Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8FZM6

Protein Details
Accession L8FZM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40SATPDGKKYKKRADEEAERQAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-103KRKREEEEAEAKEEREEKRRRLAEESKARREKEEKEEEARRRKRV
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFASLMSKEISKAKAPASATPDGKKYKKRADEEAERQAAYAAHQDQLEKERLAHETQKRKREEEEAEAKEEREEKRRRLAEESKARREKEEKEEEARRRKRVGLPELVEKEKEEAVDDDDIVEEEVLKLLEEIGEPTSLPGENHRQKVRRYRRVTTVMTTGPIPTSLKLVDEKDMKVHKMPPPEDVEATKWLYRQLASYFTMVLKEWEDALLREDKRDTFASKAAYNAMAQSKKNMTPLFRKFEKGDLDIGILEPVVEIVKAAQERRYVDANDGYLTLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHESDKGHVMGDEVTRKFLQSIKRCLSFAQVRWPPEDVRQLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.33
4 0.37
5 0.38
6 0.43
7 0.44
8 0.44
9 0.49
10 0.52
11 0.58
12 0.61
13 0.64
14 0.66
15 0.71
16 0.73
17 0.76
18 0.77
19 0.8
20 0.8
21 0.81
22 0.74
23 0.64
24 0.58
25 0.49
26 0.4
27 0.3
28 0.28
29 0.19
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.26
35 0.29
36 0.23
37 0.22
38 0.23
39 0.25
40 0.29
41 0.34
42 0.38
43 0.45
44 0.53
45 0.61
46 0.63
47 0.63
48 0.63
49 0.63
50 0.6
51 0.58
52 0.6
53 0.55
54 0.55
55 0.53
56 0.49
57 0.43
58 0.42
59 0.36
60 0.35
61 0.39
62 0.39
63 0.48
64 0.53
65 0.54
66 0.58
67 0.62
68 0.63
69 0.67
70 0.71
71 0.71
72 0.74
73 0.71
74 0.68
75 0.66
76 0.62
77 0.61
78 0.62
79 0.56
80 0.57
81 0.66
82 0.69
83 0.74
84 0.74
85 0.69
86 0.63
87 0.64
88 0.63
89 0.63
90 0.62
91 0.6
92 0.56
93 0.6
94 0.61
95 0.57
96 0.5
97 0.41
98 0.35
99 0.27
100 0.23
101 0.16
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.09
129 0.18
130 0.24
131 0.3
132 0.36
133 0.39
134 0.45
135 0.56
136 0.64
137 0.64
138 0.65
139 0.65
140 0.68
141 0.71
142 0.68
143 0.59
144 0.53
145 0.43
146 0.37
147 0.32
148 0.24
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.19
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.25
166 0.25
167 0.3
168 0.3
169 0.3
170 0.33
171 0.33
172 0.32
173 0.28
174 0.27
175 0.23
176 0.24
177 0.21
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.2
205 0.22
206 0.21
207 0.17
208 0.2
209 0.22
210 0.21
211 0.22
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.22
220 0.25
221 0.26
222 0.31
223 0.31
224 0.29
225 0.36
226 0.43
227 0.47
228 0.46
229 0.48
230 0.44
231 0.48
232 0.48
233 0.4
234 0.35
235 0.28
236 0.27
237 0.23
238 0.22
239 0.15
240 0.1
241 0.08
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.07
249 0.09
250 0.11
251 0.14
252 0.18
253 0.2
254 0.23
255 0.28
256 0.25
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.23
261 0.22
262 0.19
263 0.15
264 0.14
265 0.11
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.22
287 0.22
288 0.26
289 0.31
290 0.36
291 0.42
292 0.47
293 0.46
294 0.48
295 0.51
296 0.48
297 0.42
298 0.37
299 0.29
300 0.25
301 0.27
302 0.28
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.26
307 0.27
308 0.28
309 0.34
310 0.35
311 0.45
312 0.49
313 0.53
314 0.53
315 0.52
316 0.57
317 0.55
318 0.5
319 0.51
320 0.5
321 0.48
322 0.51
323 0.53
324 0.47
325 0.45
326 0.5