.25
340	0.29
341	0.35
342	0.38
343	0.42
344	0.44
345	0.47
346	0.48
347	0.43
348	0.41
349	0.36
350	0.33
351	0.29
352	0.26
353	0.22
354	0.16
355	0.12
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.11
382	0.14
383	0.19
384	0.24
385	0.24
386	0.25
387	0.25
388	0.28
389	0.3
390	0.28
391	0.23
392	0.18
393	0.18
394	0.16
395	0.15
396	0.09
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.08
409	0.08
410	0.12
411	0.19
412	0.21
413	0.31
414	0.38
415	0.44
416	0.5
417	0.56
418	0.62
419	0.66
420	0.72
421	0.7
422	0.74
423	0.76
424	0.79
425	0.78
426	0.8
427	0.8
428	0.82
429	0.8
430	0.8
431	0.81
432	0.77
433	0.78
434	0.72
435	0.67
436	0.6
437	0.55
438	0.47
439	0.4
440	0.36
441	0.3
442	0.24
443	0.19
444	0.17
445	0.15
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.15
452	0.17
453	0.17
454	0.15
455	0.13
456	0.12
457	0.12
458	0.17
459	0.22
460	0.22
461	0.24
462	0.28
463	0.3
464	0.32
465	0.36
466	0.37
467	0.39
468	0.44
469	0.49
470	0.52
471	0.54
472	0.57
473	0.54
474	0.52
475	0.49
476	0.51
477	0.46
478	0.44
479	0.41
480	0.39
481	0.38
482	0.34
483	0.28
484	0.2
485	0.18
486	0.14
487	0.14
488	0.12
489	0.12
490	0.13
491	0.14
492	0.15
493	0.21
494	0.27
495	0.33
496	0.33
497	0.35
498	0.4
499	0.49
500	0.54
501	0.57
502	0.55
503	0.6
504	0.68
505	0.73
506	0.77
507	0.77
508	0.79
509	0.77
510	0.78
511	0.76
512	0.77
513	0.75
514	0.68
515	0.59
516	0.52
517	0.46
518	0.4
519	0.31
520	0.23
521	0.21
522	0.18
523	0.19
524	0.18
525	0.16
526	0.19
527	0.22
528	0.27
529	0.34
530	0.45
531	0.51
532	0.59
533	0.69
534	0.77
535	0.84
536	0.89
537	0.89
538	0.88
539	0.87
540	0.87
541	0.83
542	0.73
543	0.64
544	0.54
545	0.48
546	0.41
547	0.39
548	0.31
549	0.27
550	0.29
551	0.34
552	0.38
553	0.44
554	0.49
555	0.47
556	0.47
557	0.46
558	0.45
559	0.43
560	0.38
561	0.28
562	0.2
563	0.17
564	0.19
565	0.23
566	0.22
567	0.23
568	0.22
569	0.24
570	0.25
571	0.28
572	0.32
573	0.34
574	0.37
575	0.36
576	0.4
577	0.42
578	0.43
579	0.4
580	0.35
581	0.31
582	0.27
583	0.26
584	0.24
585	0.22
586	0.27
587	0.3
588	0.28
589	0.26
590	0.26
591	0.25
592	0.22
593	0.21
594	0.15
595	0.13
596	0.14
597	0.13
598	0.14
599	0.14
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.19
605	0.18
606	0.18
607	0.24
608	0.27
609	0.33
610	0.4
611	0.46
612	0.47
613	0.54
614	0.55
615	0.57
616	0.55
617	0.51
618	0.48
619	0.48
620	0.41
621	0.36
622	0.34
623	0.31
624	0.31
625	0.31
626	0.27
627	0.28
628	0.32
629	0.35
630	0.36
631	0.33
632	0.32
633	0.35
634	0.34
635	0.28
636	0.24
637	0.22
638	0.21
639	0.21
640	0.2
641	0.17
642	0.19
643	0.18
644	0.16
645	0.15
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.14
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.12
654	0.13
655	0.13
656	0.13
657	0.11
658	0.07
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.04
672	0.05
673	0.07
674	0.11
675	0.13
676	0.21
677	0.28
678	0.34
679	0.43
680	0.5
681	0.56
682	0.61
683	0.65
684	0.68
685	0.67
686	0.68
687	0.64
688	0.61
689	0.57
690	0.55
691	0.58
692	0.52
693	0.54
694	0.56
695	0.57
696	0.53
697	0.54
698	0.53
699	0.46
700	0.43
701	0.42
702	0.38
703	0.36
704	0.39
705	0.42

L8FXL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer