Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDT4

Protein Details
Accession L0PDT4    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-401QRQANRAKKQRIERKNREAFTHydrophilic
518-542LEDEKRSDERRQKRRINELRYLIKHBasic
595-626DTSRVYHKSSRSRYTRPSPRNREPSDLRHPRHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR039726  Prp40-like  
IPR001202  WW_dom  
IPR036020  WW_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51676  FF  
PS50020  WW_DOMAIN_2  
CDD cd00201  WW  
Amino Acid Sequences MSFTISAPPWQQQGVETDENKIEAAPSVSILTSGSSLESSKWGEYKAPDGRIYWSNGKTSVWEKPDELKTEEEIEIGKLNWKEYTAPGGRKYWYNTKSGESVWNMPEACKKAIEALHAAKNQIALGQENDTTRTTNQDDERQMMLRDDALVTGPDGKTLPLVLASGWTEEKEMQNYTSLEEAETVFMKMLKRCGVGANWTWEQTMRTVIKQPQYRAIKDPIQRKLAFEKYVEEIQKQESEKEHDRLIKLKADFNRMLKSHPEIKYYTRWRVAREILDGETAFKATDNEEEKRLLFEEYIAELKRIENESEHKIKNEAMDAFSALLESLKLKPYSRWSSAQAKFREHPEFKSNPKFQVLSNLDILIVYESHIKSLERLYVDQRQANRAKKQRIERKNREAFTKLLQDLHHEKKIGPGTKWMTIYPIIKNDPRYKNMLGQPGSTPLELFWDIVEEAERDIRHKKNLACDILDEQRFDFNEKTTLSQFSDLIRKDKKGAELSDHTLSSVYDMLREKVLRRLEDEKRSDERRQKRRINELRYLIKHLKPPLHPDDTWADVRKRIEHTEEFLAVDSEENRELAFKKQMRRLREKLEAKDDTSRVYHKSSRSRYTRPSPRNREPSDLRHPRHDYYPYRDPRDPDYRTHDRDSDNESDTRYRKVLFFASLYVHCLLRSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.31
4 0.32
5 0.32
6 0.32
7 0.3
8 0.26
9 0.19
10 0.14
11 0.15
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.14
26 0.15
27 0.17
28 0.19
29 0.19
30 0.23
31 0.24
32 0.32
33 0.36
34 0.39
35 0.38
36 0.38
37 0.41
38 0.41
39 0.46
40 0.45
41 0.41
42 0.38
43 0.38
44 0.37
45 0.36
46 0.36
47 0.38
48 0.34
49 0.34
50 0.33
51 0.4
52 0.46
53 0.46
54 0.45
55 0.39
56 0.38
57 0.39
58 0.37
59 0.29
60 0.23
61 0.2
62 0.19
63 0.17
64 0.2
65 0.17
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.28
72 0.3
73 0.34
74 0.37
75 0.4
76 0.41
77 0.44
78 0.48
79 0.49
80 0.46
81 0.45
82 0.43
83 0.43
84 0.44
85 0.42
86 0.42
87 0.36
88 0.38
89 0.34
90 0.36
91 0.33
92 0.31
93 0.35
94 0.32
95 0.3
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.3
103 0.36
104 0.36
105 0.37
106 0.32
107 0.3
108 0.27
109 0.23
110 0.18
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.21
121 0.21
122 0.24
123 0.28
124 0.33
125 0.35
126 0.36
127 0.38
128 0.35
129 0.33
130 0.28
131 0.25
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.11
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.17
165 0.16
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.18
178 0.18
179 0.19
180 0.21
181 0.2
182 0.23
183 0.25
184 0.28
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.19
191 0.22
192 0.17
193 0.18
194 0.24
195 0.29
196 0.35
197 0.4
198 0.41
199 0.44
200 0.48
201 0.49
202 0.48
203 0.48
204 0.49
205 0.49
206 0.56
207 0.53
208 0.55
209 0.53
210 0.5
211 0.52
212 0.5
213 0.46
214 0.39
215 0.35
216 0.3
217 0.35
218 0.34
219 0.27
220 0.23
221 0.23
222 0.26
223 0.25
224 0.24
225 0.21
226 0.26
227 0.31
228 0.32
229 0.33
230 0.33
231 0.33
232 0.35
233 0.36
234 0.35
235 0.31
236 0.34
237 0.34
238 0.37
239 0.39
240 0.38
241 0.41
242 0.35
243 0.36
244 0.33
245 0.34
246 0.35
247 0.34
248 0.35
249 0.31
250 0.34
251 0.41
252 0.45
253 0.47
254 0.46
255 0.46
256 0.45
257 0.49
258 0.49
259 0.42
260 0.39
261 0.34
262 0.27
263 0.27
264 0.24
265 0.19
266 0.15
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.19
280 0.14
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.15
295 0.21
296 0.27
297 0.27
298 0.25
299 0.25
300 0.25
301 0.24
302 0.24
303 0.19
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.06
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.12
319 0.2
320 0.26
321 0.29
322 0.3
323 0.33
324 0.42
325 0.47
326 0.53
327 0.48
328 0.46
329 0.44
330 0.47
331 0.5
332 0.42
333 0.4
334 0.39
335 0.4
336 0.42
337 0.5
338 0.47
339 0.41
340 0.43
341 0.4
342 0.33
343 0.39
344 0.36
345 0.28
346 0.26
347 0.24
348 0.21
349 0.2
350 0.2
351 0.1
352 0.07
353 0.05
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.14
362 0.11
363 0.13
364 0.17
365 0.23
366 0.26
367 0.28
368 0.28
369 0.33
370 0.38
371 0.43
372 0.48
373 0.49
374 0.54
375 0.57
376 0.66
377 0.69
378 0.73
379 0.78
380 0.8
381 0.82
382 0.83
383 0.79
384 0.74
385 0.66
386 0.57
387 0.51
388 0.47
389 0.37
390 0.32
391 0.3
392 0.3
393 0.34
394 0.38
395 0.36
396 0.3
397 0.29
398 0.32
399 0.39
400 0.38
401 0.31
402 0.34
403 0.34
404 0.38
405 0.39
406 0.32
407 0.28
408 0.27
409 0.29
410 0.24
411 0.26
412 0.25
413 0.27
414 0.32
415 0.4
416 0.42
417 0.42
418 0.45
419 0.42
420 0.46
421 0.48
422 0.5
423 0.42
424 0.38
425 0.36
426 0.36
427 0.35
428 0.28
429 0.22
430 0.14
431 0.17
432 0.15
433 0.14
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.17
445 0.2
446 0.24
447 0.3
448 0.32
449 0.38
450 0.46
451 0.47
452 0.42
453 0.41
454 0.4
455 0.42
456 0.4
457 0.32
458 0.25
459 0.24
460 0.24
461 0.25
462 0.22
463 0.16
464 0.19
465 0.19
466 0.21
467 0.2
468 0.22
469 0.21
470 0.21
471 0.21
472 0.19
473 0.26
474 0.25
475 0.3
476 0.31
477 0.31
478 0.33
479 0.36
480 0.39
481 0.39
482 0.39
483 0.39
484 0.4
485 0.43
486 0.43
487 0.39
488 0.33
489 0.27
490 0.25
491 0.19
492 0.16
493 0.12
494 0.12
495 0.14
496 0.15
497 0.18
498 0.2
499 0.2
500 0.24
501 0.3
502 0.27
503 0.31
504 0.38
505 0.43
506 0.51
507 0.54
508 0.54
509 0.56
510 0.6
511 0.64
512 0.66
513 0.68
514 0.69
515 0.75
516 0.77
517 0.78
518 0.84
519 0.85
520 0.84
521 0.83
522 0.81
523 0.8
524 0.75
525 0.74
526 0.69
527 0.63
528 0.61
529 0.58
530 0.57
531 0.51
532 0.56
533 0.56
534 0.56
535 0.51
536 0.49
537 0.48
538 0.45
539 0.46
540 0.43
541 0.37
542 0.35
543 0.38
544 0.39
545 0.39
546 0.39
547 0.41
548 0.38
549 0.41
550 0.41
551 0.4
552 0.35
553 0.31
554 0.27
555 0.2
556 0.18
557 0.14
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.12
563 0.13
564 0.16
565 0.25
566 0.29
567 0.36
568 0.45
569 0.52
570 0.59
571 0.67
572 0.7
573 0.7
574 0.75
575 0.75
576 0.74
577 0.78
578 0.73
579 0.67
580 0.67
581 0.6
582 0.53
583 0.48
584 0.43
585 0.37
586 0.39
587 0.41
588 0.41
589 0.51
590 0.56
591 0.62
592 0.67
593 0.72
594 0.76
595 0.81
596 0.83
597 0.83
598 0.86
599 0.86
600 0.89
601 0.91
602 0.87
603 0.85
604 0.82
605 0.8
606 0.8
607 0.81
608 0.74
609 0.74
610 0.74
611 0.68
612 0.68
613 0.68
614 0.64
615 0.63
616 0.69
617 0.68
618 0.71
619 0.72
620 0.68
621 0.67
622 0.69
623 0.64
624 0.61
625 0.61
626 0.63
627 0.64
628 0.67
629 0.64
630 0.57
631 0.59
632 0.58
633 0.55
634 0.49
635 0.45
636 0.43
637 0.45
638 0.44
639 0.44
640 0.39
641 0.36
642 0.33
643 0.36
644 0.37
645 0.33
646 0.33
647 0.31
648 0.33
649 0.32
650 0.33
651 0.3
652 0.26