Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDT0

Protein Details
Accession L0PDT0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-45GLLLNRQSLRRSKRSKQSRYFSSSPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 8.5, cyto_nucl 6.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027110  PDHB  
IPR029061  THDP-binding  
IPR009014  Transketo_C/PFOR_II  
IPR005475  Transketolase-like_Pyr-bd  
IPR033248  Transketolase_C  
Gene Ontology GO:0004739  F:pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) activity  
GO:0006086  P:acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate  
Pfam View protein in Pfam  
PF02779  Transket_pyr  
PF02780  Transketolase_C  
CDD cd07036  TPP_PYR_E1-PDHc-beta_like  
Amino Acid Sequences MFSISFTLRNKGIEPIKHVGLLLNRQSLRRSKRSKQSRYFSSSPSGPLEITVRDALNHALAEEMERDEKVFLLGEEVALYNGAYKVSRGLFDKFGEKRIIDAPITEAGFAGLCVGSALAGLVPVCEFMAIDHIVNSAAKTYYMSGGIQPCNITFRGPNGIGVAAGVAAQHSQDFSPWYGSIPGLKVVSPYSAEDAKGLLKAAIRDPNPVVVLENEILYGATFTLSPEAQDKDFVIPIGKAKIEKEGKDVTLVSHSICVGICLDAAKKLKEEGIDAEKKYTKVLTISSIRPMDVVAIVESIKKTNRCVAVDGAFPNFGISSEVVARIMESEAFDYLDAPVERVTGADVPMPYATALEALSFPDADVVVLAAKKTLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.44
4 0.43
5 0.41
6 0.37
7 0.35
8 0.38
9 0.37
10 0.39
11 0.39
12 0.4
13 0.46
14 0.51
15 0.54
16 0.57
17 0.61
18 0.63
19 0.72
20 0.81
21 0.87
22 0.88
23 0.89
24 0.88
25 0.87
26 0.82
27 0.75
28 0.71
29 0.63
30 0.56
31 0.5
32 0.42
33 0.33
34 0.3
35 0.28
36 0.22
37 0.22
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.11
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.1
73 0.11
74 0.14
75 0.16
76 0.18
77 0.21
78 0.23
79 0.31
80 0.29
81 0.32
82 0.33
83 0.3
84 0.29
85 0.29
86 0.3
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.17
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.02
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.13
140 0.1
141 0.11
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.1
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.15
197 0.1
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.21
229 0.24
230 0.25
231 0.28
232 0.29
233 0.29
234 0.3
235 0.29
236 0.21
237 0.2
238 0.19
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.11
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.17
256 0.16
257 0.18
258 0.18
259 0.25
260 0.29
261 0.29
262 0.33
263 0.34
264 0.34
265 0.34
266 0.29
267 0.22
268 0.19
269 0.2
270 0.22
271 0.24
272 0.26
273 0.32
274 0.32
275 0.3
276 0.28
277 0.26
278 0.2
279 0.16
280 0.14
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.17
289 0.19
290 0.25
291 0.31
292 0.31
293 0.34
294 0.36
295 0.34
296 0.36
297 0.35
298 0.31
299 0.25
300 0.23
301 0.2
302 0.15
303 0.13
304 0.11
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.1
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.09