FuNGI

L0PCC1

Protein Details

Accession

L0PCC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-32	TSEKTQTKKLKSDNDLKPIS	Hydrophilic
116-135	TDTSKTGSDKRNKIRPKFAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
312-316	LRRQR
372-383	KEKHEKENSIRK

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013881 Pre-mRNA_splic_Prp3_dom IPR027104 Prp3 IPR010541 Prp3_C
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06544 DUF1115 PF08572 PRP3

Amino Acid Sequences

MIDTIHKRLLDETSEKTQTKKLKSDNDLKPISNGLTREEIIQKGRATQCKKIHSDNQSSEITAHTIKSDIQRRIREHDLINKSTMKLRMQINEMDDDNEFQGKGGLSVGVHPSLLTDTSKTGSDKRNKIRPKFATTMANLRSAPPQPRPKKQMEILRNPPDDFMNKYMNIYYDPRMKTKTNYNIHRFRNQKALVFNEPGKYIEQANALKAQARLEELKKRIADNAKKVGLEEELDIDKALYKEPPPDIEWWDEGLVTNKSYNDLDIGLAKIDTPDSIISFYIQHPIPIPPPFEKNQPPPKALMLTERERQKLRRQRRAEDLRIKQDKQRLGLEEPEPPKVKLSNLMKVLTSEAIKDPTRIEAMVRRQVAERKEKHEKENSIRKLTPNQKRQKLEMKKAENASRGIYCNVFRIEYLSHGQHRFKINKNAEQHSLTGVTILHPKFNLVIVEGGSKGIKRFKDLMLRRIDWTNEPNLPTIVYNNQLIKQDEQTPVNYSKNKCELVWEGELRNRNFRTWKFRNCSDDKTVKDILEKGKAYEFWNMAKSIKEQDDFAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.45
3	0.45
4	0.48
5	0.51
6	0.54
7	0.57
8	0.58
9	0.61
10	0.69
11	0.77
12	0.79
13	0.8
14	0.77
15	0.69
16	0.62
17	0.55
18	0.49
19	0.43
20	0.35
21	0.29
22	0.28
23	0.28
24	0.3
25	0.3
26	0.31
27	0.31
28	0.34
29	0.31
30	0.35
31	0.42
32	0.47
33	0.48
34	0.54
35	0.59
36	0.63
37	0.68
38	0.69
39	0.71
40	0.71
41	0.76
42	0.71
43	0.68
44	0.61
45	0.56
46	0.47
47	0.39
48	0.33
49	0.24
50	0.19
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.24
55	0.32
56	0.37
57	0.44
58	0.52
59	0.56
60	0.62
61	0.65
62	0.62
63	0.59
64	0.6
65	0.6
66	0.55
67	0.55
68	0.51
69	0.46
70	0.46
71	0.45
72	0.38
73	0.36
74	0.38
75	0.38
76	0.39
77	0.42
78	0.39
79	0.38
80	0.36
81	0.31
82	0.27
83	0.23
84	0.2
85	0.18
86	0.15
87	0.11
88	0.12
89	0.1
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.1
95	0.13
96	0.11
97	0.11
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.12
102	0.1
103	0.09
104	0.1
105	0.12
106	0.15
107	0.16
108	0.21
109	0.29
110	0.38
111	0.46
112	0.54
113	0.63
114	0.7
115	0.76
116	0.8
117	0.78
118	0.77
119	0.72
120	0.68
121	0.66
122	0.59
123	0.61
124	0.52
125	0.49
126	0.41
127	0.38
128	0.37
129	0.34
130	0.36
131	0.37
132	0.45
133	0.49
134	0.58
135	0.64
136	0.66
137	0.69
138	0.71
139	0.72
140	0.71
141	0.73
142	0.74
143	0.76
144	0.72
145	0.64
146	0.58
147	0.51
148	0.43
149	0.36
150	0.3
151	0.26
152	0.23
153	0.24
154	0.24
155	0.22
156	0.23
157	0.22
158	0.22
159	0.25
160	0.27
161	0.29
162	0.33
163	0.34
164	0.35
165	0.42
166	0.48
167	0.49
168	0.56
169	0.62
170	0.67
171	0.7
172	0.74
173	0.69
174	0.61
175	0.62
176	0.55
177	0.5
178	0.46
179	0.46
180	0.42
181	0.42
182	0.41
183	0.33
184	0.31
185	0.28
186	0.25
187	0.2
188	0.17
189	0.15
190	0.18
191	0.17
192	0.17
193	0.19
194	0.18
195	0.19
196	0.19
197	0.18
198	0.14
199	0.15
200	0.18
201	0.19
202	0.27
203	0.26
204	0.31
205	0.31
206	0.31
207	0.35
208	0.4
209	0.43
210	0.43
211	0.48
212	0.45
213	0.44
214	0.43
215	0.39
216	0.3
217	0.24
218	0.17
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.12
230	0.13
231	0.15
232	0.15
233	0.17
234	0.19
235	0.2
236	0.2
237	0.17
238	0.17
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.15
274	0.16
275	0.18
276	0.15
277	0.19
278	0.21
279	0.25
280	0.3
281	0.36
282	0.44
283	0.46
284	0.45
285	0.43
286	0.43
287	0.4
288	0.35
289	0.32
290	0.27
291	0.27
292	0.32
293	0.34
294	0.35
295	0.36
296	0.39
297	0.43
298	0.48
299	0.54
300	0.6
301	0.62
302	0.65
303	0.73
304	0.79
305	0.78
306	0.78
307	0.74
308	0.74
309	0.74
310	0.7
311	0.64
312	0.61
313	0.54
314	0.48
315	0.45
316	0.38
317	0.34
318	0.38
319	0.35
320	0.35
321	0.34
322	0.36
323	0.33
324	0.29
325	0.29
326	0.25
327	0.24
328	0.25
329	0.28
330	0.3
331	0.31
332	0.32
333	0.31
334	0.3
335	0.3
336	0.24
337	0.19
338	0.14
339	0.12
340	0.15
341	0.15
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.16
346	0.15
347	0.15
348	0.17
349	0.23
350	0.29
351	0.29
352	0.29
353	0.31
354	0.35
355	0.4
356	0.43
357	0.42
358	0.43
359	0.53
360	0.56
361	0.6
362	0.64
363	0.66
364	0.66
365	0.71
366	0.7
367	0.67
368	0.65
369	0.62
370	0.63
371	0.65
372	0.66
373	0.65
374	0.69
375	0.7
376	0.72
377	0.76
378	0.76
379	0.76
380	0.77
381	0.76
382	0.73
383	0.71
384	0.73
385	0.72
386	0.65
387	0.56
388	0.49
389	0.42
390	0.37
391	0.32
392	0.28
393	0.23
394	0.23
395	0.22
396	0.2
397	0.17
398	0.17
399	0.17
400	0.17
401	0.21
402	0.21
403	0.25
404	0.29
405	0.31
406	0.34
407	0.41
408	0.45
409	0.48
410	0.55
411	0.56
412	0.6
413	0.65
414	0.65
415	0.61
416	0.57
417	0.5
418	0.42
419	0.36
420	0.28
421	0.22
422	0.17
423	0.14
424	0.19
425	0.19
426	0.18
427	0.17
428	0.17
429	0.17
430	0.19
431	0.18
432	0.12
433	0.13
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.12
439	0.12
440	0.14
441	0.18
442	0.18
443	0.22
444	0.26
445	0.31
446	0.41
447	0.46
448	0.52
449	0.55
450	0.57
451	0.54
452	0.55
453	0.51
454	0.46
455	0.44
456	0.42
457	0.37
458	0.36
459	0.35
460	0.31
461	0.29
462	0.25
463	0.24
464	0.21
465	0.19
466	0.22
467	0.23
468	0.26
469	0.29
470	0.31
471	0.31
472	0.32
473	0.35
474	0.36
475	0.36
476	0.35
477	0.36
478	0.38
479	0.42
480	0.45
481	0.42
482	0.46
483	0.51
484	0.51
485	0.46
486	0.47
487	0.45
488	0.44
489	0.49
490	0.44
491	0.4
492	0.43
493	0.51
494	0.48
495	0.51
496	0.47
497	0.45
498	0.5
499	0.54
500	0.59
501	0.61
502	0.69
503	0.68
504	0.75
505	0.79
506	0.77
507	0.77
508	0.76
509	0.75
510	0.68
511	0.66
512	0.62
513	0.54
514	0.52
515	0.51
516	0.48
517	0.48
518	0.45
519	0.41
520	0.42
521	0.43
522	0.41
523	0.42
524	0.39
525	0.34
526	0.37
527	0.36
528	0.32
529	0.33
530	0.33
531	0.34
532	0.38
533	0.35

L0PCC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer