Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDL6

Protein Details
Accession A0A1D8PDL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-44ERAAAKKVRKAANKEKRKVIFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-40KAQQKTAEERAAAKKVRKAANKEKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR012988  Ribosomal_L30_N  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR005998  Ribosomal_L7_euk  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
Gene Ontology GO:0009986  C:cell surface  
GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cal:CAALFM_C105720WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PF08079  Ribosomal_L30_N  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MATTLKPETLQKKEKAQQKTAEERAAAKKVRKAANKEKRKVIFDRAAAYQKEYTEAERSVIKAKRDAKASNSYYVDAQPKLVFVVRIKGINKIPPKPRKVLQLLRLTQINAGVFVRLTKATSELIKLAEPYVAYGYPSLSTIRQLVYKRGFGKVNKQRIALSDNAIIEANLGKFNILSIEDLIHEIYTVGPNFKQVSNFLWPFKLSNPNGGFRARKFQHFIQGGDTGNREQFINALVKQMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.72
3 0.72
4 0.71
5 0.72
6 0.76
7 0.72
8 0.69
9 0.63
10 0.6
11 0.59
12 0.58
13 0.54
14 0.49
15 0.48
16 0.51
17 0.58
18 0.61
19 0.63
20 0.67
21 0.72
22 0.78
23 0.8
24 0.82
25 0.8
26 0.78
27 0.74
28 0.72
29 0.69
30 0.61
31 0.58
32 0.53
33 0.53
34 0.47
35 0.45
36 0.38
37 0.31
38 0.3
39 0.27
40 0.24
41 0.22
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.25
47 0.28
48 0.27
49 0.31
50 0.36
51 0.39
52 0.43
53 0.44
54 0.42
55 0.48
56 0.48
57 0.48
58 0.44
59 0.4
60 0.36
61 0.37
62 0.35
63 0.25
64 0.24
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.1
71 0.15
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.25
77 0.3
78 0.35
79 0.38
80 0.46
81 0.5
82 0.54
83 0.55
84 0.56
85 0.58
86 0.61
87 0.61
88 0.59
89 0.6
90 0.57
91 0.54
92 0.52
93 0.43
94 0.35
95 0.29
96 0.21
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.14
131 0.15
132 0.21
133 0.23
134 0.28
135 0.29
136 0.31
137 0.35
138 0.32
139 0.42
140 0.45
141 0.52
142 0.5
143 0.49
144 0.47
145 0.44
146 0.46
147 0.37
148 0.31
149 0.24
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.17
154 0.13
155 0.13
156 0.1
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.16
183 0.2
184 0.27
185 0.3
186 0.29
187 0.29
188 0.29
189 0.29
190 0.31
191 0.37
192 0.3
193 0.36
194 0.38
195 0.4
196 0.42
197 0.46
198 0.46
199 0.39
200 0.49
201 0.42
202 0.45
203 0.47
204 0.48
205 0.53
206 0.53
207 0.51
208 0.45
209 0.46
210 0.41
211 0.38
212 0.36
213 0.29
214 0.26
215 0.26
216 0.21
217 0.17
218 0.16
219 0.17
220 0.2
221 0.18