FuNGI

L0PEP1

Protein Details

Accession

L0PEP1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-128	EAPYQKNTQYKERQGRNDEKNRDQDQKRKEDKESRRSSSRHSSRSRSRRNKSSSRERSRRYSRRDDHEEYKDRHGYKDDRHRDVNRRRRSHDDERDEYDSKKHRRSRSPVTRESRPP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-76	KRKEDKESRRSSSRHSSRSRSRRNKSSSRERSRRYSRRD
96-100	NRRRR
112-119	KKHRRSRS

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSDIIDVEALVEAPYQKNTQYKERQGRNDEKNRDQDQKRKEDKESRRSSSRHSSRSRSRRNKSSSRERSRRYSRRDDHEEYKDRHGYKDDRHRDVNRRRRSHDDERDEYDSKKHRRSRSPVTRESRPPVREESPKLTEDERDRRTVFVQQLAARLRTRELIAFFEKVGPVRDAQVVKDRVSGRSKGAKRLLGIPIIVQLTEAEKNRQAKAEAMLSSGGRQSDAPFHRLYVGNIHFNLTEDDLRQIFEPFGELEFVQLQKEPDTGRSRGYGFVQYRDPAQARDALEKMNGFELAGRAIRVGLGNDKFTPESTSAVLARFSGFTGSAFENKNRGGTERIGGPRDGSSSVSLDDNEAGGVSFNNISRDALMRKLAREEGKESIGLAPPKPTPAVQMTSRCVLLKNMFNPQEESGDNWIRELEDDVKAECENKYGKVLHIHVEENSPGDVYIKFDNVVAGERAIQGLNGRWFGGRTISASFLIDAVYTAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.18
4	0.24
5	0.29
6	0.38
7	0.46
8	0.56
9	0.63
10	0.72
11	0.77
12	0.81
13	0.87
14	0.87
15	0.88
16	0.86
17	0.84
18	0.84
19	0.81
20	0.82
21	0.8
22	0.78
23	0.77
24	0.79
25	0.81
26	0.77
27	0.8
28	0.81
29	0.83
30	0.85
31	0.85
32	0.82
33	0.81
34	0.77
35	0.76
36	0.77
37	0.76
38	0.75
39	0.73
40	0.75
41	0.77
42	0.85
43	0.89
44	0.88
45	0.88
46	0.89
47	0.9
48	0.9
49	0.89
50	0.9
51	0.9
52	0.9
53	0.91
54	0.87
55	0.88
56	0.89
57	0.88
58	0.86
59	0.86
60	0.84
61	0.84
62	0.86
63	0.83
64	0.81
65	0.81
66	0.81
67	0.74
68	0.73
69	0.7
70	0.62
71	0.57
72	0.56
73	0.52
74	0.52
75	0.59
76	0.6
77	0.6
78	0.66
79	0.72
80	0.75
81	0.8
82	0.8
83	0.8
84	0.79
85	0.79
86	0.8
87	0.81
88	0.82
89	0.81
90	0.8
91	0.75
92	0.73
93	0.73
94	0.66
95	0.58
96	0.55
97	0.53
98	0.52
99	0.55
100	0.57
101	0.6
102	0.68
103	0.76
104	0.8
105	0.81
106	0.83
107	0.84
108	0.83
109	0.83
110	0.8
111	0.79
112	0.76
113	0.67
114	0.61
115	0.57
116	0.56
117	0.55
118	0.54
119	0.54
120	0.5
121	0.48
122	0.47
123	0.42
124	0.41
125	0.42
126	0.45
127	0.41
128	0.42
129	0.41
130	0.41
131	0.41
132	0.42
133	0.37
134	0.32
135	0.33
136	0.29
137	0.34
138	0.35
139	0.36
140	0.3
141	0.28
142	0.25
143	0.22
144	0.22
145	0.19
146	0.17
147	0.19
148	0.21
149	0.21
150	0.2
151	0.19
152	0.19
153	0.17
154	0.18
155	0.14
156	0.12
157	0.13
158	0.17
159	0.16
160	0.17
161	0.25
162	0.25
163	0.25
164	0.31
165	0.3
166	0.3
167	0.34
168	0.34
169	0.3
170	0.37
171	0.39
172	0.41
173	0.45
174	0.43
175	0.4
176	0.44
177	0.42
178	0.34
179	0.31
180	0.23
181	0.21
182	0.18
183	0.17
184	0.11
185	0.09
186	0.09
187	0.12
188	0.13
189	0.12
190	0.16
191	0.19
192	0.2
193	0.22
194	0.21
195	0.19
196	0.21
197	0.23
198	0.19
199	0.17
200	0.17
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.12
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.15
209	0.17
210	0.19
211	0.18
212	0.18
213	0.2
214	0.21
215	0.21
216	0.2
217	0.2
218	0.2
219	0.2
220	0.21
221	0.18
222	0.18
223	0.18
224	0.13
225	0.11
226	0.09
227	0.1
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.09
247	0.09
248	0.14
249	0.18
250	0.19
251	0.19
252	0.21
253	0.21
254	0.22
255	0.23
256	0.25
257	0.21
258	0.23
259	0.24
260	0.22
261	0.22
262	0.24
263	0.23
264	0.17
265	0.16
266	0.18
267	0.18
268	0.21
269	0.2
270	0.17
271	0.18
272	0.17
273	0.17
274	0.13
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.11
288	0.12
289	0.14
290	0.14
291	0.16
292	0.16
293	0.16
294	0.17
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.14
299	0.13
300	0.14
301	0.13
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.09
310	0.1
311	0.14
312	0.15
313	0.16
314	0.19
315	0.19
316	0.21
317	0.19
318	0.2
319	0.19
320	0.19
321	0.2
322	0.24
323	0.27
324	0.27
325	0.27
326	0.26
327	0.23
328	0.23
329	0.22
330	0.16
331	0.14
332	0.13
333	0.14
334	0.14
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.1
339	0.08
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.07
346	0.07
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.11
351	0.14
352	0.15
353	0.16
354	0.22
355	0.22
356	0.23
357	0.26
358	0.31
359	0.32
360	0.34
361	0.35
362	0.32
363	0.32
364	0.31
365	0.28
366	0.25
367	0.26
368	0.25
369	0.22
370	0.21
371	0.2
372	0.22
373	0.23
374	0.2
375	0.2
376	0.22
377	0.27
378	0.29
379	0.34
380	0.36
381	0.37
382	0.38
383	0.34
384	0.3
385	0.3
386	0.29
387	0.3
388	0.31
389	0.38
390	0.4
391	0.41
392	0.43
393	0.4
394	0.39
395	0.32
396	0.32
397	0.3
398	0.31
399	0.3
400	0.27
401	0.26
402	0.22
403	0.22
404	0.22
405	0.19
406	0.17
407	0.18
408	0.19
409	0.2
410	0.2
411	0.21
412	0.18
413	0.19
414	0.18
415	0.18
416	0.23
417	0.23
418	0.26
419	0.32
420	0.34
421	0.36
422	0.37
423	0.37
424	0.33
425	0.35
426	0.32
427	0.26
428	0.24
429	0.18
430	0.14
431	0.14
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.15
439	0.14
440	0.17
441	0.15
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.14
447	0.13
448	0.12
449	0.17
450	0.21
451	0.2
452	0.21
453	0.2
454	0.21
455	0.22
456	0.24
457	0.2
458	0.18
459	0.19
460	0.21
461	0.22
462	0.22
463	0.21
464	0.17
465	0.15
466	0.13

L0PEP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer