Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RK83

Protein Details
Accession E3RK83    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-42MSKSKVDKPEKKRKRDAEVAEDVPKKSKKSKKTEDTPDAPTPBasic
47-76VEVAEVKKERKSKKDKKEKKSKDNVDTSAVHydrophilic
79-107ALEDARKEKKEKKSKKSKKSKDTDASEEABasic
137-168TEDAPVKDKKKSKKDKDSKKSKKSTKATEAEDBasic
185-218DADSKAAKKEKKKDKKEKKEKKEKKAKKVDESETBasic
369-397AEVSMKQRERKEKKEAKSGKKADNKEEEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-32VDKPEKKRKRDAEVAEDVPKKSKKSKK
53-68KKERKSKKDKKEKKSK
84-99RKEKKEKKSKKSKKSK
143-161KDKKKSKKDKDSKKSKKST
189-212KAAKKEKKKDKKEKKEKKEKKAKK
324-330KKKEGRK
343-391SEARKTKIAAKNEKLHDERARDRIKEAEVSMKQRERKEKKEAKSGKKAD
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pte:PTT_08619  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKSKVDKPEKKRKRDAEVAEDVPKKSKKSKKTEDTPDAPTPDAPVVEVAEVKKERKSKKDKKEKKSKDNVDTSAVEDALEDARKEKKEKKSKKSKKSKDTDASEEAPADETELIEEMKTSENFIHVNDDEPMPDATEDAPVKDKKKSKKDKDSKKSKKSTKATEAEDTAMDNGEDTLAETNGVDADSKAAKKEKKKDKKEKKEKKEKKAKKVDESETNGDATTEDTAAEAEVDEEVEGEGEEAQAAIEANQGRFIVFVGNLPYSATKEEIEKHFEKIKPSEIRLRTYKGTEKFMGTCFVEFDRYDRMVTCLKKYHHSVFPDPKKKEGRKINVELSAGGGGNSEARKTKIAAKNEKLHDERARDRIKEAEVSMKQRERKEKKEAKSGKKADNKEEEPAAEKPSEAETFGMNPARLAMMQGPAVPHRSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.87
4 0.85
5 0.83
6 0.77
7 0.75
8 0.7
9 0.61
10 0.59
11 0.55
12 0.51
13 0.52
14 0.56
15 0.58
16 0.65
17 0.75
18 0.77
19 0.84
20 0.9
21 0.9
22 0.87
23 0.84
24 0.8
25 0.72
26 0.62
27 0.52
28 0.43
29 0.35
30 0.29
31 0.22
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.16
36 0.13
37 0.19
38 0.22
39 0.23
40 0.28
41 0.36
42 0.42
43 0.51
44 0.62
45 0.65
46 0.73
47 0.83
48 0.88
49 0.91
50 0.95
51 0.95
52 0.95
53 0.95
54 0.94
55 0.93
56 0.91
57 0.83
58 0.77
59 0.67
60 0.58
61 0.49
62 0.39
63 0.28
64 0.19
65 0.17
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.18
71 0.21
72 0.27
73 0.35
74 0.43
75 0.53
76 0.64
77 0.73
78 0.78
79 0.86
80 0.91
81 0.94
82 0.94
83 0.94
84 0.93
85 0.93
86 0.91
87 0.87
88 0.83
89 0.78
90 0.7
91 0.6
92 0.5
93 0.4
94 0.31
95 0.24
96 0.18
97 0.12
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.16
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.15
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.17
128 0.2
129 0.22
130 0.29
131 0.35
132 0.41
133 0.52
134 0.62
135 0.67
136 0.75
137 0.84
138 0.88
139 0.92
140 0.94
141 0.94
142 0.93
143 0.93
144 0.91
145 0.9
146 0.88
147 0.86
148 0.85
149 0.8
150 0.74
151 0.68
152 0.6
153 0.51
154 0.42
155 0.33
156 0.23
157 0.16
158 0.11
159 0.07
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.04
172 0.03
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.15
178 0.2
179 0.28
180 0.38
181 0.47
182 0.56
183 0.67
184 0.77
185 0.83
186 0.9
187 0.94
188 0.95
189 0.95
190 0.96
191 0.95
192 0.94
193 0.94
194 0.92
195 0.92
196 0.92
197 0.88
198 0.86
199 0.84
200 0.78
201 0.75
202 0.71
203 0.63
204 0.53
205 0.45
206 0.36
207 0.27
208 0.22
209 0.14
210 0.09
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.1
256 0.15
257 0.17
258 0.23
259 0.23
260 0.26
261 0.32
262 0.34
263 0.36
264 0.34
265 0.41
266 0.39
267 0.42
268 0.48
269 0.44
270 0.48
271 0.48
272 0.5
273 0.44
274 0.44
275 0.48
276 0.43
277 0.45
278 0.41
279 0.39
280 0.37
281 0.35
282 0.34
283 0.27
284 0.23
285 0.19
286 0.18
287 0.18
288 0.15
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.2
295 0.23
296 0.26
297 0.29
298 0.3
299 0.32
300 0.37
301 0.42
302 0.46
303 0.46
304 0.5
305 0.54
306 0.58
307 0.67
308 0.71
309 0.67
310 0.68
311 0.72
312 0.72
313 0.73
314 0.73
315 0.72
316 0.72
317 0.77
318 0.75
319 0.7
320 0.65
321 0.55
322 0.46
323 0.37
324 0.27
325 0.2
326 0.13
327 0.08
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.15
334 0.17
335 0.27
336 0.32
337 0.41
338 0.5
339 0.56
340 0.64
341 0.67
342 0.74
343 0.67
344 0.67
345 0.64
346 0.61
347 0.59
348 0.6
349 0.61
350 0.54
351 0.53
352 0.51
353 0.48
354 0.45
355 0.4
356 0.4
357 0.39
358 0.44
359 0.5
360 0.51
361 0.54
362 0.57
363 0.67
364 0.66
365 0.69
366 0.74
367 0.76
368 0.77
369 0.82
370 0.85
371 0.84
372 0.86
373 0.86
374 0.85
375 0.85
376 0.83
377 0.82
378 0.81
379 0.74
380 0.69
381 0.64
382 0.56
383 0.5
384 0.46
385 0.41
386 0.31
387 0.27
388 0.23
389 0.24
390 0.23
391 0.2
392 0.18
393 0.16
394 0.18
395 0.22
396 0.25
397 0.2
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.18
402 0.18
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.17
407 0.19
408 0.2
409 0.26