FuNGI

L0PBM4

Protein Details

Accession

L0PBM4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
382-401	NVTSKDKKKRIQSSEQNTPV	Hydrophilic
1228-1265	DSFARSVNKRRIDKEKYLKLKKKRQNIWKERLNGKNGW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1236-1260	KRRIDKEKYLKLKKKRQNIWKERLN

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013194 HDAC_interact_dom IPR003822 PAH IPR036600 PAH_sf IPR039774 Sin3-like IPR031693 Sin3_C
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003714 F:transcription corepressor activity
Pfam	View protein in Pfam PF02671 PAH PF08295 Sin3_corepress PF16879 Sin3a_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51477 PAH
CDD	cd22541 SP5_N

Amino Acid Sequences

MGDTMRRKWRAVSTYFSTFSGICFRPNEQHGPMLPLLNMNQAPSSNTPNTGQFYAPQQSHPLSSLMTPNLPNNNSIPLGHPPPLPSSARYSLPSLHQQLPAQPPTHDSHQSHQPHTSNSMPVPQDRPNSPLGSQPPNVNIQNPVYRPLNVKDALSYLDQVKIQFSEQPDVYNRFLDIMKDFKSQSIDTLGVIERVSTLFRGHPNLVQGFNTFLPPGYRVECSLDPSDPTAIRVITPLGTMMTHSGLGSSLSTTQEGMRESWSTIQDSNIYNQPDNGISMTGKKAPVEFNHAINYVNKIKNRFSNEPDTYKRFLEILQTYQKEQRSIQDVYAEVTILFKTAPDLLDDFKQFLPENNASNSSLFAVGPRLPPVGNFAPPTVVSNVTSKDKKKRIQSSEQNTPVGQNQSKRSKHYHKPSIDLSNVSPALMPSVPEIIEPPTHASASAEELSFFDKVKKFIGNKQTYNEFLKVLNLFSQDILDKNLLVERVYNFIGVNEELMDWFKRFVGYNGKDDVIENIPAPRPKVDLMLCKAYGPSYRLLPKSETLLPCSGRDEMCWEVLNDGWVSHPTWASEDSRFVAHKKNQYEETLHKVEEERYDYDLNIEVNLRTIQLLEPIAQQISNMSNEEKNSFRLPPGLGGQSTSIYQKVLKKVYDKEQGLEVIDALHENPAVAVPIILKRLKQKDEEWKRAQREWNKIWRETEYKNFYKSLDHQGITFKSNDKKAITSRILLTEIDTLRKQQREACINHSKSKSKSQFKYEFQDQDILIDILCLLSKQLEHAPGVSINDKEKLEKFLKYFFSLFFELDQKTVANRIDTFINENSEEISVNPLEKPSSQIENTPSKKRSKDSDLLKDVLKKNRRGQGKDKSETFINGQNKDFNLENTFKNISSEKNDSIKNDINNSNILESAERATEVWIQHKKGDLTSEPISNSSTPLSQTSNVKKKRHVYNFFTNSSFYCFYRIFYMLYSRLLKIKSIEDKVVAENQAKKPNPITIELGLHVNRLSELELPVLPNVPYYQQLLGFCRKFIQNDIEQNSFEDILRYMYGINGYPFYTVDKVVSAMIKHLHSIITDTKSAEIIFLFEKDRQLAKTTPRQQIIYRVQVESILGPEESLYRIEWNDQEKTLSIQLIGKDDLTLDQAVSAEEKWSYYIDAFVMSSPTEGVASELVKPTFLKRNLPLDDEEDDENEEEEAQRTVDLIDENYVSSGLEIKICVNTYKIFFVQETEDSFARSVNKRRIDKEKYLKLKKKRQNIWKERLNGKNGWRMGLKNNEEANKLEIKINNWIKNGIINSKNENSKENKEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.58
3	0.52
4	0.45
5	0.37
6	0.33
7	0.34
8	0.28
9	0.25
10	0.26
11	0.29
12	0.35
13	0.4
14	0.45
15	0.4
16	0.45
17	0.43
18	0.46
19	0.44
20	0.38
21	0.33
22	0.29
23	0.27
24	0.27
25	0.26
26	0.21
27	0.21
28	0.2
29	0.23
30	0.24
31	0.3
32	0.26
33	0.28
34	0.29
35	0.33
36	0.36
37	0.35
38	0.32
39	0.27
40	0.32
41	0.36
42	0.35
43	0.33
44	0.34
45	0.33
46	0.34
47	0.34
48	0.28
49	0.22
50	0.23
51	0.27
52	0.24
53	0.26
54	0.26
55	0.3
56	0.36
57	0.36
58	0.36
59	0.32
60	0.34
61	0.31
62	0.3
63	0.28
64	0.27
65	0.31
66	0.32
67	0.32
68	0.29
69	0.32
70	0.37
71	0.36
72	0.31
73	0.34
74	0.36
75	0.37
76	0.38
77	0.37
78	0.35
79	0.38
80	0.44
81	0.43
82	0.43
83	0.44
84	0.43
85	0.47
86	0.52
87	0.52
88	0.45
89	0.39
90	0.39
91	0.4
92	0.44
93	0.46
94	0.4
95	0.41
96	0.49
97	0.55
98	0.54
99	0.57
100	0.53
101	0.49
102	0.51
103	0.49
104	0.44
105	0.39
106	0.43
107	0.38
108	0.39
109	0.4
110	0.42
111	0.44
112	0.41
113	0.43
114	0.4
115	0.41
116	0.37
117	0.39
118	0.39
119	0.39
120	0.4
121	0.4
122	0.39
123	0.42
124	0.43
125	0.38
126	0.36
127	0.34
128	0.39
129	0.36
130	0.38
131	0.34
132	0.35
133	0.38
134	0.37
135	0.39
136	0.33
137	0.33
138	0.29
139	0.28
140	0.28
141	0.25
142	0.24
143	0.17
144	0.2
145	0.2
146	0.19
147	0.2
148	0.18
149	0.18
150	0.19
151	0.21
152	0.24
153	0.23
154	0.27
155	0.3
156	0.34
157	0.34
158	0.31
159	0.28
160	0.24
161	0.25
162	0.23
163	0.21
164	0.21
165	0.22
166	0.25
167	0.25
168	0.26
169	0.29
170	0.27
171	0.27
172	0.26
173	0.23
174	0.19
175	0.22
176	0.2
177	0.17
178	0.16
179	0.14
180	0.1
181	0.1
182	0.11
183	0.09
184	0.1
185	0.13
186	0.17
187	0.22
188	0.23
189	0.25
190	0.29
191	0.32
192	0.31
193	0.29
194	0.26
195	0.24
196	0.23
197	0.22
198	0.16
199	0.14
200	0.14
201	0.15
202	0.17
203	0.16
204	0.17
205	0.17
206	0.22
207	0.23
208	0.26
209	0.27
210	0.26
211	0.24
212	0.25
213	0.27
214	0.22
215	0.22
216	0.2
217	0.17
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.11
241	0.13
242	0.14
243	0.14
244	0.15
245	0.15
246	0.16
247	0.2
248	0.21
249	0.2
250	0.19
251	0.2
252	0.22
253	0.22
254	0.24
255	0.25
256	0.26
257	0.24
258	0.24
259	0.24
260	0.21
261	0.2
262	0.17
263	0.13
264	0.11
265	0.13
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.17
270	0.19
271	0.22
272	0.24
273	0.3
274	0.3
275	0.29
276	0.31
277	0.31
278	0.3
279	0.27
280	0.31
281	0.3
282	0.32
283	0.33
284	0.34
285	0.38
286	0.43
287	0.51
288	0.51
289	0.49
290	0.55
291	0.57
292	0.61
293	0.63
294	0.61
295	0.56
296	0.5
297	0.45
298	0.36
299	0.31
300	0.31
301	0.27
302	0.28
303	0.33
304	0.34
305	0.36
306	0.41
307	0.42
308	0.37
309	0.35
310	0.34
311	0.32
312	0.32
313	0.31
314	0.29
315	0.27
316	0.26
317	0.25
318	0.19
319	0.13
320	0.12
321	0.1
322	0.07
323	0.07
324	0.05
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.11
331	0.15
332	0.16
333	0.17
334	0.16
335	0.18
336	0.17
337	0.18
338	0.24
339	0.22
340	0.25
341	0.25
342	0.27
343	0.26
344	0.25
345	0.24
346	0.17
347	0.15
348	0.12
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.13
357	0.19
358	0.19
359	0.2
360	0.2
361	0.19
362	0.19
363	0.2
364	0.22
365	0.17
366	0.16
367	0.14
368	0.16
369	0.18
370	0.23
371	0.28
372	0.31
373	0.39
374	0.46
375	0.51
376	0.59
377	0.66
378	0.69
379	0.74
380	0.79
381	0.78
382	0.81
383	0.79
384	0.71
385	0.6
386	0.54
387	0.47
388	0.42
389	0.37
390	0.31
391	0.35
392	0.43
393	0.46
394	0.5
395	0.55
396	0.58
397	0.65
398	0.7
399	0.72
400	0.66
401	0.68
402	0.69
403	0.67
404	0.6
405	0.52
406	0.42
407	0.38
408	0.34
409	0.29
410	0.23
411	0.16
412	0.16
413	0.14
414	0.13
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.14
430	0.15
431	0.11
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.15
440	0.17
441	0.23
442	0.24
443	0.31
444	0.41
445	0.44
446	0.45
447	0.48
448	0.5
449	0.47
450	0.48
451	0.42
452	0.32
453	0.25
454	0.25
455	0.21
456	0.18
457	0.17
458	0.14
459	0.13
460	0.12
461	0.13
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.1
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.09
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.1
477	0.1
478	0.12
479	0.1
480	0.09
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.11
492	0.2
493	0.23
494	0.26
495	0.28
496	0.28
497	0.27
498	0.27
499	0.26
500	0.18
501	0.15
502	0.12
503	0.12
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.18
511	0.19
512	0.23
513	0.26
514	0.29
515	0.28
516	0.27
517	0.27
518	0.23
519	0.22
520	0.18
521	0.16
522	0.15
523	0.2
524	0.22
525	0.24
526	0.25
527	0.23
528	0.26
529	0.3
530	0.27
531	0.25
532	0.27
533	0.26
534	0.25
535	0.26
536	0.23
537	0.18
538	0.17
539	0.17
540	0.15
541	0.15
542	0.15
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.09
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.08
556	0.1
557	0.12
558	0.12
559	0.13
560	0.13
561	0.14
562	0.15
563	0.15
564	0.21
565	0.24
566	0.3
567	0.31
568	0.34
569	0.35
570	0.37
571	0.39
572	0.35
573	0.37
574	0.32
575	0.29
576	0.26
577	0.25
578	0.24
579	0.23
580	0.23
581	0.17
582	0.18
583	0.18
584	0.18
585	0.17
586	0.17
587	0.14
588	0.11
589	0.1
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.07
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.08
601	0.08
602	0.08
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.1
611	0.11
612	0.13
613	0.13
614	0.14
615	0.15
616	0.15
617	0.14
618	0.15
619	0.15
620	0.14
621	0.16
622	0.15
623	0.13
624	0.13
625	0.13
626	0.11
627	0.12
628	0.11
629	0.08
630	0.07
631	0.1
632	0.14
633	0.18
634	0.2
635	0.22
636	0.25
637	0.29
638	0.37
639	0.43
640	0.39
641	0.35
642	0.34
643	0.32
644	0.29
645	0.24
646	0.16
647	0.08
648	0.07
649	0.06
650	0.05
651	0.04
652	0.04
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.04
660	0.05
661	0.08
662	0.09
663	0.1
664	0.17
665	0.23
666	0.26
667	0.28
668	0.33
669	0.41
670	0.5
671	0.58
672	0.6
673	0.62
674	0.63
675	0.65
676	0.67
677	0.63
678	0.62
679	0.6
680	0.63
681	0.59
682	0.58
683	0.55
684	0.52
685	0.49
686	0.43
687	0.44
688	0.42
689	0.39
690	0.39
691	0.38
692	0.34
693	0.33
694	0.33
695	0.34
696	0.31
697	0.29
698	0.27
699	0.3
700	0.31
701	0.29
702	0.27
703	0.22
704	0.21
705	0.23
706	0.26
707	0.23
708	0.25
709	0.26
710	0.33
711	0.31
712	0.28
713	0.27
714	0.26
715	0.26
716	0.23
717	0.21
718	0.18
719	0.17
720	0.17
721	0.16
722	0.17
723	0.21
724	0.22
725	0.22
726	0.21
727	0.28
728	0.33
729	0.35
730	0.41
731	0.46
732	0.47
733	0.53
734	0.54
735	0.52
736	0.48
737	0.56
738	0.57
739	0.57
740	0.59
741	0.61
742	0.66
743	0.65
744	0.69
745	0.66
746	0.6
747	0.52
748	0.5
749	0.4
750	0.32
751	0.29
752	0.21
753	0.14
754	0.1
755	0.08
756	0.05
757	0.05
758	0.04
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.05
763	0.08
764	0.09
765	0.1
766	0.1
767	0.11
768	0.12
769	0.14
770	0.14
771	0.13
772	0.12
773	0.15
774	0.15
775	0.16
776	0.17
777	0.21
778	0.22
779	0.24
780	0.25
781	0.27
782	0.29
783	0.3
784	0.3
785	0.24
786	0.26
787	0.24
788	0.23
789	0.18
790	0.19
791	0.16
792	0.16
793	0.15
794	0.11
795	0.1
796	0.14
797	0.13
798	0.11
799	0.11
800	0.13
801	0.14
802	0.14
803	0.17
804	0.15
805	0.17
806	0.15
807	0.15
808	0.14
809	0.13
810	0.13
811	0.09
812	0.1
813	0.08
814	0.09
815	0.09
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.13
820	0.13
821	0.18
822	0.17
823	0.21
824	0.25
825	0.34
826	0.39
827	0.43
828	0.45
829	0.46
830	0.5
831	0.51
832	0.53
833	0.51
834	0.55
835	0.56
836	0.62
837	0.6
838	0.58
839	0.56
840	0.57
841	0.54
842	0.55
843	0.53
844	0.5
845	0.53
846	0.58
847	0.64
848	0.63
849	0.66
850	0.68
851	0.71
852	0.7
853	0.65
854	0.61
855	0.54
856	0.49
857	0.42
858	0.39
859	0.35
860	0.32
861	0.3
862	0.3
863	0.29
864	0.3
865	0.28
866	0.22
867	0.21
868	0.21
869	0.21
870	0.22
871	0.23
872	0.21
873	0.22
874	0.22
875	0.2
876	0.23
877	0.27
878	0.27
879	0.3
880	0.32
881	0.31
882	0.36
883	0.38
884	0.35
885	0.36
886	0.34
887	0.31
888	0.31
889	0.3
890	0.24
891	0.2
892	0.18
893	0.12
894	0.11
895	0.11
896	0.09
897	0.08
898	0.08
899	0.09
900	0.12
901	0.13
902	0.2
903	0.23
904	0.24
905	0.26
906	0.3
907	0.29
908	0.27
909	0.31
910	0.25
911	0.26
912	0.27
913	0.28
914	0.24
915	0.24
916	0.25
917	0.2
918	0.2
919	0.15
920	0.14
921	0.12
922	0.14
923	0.15
924	0.17
925	0.24
926	0.33
927	0.41
928	0.49
929	0.52
930	0.57
931	0.63
932	0.71
933	0.74
934	0.73
935	0.71
936	0.74
937	0.77
938	0.73
939	0.65
940	0.56
941	0.46
942	0.42
943	0.36
944	0.25
945	0.23
946	0.2
947	0.19
948	0.22
949	0.23
950	0.18
951	0.18
952	0.22
953	0.2
954	0.24
955	0.25
956	0.22
957	0.25
958	0.25
959	0.25
960	0.23
961	0.28
962	0.31
963	0.32
964	0.33
965	0.31
966	0.32
967	0.33
968	0.35
969	0.3
970	0.26
971	0.3
972	0.34
973	0.41
974	0.41
975	0.41
976	0.39
977	0.41
978	0.4
979	0.35
980	0.34
981	0.28
982	0.29
983	0.27
984	0.29
985	0.24
986	0.22
987	0.19
988	0.15
989	0.12
990	0.11
991	0.11
992	0.09
993	0.1
994	0.11
995	0.11
996	0.12
997	0.12
998	0.13
999	0.12
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.11
1004	0.13
1005	0.14
1006	0.15
1007	0.17
1008	0.21
1009	0.29
1010	0.28
1011	0.27
1012	0.28
1013	0.29
1014	0.28
1015	0.3
1016	0.33
1017	0.31
1018	0.39
1019	0.44
1020	0.43
1021	0.41
1022	0.4
1023	0.38
1024	0.32
1025	0.25
1026	0.17
1027	0.13
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.1
1031	0.09
1032	0.09
1033	0.1
1034	0.1
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.11
1040	0.13
1041	0.13
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.12
1045	0.12
1046	0.13
1047	0.15
1048	0.12
1049	0.13
1050	0.16
1051	0.16
1052	0.16
1053	0.16
1054	0.15
1055	0.14
1056	0.17
1057	0.2
1058	0.2
1059	0.21
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.21
1063	0.21
1064	0.18
1065	0.12
1066	0.11
1067	0.1
1068	0.11
1069	0.13
1070	0.14
1071	0.16
1072	0.18
1073	0.2
1074	0.2
1075	0.24
1076	0.27
1077	0.33
1078	0.42
1079	0.49
1080	0.55
1081	0.57
1082	0.58
1083	0.56
1084	0.61
1085	0.61
1086	0.6
1087	0.54
1088	0.46
1089	0.42
1090	0.4
1091	0.38
1092	0.28
1093	0.21
1094	0.14
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.1
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.09
1102	0.1
1103	0.11
1104	0.14
1105	0.18
1106	0.22
1107	0.25
1108	0.25
1109	0.26
1110	0.24
1111	0.27
1112	0.26
1113	0.22
1114	0.19
1115	0.19
1116	0.2
1117	0.21
1118	0.21
1119	0.18
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.15
1123	0.14
1124	0.13
1125	0.09
1126	0.09
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.1
1130	0.1
1131	0.09
1132	0.08
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.1
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.11
1139	0.1
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.11
1143	0.11
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.09
1147	0.09
1148	0.08
1149	0.07
1150	0.08
1151	0.08
1152	0.09
1153	0.12
1154	0.15
1155	0.15
1156	0.16
1157	0.17
1158	0.21
1159	0.29
1160	0.31
1161	0.36
1162	0.38
1163	0.47
1164	0.5
1165	0.53
1166	0.51
1167	0.45
1168	0.44
1169	0.4
1170	0.35
1171	0.27
1172	0.25
1173	0.22
1174	0.19
1175	0.15
1176	0.13
1177	0.11
1178	0.11
1179	0.1
1180	0.09
1181	0.08
1182	0.08
1183	0.08
1184	0.1
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.11
1188	0.12
1189	0.12
1190	0.12
1191	0.12
1192	0.1
1193	0.09
1194	0.11
1195	0.1
1196	0.1
1197	0.1
1198	0.11
1199	0.14
1200	0.16
1201	0.17
1202	0.16
1203	0.19
1204	0.2
1205	0.24
1206	0.24
1207	0.23
1208	0.22
1209	0.24
1210	0.26
1211	0.25
1212	0.26
1213	0.26
1214	0.25
1215	0.24
1216	0.24
1217	0.24
1218	0.26
1219	0.3
1220	0.36
1221	0.41
1222	0.51
1223	0.56
1224	0.64
1225	0.72
1226	0.74
1227	0.78
1228	0.8
1229	0.81
1230	0.83
1231	0.87
1232	0.89
1233	0.9
1234	0.92
1235	0.9
1236	0.9
1237	0.89
1238	0.89
1239	0.9
1240	0.91
1241	0.91
1242	0.89
1243	0.89
1244	0.88
1245	0.86
1246	0.81
1247	0.77
1248	0.73
1249	0.72
1250	0.64
1251	0.6
1252	0.54
1253	0.49
1254	0.51
1255	0.54
1256	0.51
1257	0.5
1258	0.55
1259	0.54
1260	0.53
1261	0.51
1262	0.47
1263	0.42
1264	0.39
1265	0.36
1266	0.33
1267	0.32
1268	0.41
1269	0.48
1270	0.49
1271	0.46
1272	0.46
1273	0.41
1274	0.44
1275	0.45
1276	0.44
1277	0.4
1278	0.38
1279	0.44
1280	0.5
1281	0.56
1282	0.52
1283	0.54
1284	0.53

L0PBM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer