Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PCB3

Protein Details
Accession L0PCB3    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-58VNTKKKTFSALDKRHQRVRPRKQMLIFEKKKRIKEIKKREKDKVDSNAKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-51KKKTFSALDKRHQRVRPRKQMLIFEKKKRIKEIKKREKDK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPKQRNKQVNTKKKTFSALDKRHQRVRPRKQMLIFEKKKRIKEIKKREKDKVDSNAKQPHTIESKREANKNVFQEENEEIERKLDEETFESINDPKYIPKTLITTSKRPSKQTYSFARELIDLFPHSTFIKRGVQFEIDKIAMYCAKRGYSNLIFVNENRKMPDSLTVIHLPSGPSFYFTLSSITPIRCIYQHGRATSHIPELIISNFTTKLGLVVGRMFRSLFPAQPDFEGRQVVTIHNQRDFIFVRRHRYIFKNEMKVGLQELGPQFTLRLRLMQRGIYDKDGNDIIFKNKPGEESNRRRFWLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.71
3 0.71
4 0.71
5 0.72
6 0.73
7 0.77
8 0.79
9 0.81
10 0.82
11 0.82
12 0.82
13 0.83
14 0.84
15 0.82
16 0.84
17 0.81
18 0.84
19 0.84
20 0.84
21 0.82
22 0.8
23 0.82
24 0.81
25 0.8
26 0.8
27 0.81
28 0.81
29 0.82
30 0.84
31 0.85
32 0.89
33 0.91
34 0.91
35 0.9
36 0.87
37 0.85
38 0.84
39 0.83
40 0.78
41 0.78
42 0.77
43 0.69
44 0.65
45 0.57
46 0.53
47 0.51
48 0.49
49 0.45
50 0.43
51 0.51
52 0.52
53 0.57
54 0.55
55 0.53
56 0.57
57 0.57
58 0.54
59 0.46
60 0.4
61 0.39
62 0.36
63 0.33
64 0.28
65 0.24
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.15
70 0.14
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.19
88 0.21
89 0.31
90 0.33
91 0.36
92 0.41
93 0.5
94 0.51
95 0.52
96 0.55
97 0.54
98 0.56
99 0.58
100 0.61
101 0.59
102 0.58
103 0.54
104 0.49
105 0.41
106 0.35
107 0.27
108 0.2
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.24
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.18
137 0.16
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.27
144 0.23
145 0.23
146 0.2
147 0.2
148 0.18
149 0.18
150 0.23
151 0.17
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.13
159 0.11
160 0.13
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.1
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.18
177 0.19
178 0.25
179 0.29
180 0.3
181 0.31
182 0.32
183 0.35
184 0.32
185 0.31
186 0.22
187 0.18
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.2
212 0.22
213 0.22
214 0.24
215 0.27
216 0.24
217 0.24
218 0.24
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.22
224 0.27
225 0.28
226 0.29
227 0.31
228 0.28
229 0.32
230 0.33
231 0.31
232 0.35
233 0.36
234 0.43
235 0.47
236 0.49
237 0.5
238 0.54
239 0.57
240 0.58
241 0.62
242 0.63
243 0.58
244 0.6
245 0.56
246 0.51
247 0.44
248 0.36
249 0.27
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.2
254 0.19
255 0.17
256 0.17
257 0.21
258 0.17
259 0.22
260 0.23
261 0.29
262 0.32
263 0.35
264 0.37
265 0.39
266 0.42
267 0.41
268 0.42
269 0.35
270 0.36
271 0.34
272 0.31
273 0.27
274 0.26
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.31
281 0.34
282 0.42
283 0.48
284 0.54
285 0.63
286 0.67