FuNGI

L8GD28

Protein Details

Accession

L8GD28

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-296	LTPPMHFARKRRFRKRISRTAIEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-86	LPKTKAGRASKPSAKAAANKNGKRIK
96-133	KSRSVAEGAPKKLKLSLGGPKAPTVLKAKFKGKPPKRP
281-288	RKRRFRKR

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 10.666, cyto_nucl 6.833, nucl 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037817 TAF7 IPR006751 TAFII55_prot_cons_reg
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF04658 TAFII55_N
CDD	cd08047 TAF7

Amino Acid Sequences

MSKPTITLKIGGGSTPAFNLTGRSSSTAGTPTPGSAAPKIRLNMSNGSKPTTPNEIVVKPLPKTKAGRASKPSAKAAANKNGKRIKDESDDGDEHKSRSVAEGAPKKLKLSLGGPKAPTVLKAKFKGKPPKRPLGEGYDSEASDREEDPLVVEEFILRMIPGPDCDYVREAIQEKTIGVPRHQNGADIQMKFIHTEGRRAIVTVRKHHYAATLVDLPCVIEGMKSWDKRGWWKSADICQMLLVFAPIKTEAEAATIELPKIVDPHTFQYPHGLTPPMHFARKRRFRKRISRTAIEAVEDAVEKLLEADLKAESIRHELIEPEVRSRQGSRSFRSPLAYEEEEGYSEDEDADGDIDDGTAYYGHINGNSMHKQEEGEEHDLDADLEADLEAAFEADFDIGTPASNAIAETPIATITSGTPDASGNVNGDSGEESSDASVEDDEADGGSGDEIDDDERARLAQLQGAKEDIDEMEKQLASLQASWEMQVNPILKTRIKGNIEKVKAELQLKKSAIGEGDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.17
4	0.13
5	0.13
6	0.15
7	0.16
8	0.17
9	0.18
10	0.2
11	0.2
12	0.2
13	0.23
14	0.23
15	0.21
16	0.21
17	0.2
18	0.17
19	0.18
20	0.19
21	0.21
22	0.23
23	0.28
24	0.29
25	0.35
26	0.36
27	0.39
28	0.41
29	0.41
30	0.45
31	0.46
32	0.5
33	0.46
34	0.49
35	0.46
36	0.44
37	0.44
38	0.43
39	0.38
40	0.35
41	0.39
42	0.36
43	0.38
44	0.42
45	0.42
46	0.37
47	0.41
48	0.4
49	0.4
50	0.44
51	0.48
52	0.52
53	0.55
54	0.62
55	0.63
56	0.69
57	0.7
58	0.71
59	0.67
60	0.62
61	0.58
62	0.57
63	0.58
64	0.59
65	0.62
66	0.59
67	0.64
68	0.65
69	0.63
70	0.61
71	0.56
72	0.53
73	0.5
74	0.51
75	0.46
76	0.47
77	0.47
78	0.43
79	0.47
80	0.41
81	0.35
82	0.32
83	0.28
84	0.21
85	0.21
86	0.23
87	0.19
88	0.27
89	0.34
90	0.38
91	0.44
92	0.44
93	0.43
94	0.42
95	0.4
96	0.34
97	0.32
98	0.35
99	0.36
100	0.41
101	0.41
102	0.39
103	0.4
104	0.37
105	0.34
106	0.32
107	0.31
108	0.33
109	0.39
110	0.45
111	0.48
112	0.58
113	0.65
114	0.69
115	0.74
116	0.75
117	0.79
118	0.76
119	0.76
120	0.71
121	0.69
122	0.65
123	0.55
124	0.52
125	0.44
126	0.4
127	0.34
128	0.3
129	0.22
130	0.18
131	0.17
132	0.13
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.13
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.04
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.1
150	0.12
151	0.12
152	0.14
153	0.14
154	0.14
155	0.14
156	0.16
157	0.15
158	0.15
159	0.16
160	0.15
161	0.14
162	0.16
163	0.21
164	0.19
165	0.19
166	0.26
167	0.25
168	0.31
169	0.31
170	0.29
171	0.24
172	0.31
173	0.35
174	0.27
175	0.27
176	0.22
177	0.22
178	0.21
179	0.21
180	0.2
181	0.15
182	0.2
183	0.2
184	0.21
185	0.2
186	0.21
187	0.23
188	0.22
189	0.27
190	0.3
191	0.34
192	0.34
193	0.34
194	0.34
195	0.33
196	0.3
197	0.25
198	0.22
199	0.23
200	0.2
201	0.2
202	0.19
203	0.17
204	0.14
205	0.14
206	0.09
207	0.03
208	0.04
209	0.11
210	0.17
211	0.17
212	0.19
213	0.2
214	0.22
215	0.31
216	0.35
217	0.34
218	0.3
219	0.34
220	0.37
221	0.42
222	0.46
223	0.38
224	0.33
225	0.28
226	0.26
227	0.21
228	0.17
229	0.11
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.11
252	0.15
253	0.16
254	0.16
255	0.21
256	0.21
257	0.2
258	0.2
259	0.2
260	0.16
261	0.16
262	0.24
263	0.2
264	0.23
265	0.24
266	0.29
267	0.37
268	0.48
269	0.57
270	0.61
271	0.68
272	0.75
273	0.84
274	0.88
275	0.88
276	0.86
277	0.8
278	0.74
279	0.69
280	0.6
281	0.5
282	0.39
283	0.29
284	0.21
285	0.16
286	0.12
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.12
306	0.18
307	0.18
308	0.19
309	0.2
310	0.2
311	0.21
312	0.23
313	0.26
314	0.29
315	0.34
316	0.35
317	0.4
318	0.44
319	0.44
320	0.45
321	0.4
322	0.33
323	0.34
324	0.31
325	0.25
326	0.22
327	0.21
328	0.19
329	0.18
330	0.17
331	0.1
332	0.09
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.14
354	0.17
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.18
359	0.18
360	0.22
361	0.22
362	0.23
363	0.22
364	0.21
365	0.21
366	0.21
367	0.19
368	0.14
369	0.09
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.04
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.11
446	0.11
447	0.14
448	0.19
449	0.21
450	0.22
451	0.23
452	0.22
453	0.19
454	0.19
455	0.16
456	0.15
457	0.13
458	0.14
459	0.17
460	0.16
461	0.16
462	0.17
463	0.19
464	0.17
465	0.17
466	0.17
467	0.18
468	0.18
469	0.19
470	0.21
471	0.19
472	0.18
473	0.22
474	0.23
475	0.2
476	0.24
477	0.28
478	0.26
479	0.28
480	0.32
481	0.37
482	0.41
483	0.47
484	0.52
485	0.58
486	0.61
487	0.61
488	0.58
489	0.54
490	0.54
491	0.55
492	0.52
493	0.47
494	0.52
495	0.5
496	0.5
497	0.46
498	0.42
499	0.37

L8GD28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer