FuNGI

L8FP58

Protein Details

Accession

L8FP58

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-467	PQRPLRPQTSAPPRPHRRRHPRLRQARQPLARRHRAAPPRSHDRLRRGDERRDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
195-253	KKANKSKEAAAAKAAKQSRLESQAASASGKSKSKEGAADEPHKKTPKDGKRERLVEKAA
340-358	KAGPSNAGGGGKGKGRVEN
423-467	SAPPRPHRRRHPRLRQARQPLARRHRAAPPRSHDRLRRGDERRDR

Subcellular Location(s)

mito 21, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MTSRAQANGVLPIPASQTAPKMSKASQNRAGPSLKVVVRRLAPALTETEFMKIIGDEWKVGAGRVDWFSYKPGKVSTDPSKASRPSRAYLHLINEPYLTQLSNHVRQLTFEDAAKTFTNPCLLGPASLEYTSYARIPSGKRRTDARQGTIDLDPEFMDFLESLANPKSTKGEDTEPSTKGEKVTTTPLVQYLKDKKANKSKEAAAAKAAKQSRLESQAASASGKSKSKEGAADEPHKKTPKDGKRERLVEKAAREAVRVLNREASKATGAQAQPGNAAPTEAPKNPRAATRERGSIAAAARILQRDLGLSPVNAHRRAKVEAGAAAKSEAAAASAPQGPKAGPSNAGGGGKGKGRVENNKAKEPTPAITLLKKPVEPAAAAPPASSASPKPAAGTSAPPSTSRQTASASQPNPPQRPLRPQTSAPPRPHRRRHPRLRQARQPLARRHRAAPPRSHDRLRRGDERRDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.15
4	0.18
5	0.24
6	0.26
7	0.29
8	0.3
9	0.33
10	0.4
11	0.47
12	0.53
13	0.56
14	0.6
15	0.6
16	0.62
17	0.61
18	0.52
19	0.47
20	0.46
21	0.41
22	0.4
23	0.39
24	0.39
25	0.39
26	0.41
27	0.39
28	0.32
29	0.29
30	0.25
31	0.26
32	0.22
33	0.21
34	0.19
35	0.18
36	0.17
37	0.16
38	0.15
39	0.11
40	0.11
41	0.14
42	0.15
43	0.13
44	0.13
45	0.16
46	0.16
47	0.16
48	0.16
49	0.12
50	0.15
51	0.17
52	0.19
53	0.17
54	0.18
55	0.22
56	0.27
57	0.27
58	0.26
59	0.27
60	0.3
61	0.31
62	0.38
63	0.43
64	0.46
65	0.48
66	0.5
67	0.54
68	0.55
69	0.57
70	0.58
71	0.53
72	0.49
73	0.51
74	0.53
75	0.5
76	0.48
77	0.48
78	0.45
79	0.42
80	0.38
81	0.34
82	0.28
83	0.24
84	0.21
85	0.16
86	0.11
87	0.17
88	0.23
89	0.27
90	0.3
91	0.31
92	0.31
93	0.31
94	0.35
95	0.32
96	0.27
97	0.23
98	0.23
99	0.2
100	0.23
101	0.23
102	0.2
103	0.17
104	0.17
105	0.18
106	0.15
107	0.15
108	0.16
109	0.16
110	0.15
111	0.15
112	0.15
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.11
117	0.12
118	0.13
119	0.12
120	0.11
121	0.09
122	0.14
123	0.17
124	0.27
125	0.36
126	0.39
127	0.41
128	0.47
129	0.53
130	0.59
131	0.62
132	0.56
133	0.51
134	0.49
135	0.49
136	0.44
137	0.39
138	0.29
139	0.23
140	0.18
141	0.13
142	0.11
143	0.08
144	0.07
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.13
155	0.12
156	0.14
157	0.16
158	0.19
159	0.21
160	0.28
161	0.32
162	0.3
163	0.32
164	0.32
165	0.3
166	0.26
167	0.24
168	0.18
169	0.16
170	0.2
171	0.2
172	0.19
173	0.19
174	0.22
175	0.22
176	0.22
177	0.27
178	0.29
179	0.33
180	0.4
181	0.43
182	0.47
183	0.55
184	0.61
185	0.58
186	0.56
187	0.52
188	0.53
189	0.52
190	0.45
191	0.39
192	0.38
193	0.35
194	0.36
195	0.34
196	0.27
197	0.26
198	0.27
199	0.26
200	0.27
201	0.27
202	0.2
203	0.2
204	0.2
205	0.19
206	0.18
207	0.15
208	0.11
209	0.13
210	0.15
211	0.15
212	0.14
213	0.15
214	0.16
215	0.18
216	0.19
217	0.23
218	0.26
219	0.33
220	0.36
221	0.38
222	0.41
223	0.42
224	0.39
225	0.38
226	0.43
227	0.44
228	0.5
229	0.56
230	0.6
231	0.65
232	0.73
233	0.71
234	0.67
235	0.63
236	0.57
237	0.5
238	0.45
239	0.41
240	0.34
241	0.31
242	0.26
243	0.25
244	0.26
245	0.26
246	0.23
247	0.24
248	0.24
249	0.25
250	0.23
251	0.2
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.14
257	0.17
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.11
264	0.12
265	0.08
266	0.1
267	0.14
268	0.16
269	0.19
270	0.2
271	0.23
272	0.24
273	0.29
274	0.3
275	0.31
276	0.35
277	0.36
278	0.39
279	0.36
280	0.36
281	0.32
282	0.3
283	0.25
284	0.2
285	0.17
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.11
298	0.17
299	0.22
300	0.25
301	0.26
302	0.27
303	0.29
304	0.32
305	0.31
306	0.28
307	0.25
308	0.25
309	0.26
310	0.24
311	0.21
312	0.18
313	0.16
314	0.13
315	0.11
316	0.07
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.07
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.14
327	0.18
328	0.17
329	0.15
330	0.17
331	0.19
332	0.21
333	0.21
334	0.19
335	0.17
336	0.17
337	0.18
338	0.19
339	0.18
340	0.2
341	0.24
342	0.32
343	0.4
344	0.48
345	0.51
346	0.57
347	0.58
348	0.54
349	0.54
350	0.49
351	0.43
352	0.36
353	0.35
354	0.29
355	0.31
356	0.34
357	0.36
358	0.36
359	0.34
360	0.32
361	0.31
362	0.3
363	0.26
364	0.25
365	0.25
366	0.25
367	0.25
368	0.23
369	0.21
370	0.2
371	0.2
372	0.19
373	0.12
374	0.15
375	0.18
376	0.19
377	0.2
378	0.19
379	0.22
380	0.22
381	0.26
382	0.25
383	0.26
384	0.27
385	0.27
386	0.3
387	0.32
388	0.33
389	0.3
390	0.28
391	0.27
392	0.32
393	0.38
394	0.43
395	0.41
396	0.43
397	0.49
398	0.56
399	0.57
400	0.57
401	0.56
402	0.54
403	0.64
404	0.65
405	0.66
406	0.63
407	0.63
408	0.68
409	0.71
410	0.73
411	0.72
412	0.76
413	0.78
414	0.83
415	0.89
416	0.9
417	0.9
418	0.92
419	0.94
420	0.95
421	0.95
422	0.95
423	0.96
424	0.95
425	0.94
426	0.94
427	0.92
428	0.9
429	0.9
430	0.89
431	0.89
432	0.83
433	0.77
434	0.77
435	0.77
436	0.77
437	0.76
438	0.75
439	0.75
440	0.78
441	0.82
442	0.8
443	0.8
444	0.82
445	0.79
446	0.81
447	0.78

L8FP58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer