Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PEN9

Protein Details
Accession L0PEN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-42QLVSDDPKQKQSKKTDKPDKSDKLDKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MTISDKNFINRIQLSQLVSDDPKQKQSKKTDKPDKSDKLDKSDKPETLHSVQNEQASDNLKNKYNGNPILEMLQQIQNIVATGKIKPKATQLSLEGALGKISFSTVRTPRQILNIKKPIDNNTDQNNSVKIYNANVKKNHKFYLYCIEKIYDDLLEIEEIFRKQKRDQENDLLVDNNEQNKRLKLLKERIWKNLQIMEPITKNPDIVHPFITIISYNKGKKLIPRIFEHINTEQKLAILTVIAIHLDRLDVVLYDLYNLSNESRSLSMKENIDTFTQVALPSLLTCVSEASLQIIIDILSIMLDRMNFQLIAMTKIGLSFLTMLISRAEIIKQFGQANENDLKQWLAFLTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.31
4 0.28
5 0.28
6 0.31
7 0.34
8 0.33
9 0.41
10 0.47
11 0.53
12 0.58
13 0.67
14 0.73
15 0.76
16 0.84
17 0.86
18 0.87
19 0.89
20 0.91
21 0.89
22 0.86
23 0.85
24 0.79
25 0.77
26 0.77
27 0.73
28 0.7
29 0.69
30 0.64
31 0.59
32 0.58
33 0.56
34 0.5
35 0.52
36 0.45
37 0.41
38 0.41
39 0.4
40 0.36
41 0.29
42 0.29
43 0.27
44 0.28
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.33
49 0.35
50 0.38
51 0.43
52 0.44
53 0.42
54 0.4
55 0.36
56 0.37
57 0.35
58 0.29
59 0.23
60 0.21
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.11
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.24
74 0.31
75 0.36
76 0.37
77 0.39
78 0.35
79 0.35
80 0.35
81 0.34
82 0.27
83 0.2
84 0.17
85 0.13
86 0.1
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.14
92 0.18
93 0.23
94 0.26
95 0.29
96 0.3
97 0.38
98 0.46
99 0.46
100 0.52
101 0.55
102 0.54
103 0.55
104 0.56
105 0.53
106 0.51
107 0.49
108 0.43
109 0.42
110 0.43
111 0.41
112 0.39
113 0.35
114 0.29
115 0.25
116 0.21
117 0.15
118 0.14
119 0.21
120 0.26
121 0.31
122 0.36
123 0.44
124 0.49
125 0.53
126 0.53
127 0.5
128 0.45
129 0.42
130 0.46
131 0.43
132 0.38
133 0.34
134 0.32
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.14
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.16
151 0.23
152 0.31
153 0.37
154 0.43
155 0.48
156 0.5
157 0.49
158 0.47
159 0.41
160 0.32
161 0.26
162 0.21
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.21
170 0.24
171 0.28
172 0.36
173 0.42
174 0.51
175 0.54
176 0.58
177 0.59
178 0.57
179 0.5
180 0.47
181 0.4
182 0.32
183 0.3
184 0.26
185 0.23
186 0.21
187 0.22
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.2
195 0.17
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.26
208 0.35
209 0.37
210 0.37
211 0.4
212 0.44
213 0.46
214 0.46
215 0.47
216 0.42
217 0.42
218 0.39
219 0.35
220 0.3
221 0.26
222 0.25
223 0.19
224 0.13
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.19
254 0.22
255 0.24
256 0.25
257 0.25
258 0.25
259 0.25
260 0.23
261 0.2
262 0.16
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.13
297 0.13
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.16
318 0.18
319 0.21
320 0.23
321 0.25
322 0.27
323 0.26
324 0.3
325 0.31
326 0.3
327 0.27
328 0.25
329 0.24
330 0.2
331 0.21