Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8FQH9

Protein Details
Accession L8FQH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-240DHPNWRCQPRKSSDIKRRAVKKRTPASSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-234KRRAVKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MASTPSTPPTPSVPGDFDNLNDTAMFQIRSSVEFYFKSIHENMPAFFLPKEIVDSMGPGRLARVAHNYANEIRTDVSIVYDPAFCLYKIAPPEYMASNETLIYIDTVVYQHGTIIPLRKWELMIPNFSDRASNFGKRALVEAGPGNRKITKPPNCFILFRRDKRHLVKERYPDASLGQISSIIAQMWAAAEKKVKMQYQLEAMKLKRQHDNDHPNWRCQPRKSSDIKRRAVKKRTPASSPILVSMANSAPISSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.3
4 0.26
5 0.25
6 0.23
7 0.19
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.1
14 0.14
15 0.14
16 0.16
17 0.18
18 0.17
19 0.18
20 0.18
21 0.21
22 0.2
23 0.2
24 0.24
25 0.24
26 0.24
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.23
33 0.21
34 0.19
35 0.14
36 0.13
37 0.16
38 0.12
39 0.13
40 0.11
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.15
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.19
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.25
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.21
109 0.19
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.13
117 0.16
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.18
122 0.19
123 0.18
124 0.19
125 0.16
126 0.13
127 0.12
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.24
136 0.31
137 0.37
138 0.4
139 0.42
140 0.48
141 0.48
142 0.5
143 0.46
144 0.47
145 0.47
146 0.47
147 0.52
148 0.51
149 0.56
150 0.61
151 0.69
152 0.68
153 0.67
154 0.7
155 0.71
156 0.71
157 0.67
158 0.61
159 0.51
160 0.42
161 0.37
162 0.29
163 0.21
164 0.15
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.16
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.29
184 0.31
185 0.38
186 0.41
187 0.39
188 0.4
189 0.39
190 0.4
191 0.42
192 0.43
193 0.42
194 0.43
195 0.47
196 0.51
197 0.61
198 0.63
199 0.7
200 0.69
201 0.68
202 0.73
203 0.74
204 0.71
205 0.67
206 0.68
207 0.64
208 0.71
209 0.74
210 0.77
211 0.78
212 0.81
213 0.83
214 0.83
215 0.86
216 0.87
217 0.87
218 0.85
219 0.85
220 0.85
221 0.83
222 0.79
223 0.75
224 0.71
225 0.69
226 0.61
227 0.53
228 0.44
229 0.37
230 0.31
231 0.29
232 0.22
233 0.17
234 0.15