Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDF6

Protein Details
Accession L0PDF6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-113VTEVKKRKARDPNQPKRPLSHydrophilic
229-281SKNNINEVVKEKKRKHKKKGDGSHLSSDGNASLKEEKKERKKHKKKEGHVEKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-101RK
238-281KEKKRKHKKKGDGSHLSSDGNASLKEEKKERKKHKKKEGHVEKG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MFSSKDTQSEVSYINAWHKKQTAVAYLLNFIFNTKQLKLASAFRLLSEACSAAARELQKVKHVAVEQSATENSIFSSSEIQMIQESTPELQADVTEVKKRKARDPNQPKRPLSAYLSFQLKTRQAVKDSLGESATQKEILSEIAERWSKLNDDERKPFEEEARKAREQYDKEMTAYRSSESKNNSNALLTKENPVETHIKTPPLQKDLEESKESLKTVSIVEVNDTNTSKNNINEVVKEKKRKHKKKGDGSHLSSDGNASLKEEKKERKKHKKKEGHVEKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.32
4 0.35
5 0.36
6 0.36
7 0.39
8 0.42
9 0.39
10 0.37
11 0.4
12 0.36
13 0.37
14 0.35
15 0.31
16 0.26
17 0.21
18 0.17
19 0.17
20 0.2
21 0.17
22 0.22
23 0.21
24 0.24
25 0.27
26 0.31
27 0.32
28 0.33
29 0.33
30 0.28
31 0.3
32 0.27
33 0.25
34 0.2
35 0.16
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.1
40 0.14
41 0.13
42 0.16
43 0.21
44 0.22
45 0.26
46 0.28
47 0.28
48 0.29
49 0.3
50 0.27
51 0.26
52 0.27
53 0.22
54 0.22
55 0.22
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.07
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.16
83 0.18
84 0.22
85 0.25
86 0.28
87 0.35
88 0.44
89 0.5
90 0.55
91 0.65
92 0.72
93 0.79
94 0.86
95 0.78
96 0.72
97 0.67
98 0.59
99 0.52
100 0.46
101 0.38
102 0.33
103 0.35
104 0.31
105 0.29
106 0.29
107 0.26
108 0.24
109 0.26
110 0.25
111 0.24
112 0.26
113 0.27
114 0.27
115 0.26
116 0.24
117 0.2
118 0.18
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.09
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.22
138 0.25
139 0.3
140 0.35
141 0.38
142 0.4
143 0.42
144 0.4
145 0.37
146 0.38
147 0.36
148 0.38
149 0.42
150 0.4
151 0.39
152 0.42
153 0.44
154 0.38
155 0.41
156 0.4
157 0.35
158 0.35
159 0.39
160 0.36
161 0.31
162 0.3
163 0.24
164 0.21
165 0.21
166 0.24
167 0.25
168 0.29
169 0.3
170 0.31
171 0.31
172 0.28
173 0.29
174 0.29
175 0.28
176 0.24
177 0.24
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.23
183 0.21
184 0.25
185 0.24
186 0.26
187 0.28
188 0.35
189 0.37
190 0.36
191 0.36
192 0.3
193 0.35
194 0.37
195 0.41
196 0.36
197 0.31
198 0.31
199 0.33
200 0.33
201 0.26
202 0.2
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.27
221 0.3
222 0.34
223 0.41
224 0.46
225 0.54
226 0.6
227 0.65
228 0.75
229 0.81
230 0.86
231 0.87
232 0.9
233 0.92
234 0.94
235 0.94
236 0.94
237 0.89
238 0.86
239 0.77
240 0.66
241 0.55
242 0.45
243 0.36
244 0.27
245 0.21
246 0.16
247 0.2
248 0.24
249 0.3
250 0.37
251 0.46
252 0.55
253 0.66
254 0.74
255 0.79
256 0.85
257 0.91
258 0.94
259 0.95
260 0.95
261 0.95