Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8GDD2

Protein Details
Accession L8GDD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46SSRRNESSYRRMKKKLNVKPHydrophilic
179-201IKERWGPKRRMAREDRVKRREAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-199IEAIKERWGPKRRMAREDRVKRRE
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 10, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024388  Ribosomal_L20_mt  
Pfam View protein in Pfam  
PF12824  MRP-L20  
Amino Acid Sequences MDLRVLRRPIFDLLAGRGQCLLSGTVSSRRNESSYRRMKKKLNVKPDASFGLSKDSPATDHIIFNPPSSAPSVLHTPLKFLPKEDKRRQLYSVAKNSTLGIDEEAKLPPAILKQNAGYHRYHLTQEDFAEIRRLRSSDPETWTRLKLARKFNCTSLFIGICCEATAEKVALEKAKIEAIKERWGPKRRMAREDRVKRREAAYRDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.29
4 0.26
5 0.24
6 0.21
7 0.19
8 0.16
9 0.09
10 0.11
11 0.13
12 0.2
13 0.24
14 0.25
15 0.27
16 0.28
17 0.3
18 0.35
19 0.4
20 0.43
21 0.5
22 0.59
23 0.64
24 0.69
25 0.74
26 0.77
27 0.81
28 0.8
29 0.8
30 0.78
31 0.75
32 0.71
33 0.67
34 0.61
35 0.53
36 0.44
37 0.34
38 0.32
39 0.27
40 0.24
41 0.21
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.2
46 0.14
47 0.15
48 0.17
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.16
57 0.1
58 0.12
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.19
63 0.2
64 0.22
65 0.27
66 0.25
67 0.23
68 0.32
69 0.37
70 0.48
71 0.53
72 0.59
73 0.6
74 0.63
75 0.63
76 0.61
77 0.61
78 0.59
79 0.59
80 0.52
81 0.47
82 0.44
83 0.42
84 0.34
85 0.26
86 0.17
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.18
102 0.21
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.17
115 0.16
116 0.22
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.17
122 0.23
123 0.28
124 0.28
125 0.32
126 0.35
127 0.38
128 0.4
129 0.4
130 0.36
131 0.36
132 0.37
133 0.4
134 0.46
135 0.49
136 0.54
137 0.56
138 0.59
139 0.59
140 0.54
141 0.49
142 0.43
143 0.36
144 0.29
145 0.28
146 0.22
147 0.17
148 0.14
149 0.13
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.25
165 0.26
166 0.34
167 0.39
168 0.45
169 0.5
170 0.58
171 0.61
172 0.63
173 0.7
174 0.69
175 0.74
176 0.75
177 0.76
178 0.79
179 0.86
180 0.88
181 0.84
182 0.81
183 0.74
184 0.72
185 0.7