Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8FN18

Protein Details
Accession L8FN18    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-81YYYQVVKQEKVKRNGKKKKLRLHHEFRKQKKAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-87KVKRNGKKKKLRLHHEFRKQKKAEAKLRGE
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033871  LSm5  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01732  LSm5  
Amino Acid Sequences MSYDMGQTDAPASASAPTLKERIKARIISWRHDIDAHLRDFFHVSGGPYYYQVVKQEKVKRNGKKKKLRLHHEFRKQKKAEAKLRGERYVQPKHPYRTYRALNSHPVLSEKDKEAAADQHAVSHDDVDTITPACALTEIELIDRCVGSKIWVVMKTDKEFTGTLTGFDDYVNMVLEDVTEFDYTGATTKMEKILLNGNNICMARFPPLFLLLCPFSTFPLSLLVNPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.13
4 0.15
5 0.19
6 0.21
7 0.26
8 0.3
9 0.35
10 0.4
11 0.42
12 0.42
13 0.47
14 0.5
15 0.5
16 0.52
17 0.48
18 0.43
19 0.4
20 0.39
21 0.37
22 0.39
23 0.36
24 0.3
25 0.27
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.2
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.2
40 0.22
41 0.24
42 0.32
43 0.41
44 0.49
45 0.57
46 0.64
47 0.68
48 0.75
49 0.83
50 0.85
51 0.86
52 0.87
53 0.88
54 0.89
55 0.89
56 0.88
57 0.88
58 0.88
59 0.88
60 0.89
61 0.86
62 0.86
63 0.78
64 0.74
65 0.71
66 0.7
67 0.69
68 0.68
69 0.69
70 0.67
71 0.71
72 0.68
73 0.62
74 0.58
75 0.57
76 0.56
77 0.52
78 0.5
79 0.52
80 0.54
81 0.59
82 0.57
83 0.54
84 0.55
85 0.54
86 0.54
87 0.52
88 0.51
89 0.5
90 0.48
91 0.43
92 0.34
93 0.31
94 0.26
95 0.24
96 0.21
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.11
137 0.15
138 0.17
139 0.2
140 0.24
141 0.28
142 0.29
143 0.3
144 0.28
145 0.26
146 0.24
147 0.22
148 0.24
149 0.2
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.23
181 0.25
182 0.31
183 0.3
184 0.28
185 0.31
186 0.31
187 0.29
188 0.22
189 0.2
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.21
195 0.22
196 0.21
197 0.25
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.21
202 0.19
203 0.21
204 0.2
205 0.15
206 0.19
207 0.19