Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PCM5

Protein Details
Accession L0PCM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTKKSSKKHNQVDLSRPFCYHydrophilic
33-52TAHQRAKHFKCARCSRKLNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd20908  SUF4-like  
Amino Acid Sequences MTKKSSKKHNQVDLSRPFCYYCERDFEDLKVLTAHQRAKHFKCARCSRKLNTASGLAIHVVQVHKETITTVENAIPGRDSIDIEIYGMEGIPEDIIQLHYKRLMEKMLSHDAVPQPEPKRQKVETHVDAADIQARLAAHKAAMQQKQVVLNSEKTAESYSVATQIEQSAQMAPVETPQQSIVPSAYGIPPQYQNFYQKNNPTTNQPYYSTQNYIPSNTPSAFTDTHAPVVNTTYQTNTGGPSSLLQPDKHEVLTDQSPTNASNSDVSSIKNITSSTKPNQRLIYNDHELMPEEKKARLPQYKYEFSVEDDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.72
3 0.63
4 0.53
5 0.45
6 0.44
7 0.39
8 0.32
9 0.35
10 0.38
11 0.42
12 0.43
13 0.43
14 0.43
15 0.39
16 0.35
17 0.28
18 0.25
19 0.26
20 0.3
21 0.34
22 0.31
23 0.4
24 0.48
25 0.52
26 0.62
27 0.65
28 0.65
29 0.7
30 0.76
31 0.76
32 0.77
33 0.8
34 0.75
35 0.77
36 0.77
37 0.7
38 0.63
39 0.57
40 0.48
41 0.41
42 0.36
43 0.25
44 0.2
45 0.15
46 0.14
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.03
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.05
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.24
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.29
98 0.28
99 0.29
100 0.27
101 0.27
102 0.23
103 0.29
104 0.34
105 0.33
106 0.38
107 0.38
108 0.43
109 0.44
110 0.51
111 0.48
112 0.47
113 0.43
114 0.37
115 0.35
116 0.29
117 0.25
118 0.16
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.06
126 0.08
127 0.12
128 0.18
129 0.2
130 0.21
131 0.22
132 0.24
133 0.26
134 0.25
135 0.24
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.24
181 0.26
182 0.31
183 0.36
184 0.39
185 0.43
186 0.45
187 0.44
188 0.44
189 0.47
190 0.47
191 0.44
192 0.41
193 0.39
194 0.39
195 0.41
196 0.37
197 0.32
198 0.34
199 0.32
200 0.31
201 0.3
202 0.28
203 0.28
204 0.25
205 0.25
206 0.19
207 0.22
208 0.2
209 0.19
210 0.23
211 0.2
212 0.22
213 0.23
214 0.21
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.13
230 0.17
231 0.19
232 0.19
233 0.22
234 0.25
235 0.27
236 0.25
237 0.24
238 0.19
239 0.21
240 0.25
241 0.24
242 0.21
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.22
247 0.17
248 0.15
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.19
255 0.19
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.23
261 0.29
262 0.34
263 0.43
264 0.48
265 0.53
266 0.58
267 0.57
268 0.57
269 0.57
270 0.57
271 0.53
272 0.5
273 0.45
274 0.4
275 0.39
276 0.36
277 0.33
278 0.3
279 0.25
280 0.26
281 0.31
282 0.37
283 0.44
284 0.51
285 0.53
286 0.57
287 0.65
288 0.7
289 0.67
290 0.65
291 0.57