Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PC19

Protein Details
Accession L0PC19    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-367ESFNKPSTFREKKKISQYTDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MEKKTPNIKENTITKRPQPATRLKVVIRYLPPDLSEQTFKELVKEWIDEERVEWSSFYPGKVSSNRNKNDKYARAYIKFKSPEALIAFHKGFGAHLFTDEKGKGQRVLVEFAPFQKVPRLERQKHDARQGTIDDDAEFIAFQETLKNTNKNPEEEAQNKKEEDDMAPIGTITPLIEYLRVQKETATLKSKKKYTSEKKASAQTKADAITTQIKSQGGFGFSRKFNKNKNKSQELESPDARKESSMHPEELFPRQANSYKRIHKNPLKKDSSLTTNSSVKILKPSNRERLYDSNVFNKEKKYDSSQPTKKTESTADSSINKTENEPKKIIKKHDYTKQSSNKESKSHTESFNKPSTFREKKKISQYTDLSFISEVNELKKLRYQEMMFYEHLLMIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.7
4 0.69
5 0.68
6 0.69
7 0.67
8 0.7
9 0.71
10 0.63
11 0.65
12 0.62
13 0.61
14 0.55
15 0.52
16 0.47
17 0.42
18 0.41
19 0.37
20 0.36
21 0.32
22 0.32
23 0.28
24 0.3
25 0.32
26 0.3
27 0.29
28 0.29
29 0.29
30 0.28
31 0.28
32 0.25
33 0.28
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.23
40 0.22
41 0.17
42 0.22
43 0.24
44 0.23
45 0.2
46 0.19
47 0.25
48 0.31
49 0.39
50 0.41
51 0.5
52 0.57
53 0.64
54 0.66
55 0.68
56 0.72
57 0.71
58 0.68
59 0.68
60 0.69
61 0.67
62 0.69
63 0.64
64 0.63
65 0.59
66 0.53
67 0.46
68 0.38
69 0.37
70 0.34
71 0.34
72 0.27
73 0.29
74 0.28
75 0.25
76 0.25
77 0.19
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.1
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.18
86 0.18
87 0.19
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.26
93 0.24
94 0.27
95 0.25
96 0.25
97 0.24
98 0.23
99 0.27
100 0.22
101 0.2
102 0.23
103 0.24
104 0.25
105 0.36
106 0.44
107 0.46
108 0.51
109 0.59
110 0.64
111 0.66
112 0.71
113 0.66
114 0.58
115 0.56
116 0.51
117 0.45
118 0.36
119 0.31
120 0.22
121 0.16
122 0.14
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.08
131 0.13
132 0.17
133 0.19
134 0.2
135 0.29
136 0.32
137 0.31
138 0.34
139 0.32
140 0.35
141 0.39
142 0.46
143 0.41
144 0.41
145 0.39
146 0.36
147 0.34
148 0.28
149 0.23
150 0.19
151 0.16
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.11
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.19
170 0.22
171 0.26
172 0.29
173 0.31
174 0.37
175 0.43
176 0.47
177 0.47
178 0.5
179 0.57
180 0.59
181 0.64
182 0.67
183 0.68
184 0.68
185 0.72
186 0.69
187 0.62
188 0.55
189 0.44
190 0.37
191 0.31
192 0.27
193 0.18
194 0.17
195 0.2
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.19
202 0.18
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.18
207 0.19
208 0.26
209 0.29
210 0.33
211 0.4
212 0.51
213 0.59
214 0.63
215 0.7
216 0.71
217 0.69
218 0.7
219 0.68
220 0.63
221 0.59
222 0.52
223 0.46
224 0.4
225 0.38
226 0.32
227 0.25
228 0.21
229 0.19
230 0.25
231 0.25
232 0.26
233 0.26
234 0.28
235 0.3
236 0.32
237 0.31
238 0.22
239 0.2
240 0.21
241 0.26
242 0.27
243 0.29
244 0.34
245 0.4
246 0.48
247 0.53
248 0.61
249 0.64
250 0.71
251 0.77
252 0.79
253 0.75
254 0.68
255 0.65
256 0.59
257 0.57
258 0.51
259 0.44
260 0.39
261 0.37
262 0.36
263 0.35
264 0.31
265 0.25
266 0.29
267 0.31
268 0.32
269 0.38
270 0.46
271 0.54
272 0.57
273 0.58
274 0.56
275 0.58
276 0.59
277 0.57
278 0.51
279 0.49
280 0.51
281 0.52
282 0.49
283 0.45
284 0.41
285 0.38
286 0.39
287 0.39
288 0.43
289 0.48
290 0.56
291 0.61
292 0.66
293 0.68
294 0.69
295 0.63
296 0.57
297 0.54
298 0.49
299 0.46
300 0.42
301 0.41
302 0.39
303 0.4
304 0.39
305 0.35
306 0.3
307 0.28
308 0.34
309 0.37
310 0.41
311 0.42
312 0.46
313 0.54
314 0.61
315 0.67
316 0.67
317 0.67
318 0.7
319 0.76
320 0.79
321 0.76
322 0.79
323 0.8
324 0.78
325 0.78
326 0.77
327 0.73
328 0.7
329 0.69
330 0.66
331 0.64
332 0.62
333 0.6
334 0.6
335 0.61
336 0.62
337 0.65
338 0.6
339 0.53
340 0.54
341 0.57
342 0.59
343 0.6
344 0.63
345 0.63
346 0.69
347 0.79
348 0.82
349 0.79
350 0.78
351 0.77
352 0.71
353 0.69
354 0.6
355 0.51
356 0.41
357 0.35
358 0.27
359 0.24
360 0.21
361 0.17
362 0.23
363 0.22
364 0.24
365 0.29
366 0.31
367 0.31
368 0.38
369 0.37
370 0.39
371 0.44
372 0.46
373 0.42
374 0.41
375 0.38