Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PB01

Protein Details
Accession L0PB01    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57FNNICNTKKNQKHGSSSIKFHydrophilic
366-392DSSEDLCKKIRRNKKCLSRWLRTKVLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR010285  DNA_helicase_pif1-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
Pfam View protein in Pfam  
PF05970  PIF1  
CDD cd18037  DEXSc_Pif1_like  
Amino Acid Sequences MVNNVSSNRMISEPLKCVDASSLNIRSISITRESNSAFNNICNTKKNQKHGSSSIKFLETLSRQSKTLSTSMSLQDANDENSVDRIYIGKNDIDDNLNSDSECDESFYSWSPSSLEYQHLILPEFRNKFCSDCQLPDSISRSELSMTSCENSSCKTKMHIPLNLLETSLGSPGDSVKDMNLKVQAFHDNENCTLFSSVSGIHTALQLDEKNEKHQSFGKSCHLDKIECSSLTSEFEIKNRKRIVSDISSNSDTYGIDGIQDCKSDIRNVQKGSIGRNINRKFPGLFLSEEQKTVLRIVVEEQKSIFFTGSAGTGKSILLREIIASLRKKYSKEPDRVAITASTGLAACNIGGVTLHSYAGIGLGRDSSEDLCKKIRRNKKCLSRWLRTKVLVIDEISMVDAELFDKLENIARKLRNNENSFGGIQVIVTGDFFQLPPVPDQGKMAKFAFEAEKWKDVISHTIALTHRFSSKGSRFC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.27
4 0.27
5 0.27
6 0.27
7 0.25
8 0.28
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.27
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.28
20 0.29
21 0.31
22 0.31
23 0.32
24 0.28
25 0.27
26 0.33
27 0.33
28 0.35
29 0.36
30 0.41
31 0.47
32 0.54
33 0.61
34 0.64
35 0.68
36 0.72
37 0.76
38 0.8
39 0.74
40 0.72
41 0.66
42 0.58
43 0.5
44 0.42
45 0.41
46 0.33
47 0.38
48 0.38
49 0.36
50 0.34
51 0.36
52 0.38
53 0.34
54 0.34
55 0.28
56 0.24
57 0.26
58 0.28
59 0.29
60 0.27
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.22
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.18
109 0.2
110 0.25
111 0.28
112 0.27
113 0.29
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.35
118 0.31
119 0.3
120 0.32
121 0.32
122 0.32
123 0.33
124 0.35
125 0.27
126 0.24
127 0.21
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.19
143 0.26
144 0.34
145 0.4
146 0.41
147 0.39
148 0.41
149 0.44
150 0.41
151 0.34
152 0.25
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.11
165 0.12
166 0.14
167 0.17
168 0.16
169 0.17
170 0.19
171 0.24
172 0.21
173 0.24
174 0.25
175 0.23
176 0.23
177 0.24
178 0.22
179 0.17
180 0.16
181 0.13
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.14
196 0.14
197 0.18
198 0.23
199 0.22
200 0.23
201 0.28
202 0.32
203 0.3
204 0.34
205 0.37
206 0.37
207 0.37
208 0.41
209 0.37
210 0.32
211 0.29
212 0.31
213 0.27
214 0.22
215 0.23
216 0.18
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.14
221 0.11
222 0.14
223 0.23
224 0.23
225 0.29
226 0.3
227 0.3
228 0.29
229 0.3
230 0.33
231 0.29
232 0.34
233 0.3
234 0.32
235 0.32
236 0.31
237 0.3
238 0.24
239 0.18
240 0.13
241 0.11
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.15
253 0.21
254 0.26
255 0.27
256 0.28
257 0.31
258 0.31
259 0.33
260 0.36
261 0.32
262 0.31
263 0.4
264 0.4
265 0.42
266 0.42
267 0.4
268 0.34
269 0.31
270 0.31
271 0.23
272 0.23
273 0.18
274 0.22
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.17
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.09
283 0.08
284 0.11
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.16
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.24
314 0.27
315 0.29
316 0.35
317 0.44
318 0.48
319 0.54
320 0.57
321 0.58
322 0.6
323 0.58
324 0.52
325 0.42
326 0.34
327 0.26
328 0.21
329 0.14
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.07
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.14
356 0.16
357 0.18
358 0.25
359 0.3
360 0.38
361 0.47
362 0.56
363 0.6
364 0.68
365 0.76
366 0.8
367 0.85
368 0.88
369 0.87
370 0.87
371 0.87
372 0.86
373 0.83
374 0.75
375 0.7
376 0.63
377 0.58
378 0.5
379 0.41
380 0.34
381 0.27
382 0.24
383 0.2
384 0.15
385 0.1
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.12
395 0.15
396 0.18
397 0.26
398 0.3
399 0.37
400 0.43
401 0.52
402 0.57
403 0.58
404 0.58
405 0.55
406 0.54
407 0.48
408 0.41
409 0.32
410 0.22
411 0.17
412 0.15
413 0.11
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.12
422 0.13
423 0.15
424 0.2
425 0.21
426 0.21
427 0.25
428 0.31
429 0.3
430 0.33
431 0.32
432 0.29
433 0.28
434 0.31
435 0.32
436 0.28
437 0.33
438 0.33
439 0.36
440 0.35
441 0.35
442 0.33
443 0.3
444 0.33
445 0.3
446 0.3
447 0.26
448 0.31
449 0.32
450 0.34
451 0.35
452 0.3
453 0.28
454 0.25
455 0.27
456 0.32