Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8GD29

Protein Details
Accession L8GD29    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-460TNAPSKPTTSQKKSPPKPAAKAAKKGGHydrophilic
533-554TSEERAQRKREELKRQLEEKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-472QKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKSDPP
493-563PKATKSRLGRIGHKPPKEEPAADDESRGRTEAKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 7, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAVSWRPFMISAIDSRMPPLLISTIFTADSYKIYLTDLAHLWCEDLDRRSILRRSIAEDTNIDPSEDAGQLKLFLDKISLGLEGGKDVDLLLGLDSHVGKESSTGARNLEINMSIALPKPLLPLNWTVRLCSCPQSDFATHFTIPLLYAQNARLKELDSLVGLLRDKDNVIQKLVDKLEATGAELGHLFPGVAGKGGRKIPRRVVEEKVKGLEVFAQEQWRNTMRNAEAEDEHAGVKTIIQGAFTKNSPVGSLAHGAELPCRFEKWWDQLKDGAIPLSTPKDGGKIADAGAGAEDVKAEPTDADMDTTEDEGTEGQADDFQVAATPPSSSRKPTRKQELSDDDTDDSDDLGASQSQQHVTIRDSFPAPKEEVRSETKKIGAIGGAEKASKTATKMKPEAEPEPDPEPEPVARATRSHKQDDADDDETETEDEGTNAPSKPTTSQKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKSDPPPVPASPSKEDAPDTQTSEPPPKATKSRLGRIGHKPPKEEPAADDESRGRTEAKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.23
5 0.2
6 0.19
7 0.16
8 0.14
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.12
20 0.13
21 0.16
22 0.15
23 0.18
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.3
37 0.35
38 0.36
39 0.39
40 0.39
41 0.42
42 0.46
43 0.47
44 0.43
45 0.4
46 0.38
47 0.38
48 0.36
49 0.3
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.2
54 0.18
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.12
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.12
89 0.16
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.21
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.16
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.2
111 0.24
112 0.33
113 0.32
114 0.32
115 0.32
116 0.34
117 0.34
118 0.33
119 0.3
120 0.23
121 0.25
122 0.28
123 0.29
124 0.29
125 0.3
126 0.29
127 0.26
128 0.25
129 0.23
130 0.18
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.21
138 0.21
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.17
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.2
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.23
160 0.28
161 0.28
162 0.26
163 0.19
164 0.17
165 0.18
166 0.17
167 0.17
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.11
183 0.16
184 0.23
185 0.28
186 0.33
187 0.4
188 0.48
189 0.53
190 0.53
191 0.56
192 0.6
193 0.59
194 0.57
195 0.5
196 0.43
197 0.37
198 0.33
199 0.28
200 0.2
201 0.17
202 0.15
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.22
207 0.21
208 0.21
209 0.19
210 0.24
211 0.19
212 0.22
213 0.24
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.17
252 0.22
253 0.31
254 0.31
255 0.32
256 0.34
257 0.34
258 0.34
259 0.29
260 0.22
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.1
315 0.12
316 0.16
317 0.25
318 0.34
319 0.42
320 0.51
321 0.61
322 0.64
323 0.67
324 0.72
325 0.71
326 0.67
327 0.61
328 0.54
329 0.44
330 0.37
331 0.34
332 0.24
333 0.15
334 0.1
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.24
354 0.25
355 0.21
356 0.24
357 0.24
358 0.27
359 0.32
360 0.34
361 0.34
362 0.35
363 0.34
364 0.33
365 0.31
366 0.27
367 0.21
368 0.18
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.2
379 0.25
380 0.32
381 0.36
382 0.38
383 0.43
384 0.47
385 0.48
386 0.45
387 0.42
388 0.38
389 0.38
390 0.36
391 0.32
392 0.27
393 0.25
394 0.19
395 0.19
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.19
400 0.24
401 0.3
402 0.35
403 0.38
404 0.4
405 0.39
406 0.42
407 0.44
408 0.46
409 0.4
410 0.35
411 0.31
412 0.28
413 0.26
414 0.22
415 0.17
416 0.1
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.17
427 0.26
428 0.35
429 0.4
430 0.48
431 0.58
432 0.68
433 0.75
434 0.81
435 0.82
436 0.81
437 0.8
438 0.82
439 0.83
440 0.8
441 0.81
442 0.76
443 0.72
444 0.66
445 0.64
446 0.58
447 0.52
448 0.45
449 0.44
450 0.46
451 0.44
452 0.42
453 0.38
454 0.41
455 0.41
456 0.49
457 0.44
458 0.4
459 0.42
460 0.45
461 0.51
462 0.49
463 0.51
464 0.46
465 0.48
466 0.44
467 0.41
468 0.39
469 0.35
470 0.35
471 0.33
472 0.32
473 0.31
474 0.33
475 0.34
476 0.39
477 0.38
478 0.36
479 0.37
480 0.38
481 0.42
482 0.45
483 0.51
484 0.52
485 0.6
486 0.64
487 0.66
488 0.69
489 0.72
490 0.78
491 0.77
492 0.74
493 0.7
494 0.65
495 0.68
496 0.64
497 0.56
498 0.48
499 0.47
500 0.48
501 0.43
502 0.42
503 0.37
504 0.35
505 0.35
506 0.33
507 0.26
508 0.2
509 0.24
510 0.29
511 0.34
512 0.4
513 0.44
514 0.51
515 0.56
516 0.58
517 0.57
518 0.57
519 0.52
520 0.49
521 0.55
522 0.56
523 0.59
524 0.66
525 0.68
526 0.66
527 0.73
528 0.76
529 0.75
530 0.76
531 0.77
532 0.79
533 0.83
534 0.81
535 0.81
536 0.79
537 0.74
538 0.68
539 0.68
540 0.65
541 0.62
542 0.67
543 0.69